RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498623.6

ARPC4-208, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 4, human

TSL 2 BASIC

Gene ARPC4, Length 942 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARPC4-208	ENST00000498623	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		31.5	■■■□□ 2.63
ARPC4-208	ENST00000498623	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		31.49	■■■□□ 2.63
ARPC4-208	ENST00000498623	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		31.49	■■■□□ 2.63
ARPC4-208	ENST00000498623	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
ARPC4-208	ENST00000498623	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
ARPC4-208	ENST00000498623	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		31.47	■■■□□ 2.63
ARPC4-208	ENST00000498623	TXNRD1	Q16881	649 aa		31.46	■■■□□ 2.63
ARPC4-208	ENST00000498623	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		31.46	■■■□□ 2.63
ARPC4-208	ENST00000498623	POLK	Q9UBT6	870 aa		31.46	■■■□□ 2.63
ARPC4-208	ENST00000498623	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		31.45	■■■□□ 2.63
ARPC4-208	ENST00000498623	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		31.44	■■■□□ 2.62
ARPC4-208	ENST00000498623	CASZ1	Q86V15	1759 aa		31.43	■■■□□ 2.62
ARPC4-208	ENST00000498623	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
ARPC4-208	ENST00000498623	PAPPA	Q13219	1627 aa		31.42	■■■□□ 2.62
ARPC4-208	ENST00000498623	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
ARPC4-208	ENST00000498623	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
ARPC4-208	ENST00000498623	LY75	O60449	1722 aa		31.38	■■■□□ 2.61
ARPC4-208	ENST00000498623	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		31.37	■■■□□ 2.61
ARPC4-208	ENST00000498623	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		31.37	■■■□□ 2.61
ARPC4-208	ENST00000498623	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		31.36	■■■□□ 2.61
ARPC4-208	ENST00000498623	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
ARPC4-208	ENST00000498623	EYA1	Q99502	592 aa		31.34	■■■□□ 2.61
ARPC4-208	ENST00000498623	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		31.33	■■■□□ 2.61
ARPC4-208	ENST00000498623	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
ARPC4-208	ENST00000498623	STK32B	Q9NY57	414 aa		31.33	■■■□□ 2.61
ARPC4-208	ENST00000498623	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
ARPC4-208	ENST00000498623	SLC15A2	Q16348	729 aa		31.31	■■■□□ 2.6
ARPC4-208	ENST00000498623	MORC1	Q86VD1	984 aa		31.31	■■■□□ 2.6
ARPC4-208	ENST00000498623	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		31.3	■■■□□ 2.6
ARPC4-208	ENST00000498623	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	31.3	■■■□□ 2.6
ARPC4-208	ENST00000498623	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	31.3	■■■□□ 2.6
ARPC4-208	ENST00000498623	ITGB4	P16144	1822 aa		31.29	■■■□□ 2.6
ARPC4-208	ENST00000498623	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		31.29	■■■□□ 2.6
ARPC4-208	ENST00000498623	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		31.29	■■■□□ 2.6
ARPC4-208	ENST00000498623	CYP27B1	O15528	508 aa		31.28	■■■□□ 2.6
ARPC4-208	ENST00000498623	SPON1	Q9HCB6	807 aa		31.28	■■■□□ 2.6
ARPC4-208	ENST00000498623	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	31.28	■■■□□ 2.6	1e-8	■□□□□ 10.7
ARPC4-208	ENST00000498623	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		31.27	■■■□□ 2.6
ARPC4-208	ENST00000498623	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		31.26	■■■□□ 2.6
ARPC4-208	ENST00000498623	SPG7	Q9UQ90	795 aa		31.25	■■■□□ 2.59
ARPC4-208	ENST00000498623	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
ARPC4-208	ENST00000498623	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	31.23	■■■□□ 2.59
ARPC4-208	ENST00000498623	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
ARPC4-208	ENST00000498623	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		31.19	■■■□□ 2.58
ARPC4-208	ENST00000498623	ZNF827	Q17R98	1081 aa		31.19	■■■□□ 2.58
ARPC4-208	ENST00000498623	AKT1S1	Q96B36	256 aa		31.18	■■■□□ 2.58
ARPC4-208	ENST00000498623	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		31.17	■■■□□ 2.58
ARPC4-208	ENST00000498623	C5	P01031	1676 aa		31.16	■■■□□ 2.58
ARPC4-208	ENST00000498623	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		31.15	■■■□□ 2.58
ARPC4-208	ENST00000498623	ZBTB7A	O95365	584 aa		31.14	■■■□□ 2.58
ARPC4-208	ENST00000498623	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		31.14	■■■□□ 2.58
ARPC4-208	ENST00000498623	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	31.14	■■■□□ 2.58
ARPC4-208	ENST00000498623	PHKG2	P15735	406 aa		31.13	■■■□□ 2.57
ARPC4-208	ENST00000498623	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		31.13	■■■□□ 2.57
ARPC4-208	ENST00000498623	MTFR1L	Q9H019	292 aa		31.13	■■■□□ 2.57
ARPC4-208	ENST00000498623	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	31.12	■■■□□ 2.57
ARPC4-208	ENST00000498623	KDR	P35968	1356 aa		31.12	■■■□□ 2.57
ARPC4-208	ENST00000498623	PTGER2	P43116	358 aa		31.11	■■■□□ 2.57
ARPC4-208	ENST00000498623	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		31.11	■■■□□ 2.57
ARPC4-208	ENST00000498623	PALLD	Q8WX93	1383 aa		31.11	■■■□□ 2.57
ARPC4-208	ENST00000498623	IL13	P35225	146 aa		31.1	■■■□□ 2.57
ARPC4-208	ENST00000498623	KCNQ4	P56696	695 aa		31.1	■■■□□ 2.57
ARPC4-208	ENST00000498623	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
ARPC4-208	ENST00000498623	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	31.09	■■■□□ 2.57
ARPC4-208	ENST00000498623	PIGB	Q92521	554 aa		31.08	■■■□□ 2.57
ARPC4-208	ENST00000498623	MTHFS	P49914	203 aa		31.07	■■■□□ 2.56
ARPC4-208	ENST00000498623	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	31.07	■■■□□ 2.56
ARPC4-208	ENST00000498623	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		31.07	■■■□□ 2.56
ARPC4-208	ENST00000498623	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		31.06	■■■□□ 2.56
ARPC4-208	ENST00000498623	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		31.06	■■■□□ 2.56
ARPC4-208	ENST00000498623	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
ARPC4-208	ENST00000498623	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		31.06	■■■□□ 2.56
ARPC4-208	ENST00000498623	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
ARPC4-208	ENST00000498623	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		31.05	■■■□□ 2.56
ARPC4-208	ENST00000498623	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		31.04	■■■□□ 2.56
ARPC4-208	ENST00000498623	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		31.04	■■■□□ 2.56
ARPC4-208	ENST00000498623	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	31.03	■■■□□ 2.56
ARPC4-208	ENST00000498623	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		31.03	■■■□□ 2.56
ARPC4-208	ENST00000498623	C4B	P0C0L5	1744 aa		31.02	■■■□□ 2.56
ARPC4-208	ENST00000498623	DCAF5	Q96JK2	942 aa		31.01	■■■□□ 2.55
ARPC4-208	ENST00000498623	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	30.99	■■■□□ 2.55
ARPC4-208	ENST00000498623	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		30.99	■■■□□ 2.55
ARPC4-208	ENST00000498623	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	30.99	■■■□□ 2.55
ARPC4-208	ENST00000498623	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	30.99	■■■□□ 2.55
ARPC4-208	ENST00000498623	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		30.99	■■■□□ 2.55
ARPC4-208	ENST00000498623	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		30.97	■■■□□ 2.55
ARPC4-208	ENST00000498623	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		30.97	■■■□□ 2.55
ARPC4-208	ENST00000498623	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		30.94	■■■□□ 2.54
ARPC4-208	ENST00000498623	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	30.94	■■■□□ 2.54
ARPC4-208	ENST00000498623	SIK1	P57059	783 aa		30.94	■■■□□ 2.54
ARPC4-208	ENST00000498623	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		30.94	■■■□□ 2.54
ARPC4-208	ENST00000498623	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		30.93	■■■□□ 2.54
ARPC4-208	ENST00000498623	ATG3	Q9NT62	314 aa		30.93	■■■□□ 2.54
ARPC4-208	ENST00000498623	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	30.93	■■■□□ 2.54
ARPC4-208	ENST00000498623	MAP3K5	Q99683	1374 aa		30.92	■■■□□ 2.54
ARPC4-208	ENST00000498623	ARX	Q96QS3	562 aa		30.92	■■■□□ 2.54
ARPC4-208	ENST00000498623	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	30.91	■■■□□ 2.54
ARPC4-208	ENST00000498623	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		30.91	■■■□□ 2.54
ARPC4-208	ENST00000498623	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	30.9	■■■□□ 2.54
ARPC4-208	ENST00000498623	SYT17	Q9BSW7	474 aa		30.88	■■■□□ 2.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms