RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505685.1

ZBED3-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ZBED3, Length 432 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-202ENST00000505685 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 NCAPD2Q15021 1401 aa12.62□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 TRIM37O94972 964 aa12.62□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 MTHFSP49914 203 aa12.62□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 FAM182BQ5T319 152 aa12.62□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 EYA1Q99502 592 aa12.62□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP12.62□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 WNK3Q9BYP7 1800 aa12.62□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 LRRC37A3O60309 1634 aa12.62□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 PARD3Q8TEW0 1356 aa12.61□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 IGSF1Q8N6C5 1336 aa12.61□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 USHBP1Q8N6Y0 703 aa12.6□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 SPG7Q9UQ90 795 aa12.6□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 APBA3O96018 575 aa12.59□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 IL13P35225 146 aa12.59□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 CFAP53Q96M91 514 aa12.59□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 FOXD4L1Q9NU39 408 aa12.59□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa12.59□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa12.59□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 MEGF6O75095 1541 aa12.58□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 RGPD1P0DJD0 1748 aa12.58□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 PLSCR1O15162 318 aa12.57□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 RALBP1Q15311 655 aa12.57□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 AMOTQ4VCS5 1084 aa12.57□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 DEFB132Q7Z7B7 95 aa12.57□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 CAMKK2Q96RR4 588 aa12.56□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 NUDCQ9Y266 331 aa12.56□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 KDRP35968 1356 aa12.56□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 PPP2R1AP30153 589 aa12.55□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 RGPD2P0DJD1 1756 aa12.55□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 SULT6B1Q6IMI4 303 aa12.54□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 IFNL2Q8IZJ0 200 aa12.54□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
ZBED3-202ENST00000505685 CYP27B1O15528 508 aa12.52□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 KCNQ2O43526 872 aa12.52□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 CAPN15O75808 1086 aa12.52□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 ACSBG1Q96GR2 724 aa12.52□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 KAT6BQ8WYB5 2073 aa12.52□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 NBPF14Q5TI25 921 aa12.51□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 SBF2Q86WG5 1849 aa12.51□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 PHKG2P15735 406 aa12.5□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 AEBP1Q8IUX7 1158 aa12.5□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 PKD1L3Q7Z443 1732 aa12.5□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa12.49□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 NHSQ6T4R5 1651 aa12.49□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 C1orf141Q5JVX7 400 aa12.49□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 DCAF5Q96JK2 942 aa12.49□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 ERVV-2B6SEH9 535 aa12.48□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 FCHSD2O94868 740 aa12.48□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 TXNRD1Q16881 649 aa12.48□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 SLC27A3Q5K4L6 730 aa12.48□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 PTF1AQ7RTS3 328 aa12.48□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 HMOX1P09601 288 aa12.47□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 AKAP4Q5JQC9 854 aa12.47□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 GAS2L2Q8NHY3 880 aa12.47□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 SHANK3Q9BYB0 1731 aa12.47□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP12.46□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 TMOD3Q9NYL9 352 aa12.46□□□□□ -0.41
ZBED3-202ENST00000505685 NEFMP07197 916 aa12.45□□□□□ -0.42
ZBED3-202ENST00000505685 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa12.45□□□□□ -0.42
ZBED3-202ENST00000505685 PROM2Q8N271 834 aa12.45□□□□□ -0.42
ZBED3-202ENST00000505685 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
ZBED3-202ENST00000505685 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa12.45□□□□□ -0.42
ZBED3-202ENST00000505685 RSPH6AQ9H0K4 717 aa12.44□□□□□ -0.42
ZBED3-202ENST00000505685 RREB1Q92766 1687 aa12.43□□□□□ -0.42
ZBED3-202ENST00000505685 PIGBQ92521 554 aa12.43□□□□□ -0.42
ZBED3-202ENST00000505685 STK32BQ9NY57 414 aa12.43□□□□□ -0.42
ZBED3-202ENST00000505685 DOT1LQ8TEK3 1739 aa12.42□□□□□ -0.42
ZBED3-202ENST00000505685 BTAF1O14981 1849 aa12.42□□□□□ -0.42
ZBED3-202ENST00000505685 PRKAR2BP31323 418 aa12.42□□□□□ -0.42
ZBED3-202ENST00000505685 CABP4P57796 275 aa12.42□□□□□ -0.42
ZBED3-202ENST00000505685 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
ZBED3-202ENST00000505685 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
ZBED3-202ENST00000505685 DSG3P32926 999 aa12.41□□□□□ -0.42
ZBED3-202ENST00000505685 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.9 ms