RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 USP4Q13107 963 aa12.92□□□□□ -0.34
PGGT1B-205ENST00000514178 SEPT12Q8IYM1 358 aa12.92□□□□□ -0.34
PGGT1B-205ENST00000514178 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
PGGT1B-205ENST00000514178 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
PGGT1B-205ENST00000514178 TAS1R3Q7RTX0 852 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC125Q86Z20 511 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-205ENST00000514178 LGR5O75473 907 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB15P59190 212 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-205ENST00000514178 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-205ENST00000514178 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
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PGGT1B-205ENST00000514178 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-205ENST00000514178 HINFPQ9BQA5 517 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-205ENST00000514178 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PGGT1B-205ENST00000514178 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PGGT1B-205ENST00000514178 MARSP56192 900 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PGGT1B-205ENST00000514178 EGFL7Q9UHF1 273 aa12.85□□□□□ -0.35
PGGT1B-205ENST00000514178 ABL1P00519 1130 aa12.84□□□□□ -0.35
PGGT1B-205ENST00000514178 MYCP01106 439 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PGGT1B-205ENST00000514178 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
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PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 M0R2N6 131 aa12.82□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 SCTRP47872 440 aa12.82□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM32Q13049 653 aa12.82□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 H3BRB1 525 aa12.81□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 WEE1P30291 646 aa12.81□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP12.81□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ANO2Q9NQ90 1003 aa12.81□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa12.81□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ERVH48-1M5A8F1 160 aa12.8□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 VARSP26640 1264 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 SKOR1P84550 965 aa12.8□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 MKNK1Q9BUB5 465 aa12.8□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 SEPT3Q9UH03 358 aa12.8□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ICMTO60725 284 aa12.79□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 PLA2G2CQ5R387 149 aa12.79□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF358Q9NW07 568 aa12.79□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF223E7ERA6 249 aa12.78□□□□□ -0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
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PGGT1B-205ENST00000514178 WNT7BP56706 349 aa12.77□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 ERVK-9P63128 1117 aa12.77□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 GLYCTKQ8IVS8 523 aa12.77□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 CAPN12Q6ZSI9 719 aa12.76□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKRD33BA6NCL7 494 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM229AB2RXF0 380 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 C21orf2O43822 256 aa12.75□□□□□ -0.37
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PGGT1B-205ENST00000514178 KCNC4Q03721 635 aa12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa12.74□□□□□ -0.37
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PGGT1B-205ENST00000514178 GAS2L2Q8NHY3 880 aa12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 BCL2L13Q9BXK5 485 aa12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 OSBPL3Q9H4L5 887 aa12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 SCNN1DP51172 638 aa12.73□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 STAU1O95793 577 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 IGFBP4P22692 258 aa12.72□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 MTMR3Q13615 1198 aa12.72□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 ARID5BQ14865 1188 aa12.72□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 ECM1Q16610 540 aa12.72□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 EHBP1Q8NDI1 1231 aa12.72□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 FSHRP23945 695 aa12.71□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 GDF10P55107 478 aa12.71□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP12.71□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 COL26A1Q96A83 441 aa12.71□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 CYLDQ9NQC7 956 aa12.71□□□□□ -0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa12.71□□□□□ -0.37
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PGGT1B-205ENST00000514178 GIPC2Q8TF65 315 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 CDK15Q96Q40 435 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 WASLO00401 505 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 FOXO3O43524 673 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 MAPK1P28482 360 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 RPIAP49247 311 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 TNS4Q8IZW8 715 aa12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 BACH1O14867 736 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 GRM5P41594 1212 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 ARHGAP4P98171 946 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 CDAN1Q8IWY9 1227 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 DCTN4Q9UJW0 460 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 HELQQ8TDG4 1101 aa12.67□□□□□ -0.38
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