RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504624.1

PDE4D-211, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 300 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-211ENST00000504624 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 FOXK2Q01167 660 aa5.11□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 NBPF20Q3BBV1 942 aa5.11□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 BANK1Q8NDB2 785 aa5.11□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 TRIM52Q96A61 297 aa5.11□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 CYLDQ9NQC7 956 aa5.11□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 SLC35F4A4IF30 521 aa5.1□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 GPR37L1O60883 481 aa5.1□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 LILRA1O75019 489 aa5.1□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 SLURP2P0DP57 97 aa5.1□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 FOXR1Q6PIV2 292 aa5.1□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 WHAMMQ8TF30 809 aa5.1□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 ADAMTS2O95450 1211 aa5.09□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 PODNQ7Z5L7 613 aa5.09□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa5.09□□□□□ -1.59
PDE4D-211ENST00000504624 ESPNB1AK53 854 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 NR1H3Q13133 447 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 TSGA10IPQ3SY00 556 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 RNF217Q8TC41 542 aa5.08□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 PHF20L1A8MW92 1017 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 GDPD2Q9HCC8 539 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa5.07□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 ARHGEF15O94989 841 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 ADH1AP07327 375 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 PTGIRP43119 386 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 SCTRP47872 440 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 IRF5Q13568 498 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 GALNT6Q8NCL4 622 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 NEDD1Q8NHV4 660 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 MSTNO14793 375 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 RHOQP17081 205 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 ABL2P42684 1182 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 LYPD4Q6UWN0 246 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 TRERF1Q96PN7 1200 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 CEP126Q9P2H0 1117 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 MEN1O00255 615 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 VAC14Q08AM6 782 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 H7C1W4 665 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 GMCL1Q96IK5 515 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 MBIPQ9NS73 344 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-211ENST00000504624 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 A0A1W2PRU2 124 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 STAU1O95793 577 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 SLC27A3Q5K4L6 730 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 SEPT12Q8IYM1 358 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 NLRP3Q96P20 1036 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 RAB6BQ9NRW1 208 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 GPR25O00155 361 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 POU4F2Q12837 409 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 GAS6Q14393 721 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 RNF20Q5VTR2 975 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 TRIM22Q8IYM9 498 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 POM121Q96HA1 1249 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 OSBPL3Q9H4L5 887 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 IGF1RP08069 1367 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 BCRP11274 1271 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 ERVK-9P63128 1117 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 DCAF5Q96JK2 942 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 SPOCK3Q9BQ16 436 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 APBB1O00213 710 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 MCM6Q14566 821 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 PHTF2Q8N3S3 785 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 PRM3Q9NNZ6 103 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 SOCS7O14512 581 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 MX2P20592 715 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 PHKA2P46019 1235 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 TMEM132AQ24JP5 1023 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 OXLD1Q5BKU9 147 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 COG6Q9Y2V7 657 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 DYRK1BQ9Y463 629 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 PIK3CDO00329 1044 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 TRAK2O60296 914 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 ADAM23O75077 832 aa4.97□□□□□ -1.61
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