RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAP3K5Q99683 1374 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RGPD5Q99666 1765 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AKAP4Q5JQC9 854 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BABAM1Q9NWV8 329 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CERKQ8TCT0 537 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 WDR17Q8IZU2 1322 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COL18A1P39060 1754 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NCAPD2Q15021 1401 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MCM10Q7L590 875 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PPP4R2Q9NY27 417 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ABCA3Q99758 1704 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM83GA6ND36 823 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF853P0CG23 659 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TEFQ10587 303 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ALDH1L2Q3SY69 923 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RGPD2P0DJD1 1756 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 STRN4Q9NRL3 753 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MBIPQ9NS73 344 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TSPYL4Q9UJ04 414 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CHL1O00533 1208 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RARSP54136 660 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DCTN1Q14203 1278 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SMC4Q9NTJ3 1288 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LMO7Q8WWI1 1683 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PDE3AQ14432 1141 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IFNL2Q8IZJ0 200 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BTG4Q9NY30 223 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KIF16BQ96L93 1317 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 JCADQ9P266 1359 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IL2RBP14784 551 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AAMPQ13685 434 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BCAR3O75815 825 aa15.65■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CRB1P82279 1406 aa15.65■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IL17REQ8NFR9 667 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RNMTO43148 476 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PLIN1O60240 522 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ADAMTS2O95450 1211 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DCAF5Q96JK2 942 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BTBD11A6QL63 1104 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 VAMP4O75379 141 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 STK31Q9BXU1 1019 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PHKG2P15735 406 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SSH1Q8WYL5 1049 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC30Q5VVM6 783 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ARHGAP45Q92619 1136 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LRRC37A3O60309 1634 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HOXB7P09629 217 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C8orf58Q8NAV2 365 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BCL2L13Q9BXK5 485 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 USP35Q9P2H5 1018 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CABP4P57796 275 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NGLY1Q96IV0 654 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CRBNQ96SW2 442 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LGR6Q9HBX8 967 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MIS18AQ9NYP9 233 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms