RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, human

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SIMC1-208	ENST00000495423	HOXC9	P31274	260 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SIMC1-208	ENST00000495423	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
SIMC1-208	ENST00000495423	MEGF6	O75095	1541 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SIMC1-208	ENST00000495423	GPR162	Q16538	588 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SIMC1-208	ENST00000495423	COG3	Q96JB2	828 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SIMC1-208	ENST00000495423	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
SIMC1-208	ENST00000495423	TESK2	Q96S53	571 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SIMC1-208	ENST00000495423	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SIMC1-208	ENST00000495423	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SIMC1-208	ENST00000495423	C1QTNF8	P60827	252 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SIMC1-208	ENST00000495423	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
SIMC1-208	ENST00000495423	RTL1	A6NKG5	1358 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SIMC1-208	ENST00000495423	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SIMC1-208	ENST00000495423	KCNQ4	P56696	695 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SIMC1-208	ENST00000495423	AMPH	P49418	695 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SIMC1-208	ENST00000495423	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SIMC1-208	ENST00000495423	C5	P01031	1676 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SIMC1-208	ENST00000495423	KLHL34	Q8N239	644 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SIMC1-208	ENST00000495423	FBLN1	P23142	703 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SIMC1-208	ENST00000495423	SLC24A1	O60721	1099 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SIMC1-208	ENST00000495423	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SIMC1-208	ENST00000495423	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SIMC1-208	ENST00000495423	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SIMC1-208	ENST00000495423	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
SIMC1-208	ENST00000495423	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SIMC1-208	ENST00000495423	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SIMC1-208	ENST00000495423	USP47	Q96K76	1375 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SIMC1-208	ENST00000495423	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SIMC1-208	ENST00000495423	NBPF4	Q96M43	638 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SIMC1-208	ENST00000495423	ITGB4	P16144	1822 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SIMC1-208	ENST00000495423	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
SIMC1-208	ENST00000495423	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
SIMC1-208	ENST00000495423	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
SIMC1-208	ENST00000495423	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
SIMC1-208	ENST00000495423	FYB1	O15117	783 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SIMC1-208	ENST00000495423	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SIMC1-208	ENST00000495423	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
SIMC1-208	ENST00000495423	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SIMC1-208	ENST00000495423	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SIMC1-208	ENST00000495423	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SIMC1-208	ENST00000495423	GRIN3B	O60391	1043 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SIMC1-208	ENST00000495423	INSR	P06213	1382 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SIMC1-208	ENST00000495423	MSH5	O43196	834 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SIMC1-208	ENST00000495423	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	32.36	■■■□□ 2.77	5e-6	■■□□□ 13.3
SIMC1-208	ENST00000495423	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SIMC1-208	ENST00000495423	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SIMC1-208	ENST00000495423	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SIMC1-208	ENST00000495423	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SIMC1-208	ENST00000495423	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SIMC1-208	ENST00000495423	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
SIMC1-208	ENST00000495423	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
SIMC1-208	ENST00000495423	C4B	P0C0L5	1744 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SIMC1-208	ENST00000495423	CEP350	Q5VT06	3117 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SIMC1-208	ENST00000495423	FLT4	P35916	1363 aa		32.32	■■■□□ 2.77
SIMC1-208	ENST00000495423	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SIMC1-208	ENST00000495423	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SIMC1-208	ENST00000495423	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SIMC1-208	ENST00000495423	TMF1	P82094	1093 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SIMC1-208	ENST00000495423	MSL1	Q68DK7	614 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SIMC1-208	ENST00000495423	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SIMC1-208	ENST00000495423	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
SIMC1-208	ENST00000495423	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SIMC1-208	ENST00000495423	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
SIMC1-208	ENST00000495423	CYP27B1	O15528	508 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SIMC1-208	ENST00000495423	NCAPD2	Q15021	1401 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SIMC1-208	ENST00000495423	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SIMC1-208	ENST00000495423	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SIMC1-208	ENST00000495423	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
SIMC1-208	ENST00000495423	ATP10D	Q9P241	1426 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SIMC1-208	ENST00000495423	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SIMC1-208	ENST00000495423	CDCA8	Q53HL2	280 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SIMC1-208	ENST00000495423	ADCY9	O60503	1353 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SIMC1-208	ENST00000495423	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
SIMC1-208	ENST00000495423	AK7	Q96M32	723 aa		32.17	■■■□□ 2.74
SIMC1-208	ENST00000495423	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		32.16	■■■□□ 2.74
SIMC1-208	ENST00000495423	PIGB	Q92521	554 aa		32.15	■■■□□ 2.74
SIMC1-208	ENST00000495423	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		32.15	■■■□□ 2.74
SIMC1-208	ENST00000495423	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		32.14	■■■□□ 2.74
SIMC1-208	ENST00000495423	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SIMC1-208	ENST00000495423	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
SIMC1-208	ENST00000495423	SPG7	Q9UQ90	795 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SIMC1-208	ENST00000495423	SSFA2	P28290	1259 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SIMC1-208	ENST00000495423	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	32.09	■■■□□ 2.73
SIMC1-208	ENST00000495423	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SIMC1-208	ENST00000495423	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SIMC1-208	ENST00000495423	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SIMC1-208	ENST00000495423	PHF14	O94880	888 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SIMC1-208	ENST00000495423	SIK1	P57059	783 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SIMC1-208	ENST00000495423	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
SIMC1-208	ENST00000495423	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SIMC1-208	ENST00000495423	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SIMC1-208	ENST00000495423	SMIM5	Q71RC9	77 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SIMC1-208	ENST00000495423	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
SIMC1-208	ENST00000495423	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SIMC1-208	ENST00000495423	EYA1	Q99502	592 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SIMC1-208	ENST00000495423	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SIMC1-208	ENST00000495423	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
SIMC1-208	ENST00000495423	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SIMC1-208	ENST00000495423	ITPK1	Q13572	414 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SIMC1-208	ENST00000495423	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.01	■■■□□ 2.71

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