RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, human

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HOXB3-212	ENST00000498678	RGPD5	Q99666	1765 aa		33.56	■■■□□ 2.96
HOXB3-212	ENST00000498678	ERBB3	P21860	1342 aa		33.56	■■■□□ 2.96
HOXB3-212	ENST00000498678	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		33.55	■■■□□ 2.96
HOXB3-212	ENST00000498678	COL18A1	P39060	1754 aa		33.55	■■■□□ 2.96
HOXB3-212	ENST00000498678	CHL1	O00533	1208 aa		33.55	■■■□□ 2.96
HOXB3-212	ENST00000498678	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		33.55	■■■□□ 2.96
HOXB3-212	ENST00000498678	CPD	O75976	1380 aa		33.54	■■■□□ 2.96
HOXB3-212	ENST00000498678	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		33.54	■■■□□ 2.96
HOXB3-212	ENST00000498678	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		33.53	■■■□□ 2.96
HOXB3-212	ENST00000498678	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		33.53	■■■□□ 2.96
HOXB3-212	ENST00000498678	VAMP4	O75379	141 aa		33.53	■■■□□ 2.96
HOXB3-212	ENST00000498678	ZNF428	Q96B54	188 aa		33.53	■■■□□ 2.96
HOXB3-212	ENST00000498678	TSPYL6	Q8N831	410 aa		33.52	■■■□□ 2.96
HOXB3-212	ENST00000498678	KIAA0232	Q92628	1395 aa		33.51	■■■□□ 2.96
HOXB3-212	ENST00000498678	MAP3K5	Q99683	1374 aa		33.51	■■■□□ 2.95
HOXB3-212	ENST00000498678	ABCC6	O95255	1503 aa		33.5	■■■□□ 2.95
HOXB3-212	ENST00000498678	CHRNA2	Q15822	529 aa		33.5	■■■□□ 2.95
HOXB3-212	ENST00000498678	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		33.5	■■■□□ 2.95
HOXB3-212	ENST00000498678	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		33.49	■■■□□ 2.95
HOXB3-212	ENST00000498678	PANK1	Q8TE04	598 aa		33.48	■■■□□ 2.95
HOXB3-212	ENST00000498678	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		33.48	■■■□□ 2.95
HOXB3-212	ENST00000498678	TNN	Q9UQP3	1299 aa		33.47	■■■□□ 2.95
HOXB3-212	ENST00000498678	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	33.46	■■■□□ 2.95
HOXB3-212	ENST00000498678	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		33.45	■■■□□ 2.95
HOXB3-212	ENST00000498678	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		33.45	■■■□□ 2.95
HOXB3-212	ENST00000498678	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	33.45	■■■□□ 2.95
HOXB3-212	ENST00000498678	LRRC37A3	O60309	1634 aa		33.45	■■■□□ 2.94
HOXB3-212	ENST00000498678	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
HOXB3-212	ENST00000498678	RLBP1	P12271	317 aa		33.43	■■■□□ 2.94
HOXB3-212	ENST00000498678	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
HOXB3-212	ENST00000498678	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		33.43	■■■□□ 2.94
HOXB3-212	ENST00000498678	COG6	Q9Y2V7	657 aa		33.43	■■■□□ 2.94
HOXB3-212	ENST00000498678	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		33.42	■■■□□ 2.94
HOXB3-212	ENST00000498678	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		33.41	■■■□□ 2.94
HOXB3-212	ENST00000498678	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
HOXB3-212	ENST00000498678	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		33.4	■■■□□ 2.94
HOXB3-212	ENST00000498678	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		33.39	■■■□□ 2.94
HOXB3-212	ENST00000498678	KIF16B	Q96L93	1317 aa		33.39	■■■□□ 2.94
HOXB3-212	ENST00000498678	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		33.39	■■■□□ 2.94
HOXB3-212	ENST00000498678	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		33.39	■■■□□ 2.94
HOXB3-212	ENST00000498678	ABCA3	Q99758	1704 aa		33.39	■■■□□ 2.94
HOXB3-212	ENST00000498678	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		33.38	■■■□□ 2.93
HOXB3-212	ENST00000498678	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
HOXB3-212	ENST00000498678	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
HOXB3-212	ENST00000498678	KRT24	Q2M2I5	525 aa		33.38	■■■□□ 2.93
HOXB3-212	ENST00000498678	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		33.38	■■■□□ 2.93
HOXB3-212	ENST00000498678	TRIM27	P14373	513 aa		33.37	■■■□□ 2.93
HOXB3-212	ENST00000498678	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		33.37	■■■□□ 2.93
HOXB3-212	ENST00000498678	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
HOXB3-212	ENST00000498678	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
HOXB3-212	ENST00000498678	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		33.36	■■■□□ 2.93
HOXB3-212	ENST00000498678	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
HOXB3-212	ENST00000498678	MS4A1	P11836	297 aa		33.36	■■■□□ 2.93
HOXB3-212	ENST00000498678	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
HOXB3-212	ENST00000498678	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
HOXB3-212	ENST00000498678	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
HOXB3-212	ENST00000498678	LGR6	Q9HBX8	967 aa		33.33	■■■□□ 2.93
HOXB3-212	ENST00000498678	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		33.33	■■■□□ 2.93
HOXB3-212	ENST00000498678	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	33.33	■■■□□ 2.93
HOXB3-212	ENST00000498678	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		33.33	■■■□□ 2.93
HOXB3-212	ENST00000498678	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
HOXB3-212	ENST00000498678	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		33.3	■■■□□ 2.92
HOXB3-212	ENST00000498678	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
HOXB3-212	ENST00000498678	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
HOXB3-212	ENST00000498678	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		33.28	■■■□□ 2.92
HOXB3-212	ENST00000498678	AAMP	Q13685	434 aa		33.27	■■■□□ 2.92
HOXB3-212	ENST00000498678	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		33.27	■■■□□ 2.92
HOXB3-212	ENST00000498678	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		33.27	■■■□□ 2.92
HOXB3-212	ENST00000498678	MEGF6	O75095	1541 aa		33.27	■■■□□ 2.92
HOXB3-212	ENST00000498678	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.92
HOXB3-212	ENST00000498678	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
HOXB3-212	ENST00000498678	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		33.25	■■■□□ 2.91
HOXB3-212	ENST00000498678	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	33.25	■■■□□ 2.91
HOXB3-212	ENST00000498678	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		33.25	■■■□□ 2.91
HOXB3-212	ENST00000498678	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		33.23	■■■□□ 2.91
HOXB3-212	ENST00000498678	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		33.22	■■■□□ 2.91
HOXB3-212	ENST00000498678	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		33.22	■■■□□ 2.91
HOXB3-212	ENST00000498678	SPG7	Q9UQ90	795 aa		33.22	■■■□□ 2.91
HOXB3-212	ENST00000498678	TEF	Q10587	303 aa		33.21	■■■□□ 2.91
HOXB3-212	ENST00000498678	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		33.2	■■■□□ 2.91
HOXB3-212	ENST00000498678	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
HOXB3-212	ENST00000498678	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		33.19	■■■□□ 2.9
HOXB3-212	ENST00000498678	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		33.19	■■■□□ 2.9
HOXB3-212	ENST00000498678	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
HOXB3-212	ENST00000498678	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		33.17	■■■□□ 2.9
HOXB3-212	ENST00000498678	TOM1	O60784	492 aa		33.17	■■■□□ 2.9
HOXB3-212	ENST00000498678	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
HOXB3-212	ENST00000498678	PHKG2	P15735	406 aa		33.16	■■■□□ 2.9
HOXB3-212	ENST00000498678	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
HOXB3-212	ENST00000498678	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		33.15	■■■□□ 2.9
HOXB3-212	ENST00000498678	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
HOXB3-212	ENST00000498678	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		33.14	■■■□□ 2.9
HOXB3-212	ENST00000498678	ABCC4	O15439	1325 aa		33.14	■■■□□ 2.9
HOXB3-212	ENST00000498678	BTBD11	A6QL63	1104 aa		33.14	■■■□□ 2.9
HOXB3-212	ENST00000498678	EVA1C	P58658	441 aa		33.14	■■■□□ 2.9
HOXB3-212	ENST00000498678	STRN4	Q9NRL3	753 aa		33.14	■■■□□ 2.9
HOXB3-212	ENST00000498678	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		33.14	■■■□□ 2.9
HOXB3-212	ENST00000498678	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		33.14	■■■□□ 2.9
HOXB3-212	ENST00000498678	IGHD	P01880	384 aa		33.13	■■■□□ 2.89
HOXB3-212	ENST00000498678	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89

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