RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BANK1Q8NDB2 785 aa8.55□□□□□ -1.04
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.54□□□□□ -1.04
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.54□□□□□ -1.04
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa8.54□□□□□ -1.04
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 INSRP06213 1382 aa8.53□□□□□ -1.04
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 VWDEQ8N2E2 1590 aa8.53□□□□□ -1.04
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SULF1Q8IWU6 871 aa8.53□□□□□ -1.04
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.53□□□□□ -1.04
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SPTLC1O15269 473 aa8.52□□□□□ -1.04
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PTPREP23469 700 aa8.52□□□□□ -1.04
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TATDN2Q93075 761 aa8.52□□□□□ -1.04
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IGHDP01880 384 aa8.52□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.52□□□□□ -1.05
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 REREQ9P2R6 1566 aa8.51□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.51□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NBPF26B4DH59 902 aa8.51□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PROX2Q3B8N5 592 aa8.51□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UGGT1Q9NYU2 1555 aa8.51□□□□□ -1.05
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.48□□□□□ -1.05
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CEP152O94986 1710 aa8.48□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LILRB3O75022 631 aa8.48□□□□□ -1.05
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa8.48□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.48□□□□□ -1.05
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NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM132EQ6IEE7 984 aa8.47□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NECTIN2Q92692 538 aa8.47□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KCNK17Q96T54 332 aa8.47□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ERVK-7P63135 1459 aa8.47□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SYNMO15061 1565 aa8.47□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GGT6Q6P531 493 aa8.47□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 WWC1Q8IX03 1113 aa8.47□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ABCC3O15438 1527 aa8.46□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EFCAB6Q5THR3 1501 aa8.46□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 E9PSI1 815 aa8.46□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KDM4AO75164 1064 aa8.46□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BCL2L13Q9BXK5 485 aa8.46□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa8.46□□□□□ -1.05
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADAMTSL3P82987 1691 aa8.46□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 USP35Q9P2H5 1018 aa8.46□□□□□ -1.06
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 POM121CA8CG34 1229 aa8.45□□□□□ -1.06
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