RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510021.5

UBE2B-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 415 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-207ENST00000510021 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2B-207ENST00000510021 C5P01031 1676 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2B-207ENST00000510021 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2B-207ENST00000510021 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2B-207ENST00000510021 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.64■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 SOX12O15370 315 aa22.64■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.64■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.64■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 ERBB3P21860 1342 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.6■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 RRAGCQ9HB90 399 aa22.58■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.58■■□□□ 1.21
UBE2B-207ENST00000510021 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.57■■□□□ 1.2
UBE2B-207ENST00000510021 BCS1LQ9Y276 419 aa22.57■■□□□ 1.2
UBE2B-207ENST00000510021 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
UBE2B-207ENST00000510021 CABP2Q9NPB3 220 aa22.56■■□□□ 1.2
UBE2B-207ENST00000510021 CABP1Q9NZU7 370 aa22.56■■□□□ 1.2
UBE2B-207ENST00000510021 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.56■■□□□ 1.2
UBE2B-207ENST00000510021 USP47Q96K76 1375 aa22.55■■□□□ 1.2
UBE2B-207ENST00000510021 FOXN1O15353 648 aa22.55■■□□□ 1.2
UBE2B-207ENST00000510021 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
UBE2B-207ENST00000510021 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
UBE2B-207ENST00000510021 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.53■■□□□ 1.2
UBE2B-207ENST00000510021 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.53■■□□□ 1.2
UBE2B-207ENST00000510021 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.53■■□□□ 1.2
UBE2B-207ENST00000510021 C4BP0C0L5 1744 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2B-207ENST00000510021 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2B-207ENST00000510021 ABHD8Q96I13 439 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2B-207ENST00000510021 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
UBE2B-207ENST00000510021 LTN1O94822 1766 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2B-207ENST00000510021 SMIM5Q71RC9 77 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2B-207ENST00000510021 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2B-207ENST00000510021 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.48■■□□□ 1.19
UBE2B-207ENST00000510021 TGFB2P61812 414 aa22.48■■□□□ 1.19
UBE2B-207ENST00000510021 A0A0G2JLW4 131 aa22.47■■□□□ 1.19
UBE2B-207ENST00000510021 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
UBE2B-207ENST00000510021 RGS19P49795 217 aa22.46■■□□□ 1.19
UBE2B-207ENST00000510021 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.46■■□□□ 1.19
UBE2B-207ENST00000510021 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
UBE2B-207ENST00000510021 FCHSD2O94868 740 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2B-207ENST00000510021 PHF14O94880 888 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2B-207ENST00000510021 AK7Q96M32 723 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2B-207ENST00000510021 STAC3Q96MF2 364 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2B-207ENST00000510021 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
UBE2B-207ENST00000510021 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.44■■□□□ 1.18
UBE2B-207ENST00000510021 RNF181Q9P0P0 153 aa22.44■■□□□ 1.18
UBE2B-207ENST00000510021 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
UBE2B-207ENST00000510021 SBF1O95248 1867 aa22.42■■□□□ 1.18
UBE2B-207ENST00000510021 PALLDQ8WX93 1383 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2B-207ENST00000510021 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
UBE2B-207ENST00000510021 MMP10P09238 476 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2B-207ENST00000510021 DPEP1P16444 411 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2B-207ENST00000510021 SSFA2P28290 1259 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
UBE2B-207ENST00000510021 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2B-207ENST00000510021 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
UBE2B-207ENST00000510021 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
UBE2B-207ENST00000510021 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
UBE2B-207ENST00000510021 AIDAQ96BJ3 306 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2B-207ENST00000510021 CREBZFQ9NS37 354 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2B-207ENST00000510021 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
UBE2B-207ENST00000510021 LBX1P52954 281 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2B-207ENST00000510021 USP31Q70CQ4 1352 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2B-207ENST00000510021 DCAF5Q96JK2 942 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2B-207ENST00000510021 KCNA3P22001 575 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2B-207ENST00000510021 MEGF6O75095 1541 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2B-207ENST00000510021 CNTNAP1P78357 1384 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2B-207ENST00000510021 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
UBE2B-207ENST00000510021 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2B-207ENST00000510021 WBP1LQ9NX94 342 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2B-207ENST00000510021 C4AP0C0L4 1744 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2B-207ENST00000510021 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2B-207ENST00000510021 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBE2B-207ENST00000510021 GLTPD2A6NH11 291 aa22.29■■□□□ 1.16
UBE2B-207ENST00000510021 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
UBE2B-207ENST00000510021 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBE2B-207ENST00000510021 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.28■■□□□ 1.16
UBE2B-207ENST00000510021 PIM2Q9P1W9 311 aa22.28■■□□□ 1.16
UBE2B-207ENST00000510021 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
UBE2B-207ENST00000510021 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
UBE2B-207ENST00000510021 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.27■■□□□ 1.16
UBE2B-207ENST00000510021 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.27■■□□□ 1.16
UBE2B-207ENST00000510021 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
UBE2B-207ENST00000510021 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.27■■□□□ 1.16
UBE2B-207ENST00000510021 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
UBE2B-207ENST00000510021 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
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