RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515697.5

FAM200B-222, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

TSL 3

Gene FAM200B, Length 607 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-222	ENST00000515697	NCAPD2	Q15021	1401 aa		27.94	■■■□□ 2.06
FAM200B-222	ENST00000515697	CASZ1	Q86V15	1759 aa		27.94	■■■□□ 2.06
FAM200B-222	ENST00000515697	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		27.94	■■■□□ 2.06
FAM200B-222	ENST00000515697	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		27.93	■■■□□ 2.06
FAM200B-222	ENST00000515697	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
FAM200B-222	ENST00000515697	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
FAM200B-222	ENST00000515697	PANK3	Q9H999	370 aa		27.92	■■■□□ 2.06
FAM200B-222	ENST00000515697	PAPPA	Q13219	1627 aa		27.92	■■■□□ 2.06
FAM200B-222	ENST00000515697	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		27.91	■■■□□ 2.06
FAM200B-222	ENST00000515697	POLK	Q9UBT6	870 aa		27.9	■■■□□ 2.06
FAM200B-222	ENST00000515697	NSD2	O96028	1365 aa		27.87	■■■□□ 2.05
FAM200B-222	ENST00000515697	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		27.87	■■■□□ 2.05
FAM200B-222	ENST00000515697	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		27.86	■■■□□ 2.05
FAM200B-222	ENST00000515697	LY75	O60449	1722 aa		27.84	■■■□□ 2.05
FAM200B-222	ENST00000515697	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
FAM200B-222	ENST00000515697	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
FAM200B-222	ENST00000515697	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
FAM200B-222	ENST00000515697	SLC15A2	Q16348	729 aa		27.82	■■■□□ 2.04
FAM200B-222	ENST00000515697	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
FAM200B-222	ENST00000515697	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		27.82	■■■□□ 2.04
FAM200B-222	ENST00000515697	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		27.81	■■■□□ 2.04
FAM200B-222	ENST00000515697	EYA1	Q99502	592 aa		27.8	■■■□□ 2.04
FAM200B-222	ENST00000515697	STK32B	Q9NY57	414 aa		27.8	■■■□□ 2.04
FAM200B-222	ENST00000515697	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		27.79	■■■□□ 2.04
FAM200B-222	ENST00000515697	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		27.79	■■■□□ 2.04
FAM200B-222	ENST00000515697	SPON1	Q9HCB6	807 aa		27.79	■■■□□ 2.04
FAM200B-222	ENST00000515697	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		27.78	■■■□□ 2.04
FAM200B-222	ENST00000515697	CYP27B1	O15528	508 aa		27.78	■■■□□ 2.04
FAM200B-222	ENST00000515697	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
FAM200B-222	ENST00000515697	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
FAM200B-222	ENST00000515697	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		27.75	■■■□□ 2.03
FAM200B-222	ENST00000515697	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		27.75	■■■□□ 2.03
FAM200B-222	ENST00000515697	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
FAM200B-222	ENST00000515697	ITGB4	P16144	1822 aa		27.75	■■■□□ 2.03
FAM200B-222	ENST00000515697	ZNF827	Q17R98	1081 aa		27.74	■■■□□ 2.03
FAM200B-222	ENST00000515697	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
FAM200B-222	ENST00000515697	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		27.72	■■■□□ 2.03
FAM200B-222	ENST00000515697	AKT1S1	Q96B36	256 aa		27.72	■■■□□ 2.03
FAM200B-222	ENST00000515697	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		27.72	■■■□□ 2.03
FAM200B-222	ENST00000515697	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
FAM200B-222	ENST00000515697	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	27.71	■■■□□ 2.03
FAM200B-222	ENST00000515697	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		27.71	■■■□□ 2.03
FAM200B-222	ENST00000515697	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		27.7	■■■□□ 2.03
FAM200B-222	ENST00000515697	PTGER2	P43116	358 aa		27.7	■■■□□ 2.02
FAM200B-222	ENST00000515697	MORC1	Q86VD1	984 aa		27.7	■■■□□ 2.02
FAM200B-222	ENST00000515697	ZBTB7A	O95365	584 aa		27.69	■■■□□ 2.02
FAM200B-222	ENST00000515697	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
FAM200B-222	ENST00000515697	SPG7	Q9UQ90	795 aa		27.67	■■■□□ 2.02
FAM200B-222	ENST00000515697	KCNQ4	P56696	695 aa		27.66	■■■□□ 2.02
FAM200B-222	ENST00000515697	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		27.66	■■■□□ 2.02
FAM200B-222	ENST00000515697	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		27.65	■■■□□ 2.02
FAM200B-222	ENST00000515697	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		27.64	■■■□□ 2.02
FAM200B-222	ENST00000515697	MTFR1L	Q9H019	292 aa		27.64	■■■□□ 2.02
FAM200B-222	ENST00000515697	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
FAM200B-222	ENST00000515697	C5	P01031	1676 aa		27.62	■■■□□ 2.01
FAM200B-222	ENST00000515697	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
FAM200B-222	ENST00000515697	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
FAM200B-222	ENST00000515697	PHKG2	P15735	406 aa		27.61	■■■□□ 2.01
FAM200B-222	ENST00000515697	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		27.61	■■■□□ 2.01
FAM200B-222	ENST00000515697	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		27.6	■■■□□ 2.01
FAM200B-222	ENST00000515697	PALLD	Q8WX93	1383 aa		27.6	■■■□□ 2.01
FAM200B-222	ENST00000515697	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		27.59	■■■□□ 2.01
FAM200B-222	ENST00000515697	PIGB	Q92521	554 aa		27.59	■■■□□ 2.01
FAM200B-222	ENST00000515697	IL13	P35225	146 aa		27.57	■■■□□ 2
FAM200B-222	ENST00000515697	KDR	P35968	1356 aa		27.57	■■■□□ 2
FAM200B-222	ENST00000515697	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		27.57	■■■□□ 2
FAM200B-222	ENST00000515697	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		27.56	■■■□□ 2
FAM200B-222	ENST00000515697	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		27.55	■■■□□ 2
FAM200B-222	ENST00000515697	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		27.54	■■■□□ 2
FAM200B-222	ENST00000515697	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
FAM200B-222	ENST00000515697	C4B	P0C0L5	1744 aa		27.52	■■■□□ 2
FAM200B-222	ENST00000515697	MTHFS	P49914	203 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		27.5	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		27.49	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		27.49	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		27.49	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		27.48	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	MAP3K5	Q99683	1374 aa		27.48	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	27.47	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	DCAF5	Q96JK2	942 aa		27.47	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	ARX	Q96QS3	562 aa		27.47	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	27.47	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	27.46	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		27.46	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	27.46	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	27.46	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	SYT17	Q9BSW7	474 aa		27.46	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	UTRN	P46939	3433 aa		27.46	■■□□□ 1.99
FAM200B-222	ENST00000515697	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		27.45	■■□□□ 1.98
FAM200B-222	ENST00000515697	SIK1	P57059	783 aa		27.45	■■□□□ 1.98
FAM200B-222	ENST00000515697	ATG3	Q9NT62	314 aa		27.45	■■□□□ 1.98
FAM200B-222	ENST00000515697	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		27.45	■■□□□ 1.98
FAM200B-222	ENST00000515697	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		27.44	■■□□□ 1.98
FAM200B-222	ENST00000515697	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		27.43	■■□□□ 1.98
FAM200B-222	ENST00000515697	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		27.42	■■□□□ 1.98
FAM200B-222	ENST00000515697	ITPK1	Q13572	414 aa		27.41	■■□□□ 1.98

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