RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC27A3Q5K4L6 730 aa31.48■■■□□ 2.63
TRDMT1-211ENST00000495022 UTRNP46939 3433 aa31.47■■■□□ 2.63
TRDMT1-211ENST00000495022 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa31.47■■■□□ 2.63
TRDMT1-211ENST00000495022 CGNL1Q0VF96 1302 aa31.47■■■□□ 2.63
TRDMT1-211ENST00000495022 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa31.46■■■□□ 2.63
TRDMT1-211ENST00000495022 SGIP1Q9BQI5 828 aa31.46■■■□□ 2.63
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF24Q5T7B8 1368 aa31.46■■■□□ 2.63
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF827Q17R98 1081 aa31.45■■■□□ 2.63
TRDMT1-211ENST00000495022 NBPF6Q5VWK0 638 aa31.45■■■□□ 2.63
TRDMT1-211ENST00000495022 NBPF4Q96M43 638 aa31.45■■■□□ 2.63
TRDMT1-211ENST00000495022 INSRP06213 1382 aa31.44■■■□□ 2.62
TRDMT1-211ENST00000495022 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
TRDMT1-211ENST00000495022 NSD2O96028 1365 aa31.43■■■□□ 2.62
TRDMT1-211ENST00000495022 FLT4P35916 1363 aa31.43■■■□□ 2.62
TRDMT1-211ENST00000495022 AKT1S1Q96B36 256 aa31.43■■■□□ 2.62
TRDMT1-211ENST00000495022 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
TRDMT1-211ENST00000495022 COL24A1Q17RW2 1714 aa31.42■■■□□ 2.62
TRDMT1-211ENST00000495022 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.41■■■□□ 2.62
TRDMT1-211ENST00000495022 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa31.41■■■□□ 2.62
TRDMT1-211ENST00000495022 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa31.4■■■□□ 2.62
TRDMT1-211ENST00000495022 CHD4Q14839 1912 aa31.39■■■□□ 2.62
TRDMT1-211ENST00000495022 SYT17Q9BSW7 474 aa31.39■■■□□ 2.62
TRDMT1-211ENST00000495022 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
TRDMT1-211ENST00000495022 NSD3Q9BZ95 1437 aa31.39■■■□□ 2.61
TRDMT1-211ENST00000495022 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa31.38■■■□□ 2.61
TRDMT1-211ENST00000495022 USHBP1Q8N6Y0 703 aa31.38■■■□□ 2.61
TRDMT1-211ENST00000495022 CARD14Q9BXL6 1004 aa31.38■■■□□ 2.61
TRDMT1-211ENST00000495022 TATP17735 454 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC16A10Q8TF71 515 aa31.36■■■□□ 2.61
TRDMT1-211ENST00000495022 ARXQ96QS3 562 aa31.36■■■□□ 2.61
TRDMT1-211ENST00000495022 MAP3K5Q99683 1374 aa31.36■■■□□ 2.61
TRDMT1-211ENST00000495022 PKD1L3Q7Z443 1732 aa31.34■■■□□ 2.61
TRDMT1-211ENST00000495022 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa31.33■■■□□ 2.61
TRDMT1-211ENST00000495022 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa31.33■■■□□ 2.61
TRDMT1-211ENST00000495022 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa31.33■■■□□ 2.61
TRDMT1-211ENST00000495022 ITGB4P16144 1822 aa31.32■■■□□ 2.6
TRDMT1-211ENST00000495022 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa31.3■■■□□ 2.6
TRDMT1-211ENST00000495022 TAF1LQ8IZX4 1826 aa31.3■■■□□ 2.6
TRDMT1-211ENST00000495022 C5P01031 1676 aa31.3■■■□□ 2.6
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNQ4P56696 695 aa31.3■■■□□ 2.6
TRDMT1-211ENST00000495022 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
TRDMT1-211ENST00000495022 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa31.3■■■□□ 2.6
TRDMT1-211ENST00000495022 NCAPD2Q15021 1401 aa31.29■■■□□ 2.6
TRDMT1-211ENST00000495022 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa31.28■■■□□ 2.6
TRDMT1-211ENST00000495022 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.6
TRDMT1-211ENST00000495022 POLD1P28340 1107 aa31.25■■■□□ 2.59
TRDMT1-211ENST00000495022 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.23■■■□□ 2.59
TRDMT1-211ENST00000495022 CYP27B1O15528 508 aa31.22■■■□□ 2.59
TRDMT1-211ENST00000495022 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
TRDMT1-211ENST00000495022 WASHC2AQ641Q2 1341 aa31.22■■■□□ 2.59
TRDMT1-211ENST00000495022 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
TRDMT1-211ENST00000495022 PALLDQ8WX93 1383 aa31.18■■■□□ 2.58
TRDMT1-211ENST00000495022 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa31.17■■■□□ 2.58
TRDMT1-211ENST00000495022 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
TRDMT1-211ENST00000495022 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
TRDMT1-211ENST00000495022 POLKQ9UBT6 870 aa31.15■■■□□ 2.58
TRDMT1-211ENST00000495022 SPG7Q9UQ90 795 aa31.15■■■□□ 2.58
TRDMT1-211ENST00000495022 C4BP0C0L5 1744 aa31.14■■■□□ 2.58
TRDMT1-211ENST00000495022 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
TRDMT1-211ENST00000495022 EYA1Q99502 592 aa31.14■■■□□ 2.58
TRDMT1-211ENST00000495022 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP31.14■■■□□ 2.58
TRDMT1-211ENST00000495022 UBR3Q6ZT12 1888 aa31.12■■■□□ 2.57
TRDMT1-211ENST00000495022 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP31.12■■■□□ 2.57
TRDMT1-211ENST00000495022 KLHL34Q8N239 644 aa31.12■■■□□ 2.57
TRDMT1-211ENST00000495022 POLR3GLQ9BT43 218 aa31.12■■■□□ 2.57
TRDMT1-211ENST00000495022 MSH5O43196 834 aa31.11■■■□□ 2.57
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
TRDMT1-211ENST00000495022 FLAD1Q8NFF5 587 aa31.1■■■□□ 2.57
TRDMT1-211ENST00000495022 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa31.1■■■□□ 2.57
TRDMT1-211ENST00000495022 GPR162Q16538 588 aa31.09■■■□□ 2.57
TRDMT1-211ENST00000495022 PIGBQ92521 554 aa31.08■■■□□ 2.57
TRDMT1-211ENST00000495022 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
TRDMT1-211ENST00000495022 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
TRDMT1-211ENST00000495022 NLGN2Q8NFZ4 835 aa31.05■■■□□ 2.56
TRDMT1-211ENST00000495022 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
TRDMT1-211ENST00000495022 IFNL2Q8IZJ0 200 aa31.04■■■□□ 2.56
TRDMT1-211ENST00000495022 PHKG2P15735 406 aa31.02■■■□□ 2.56
TRDMT1-211ENST00000495022 MSL1Q68DK7 614 aa31.02■■■□□ 2.56
TRDMT1-211ENST00000495022 AK7Q96M32 723 aa31.02■■■□□ 2.56
TRDMT1-211ENST00000495022 PANK3Q9H999 370 aa31.02■■■□□ 2.56
TRDMT1-211ENST00000495022 TMOD3Q9NYL9 352 aa31.02■■■□□ 2.56
TRDMT1-211ENST00000495022 IGSF1Q8N6C5 1336 aa31■■■□□ 2.55
TRDMT1-211ENST00000495022 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa30.99■■■□□ 2.55
TRDMT1-211ENST00000495022 SIK1P57059 783 aa30.99■■■□□ 2.55
TRDMT1-211ENST00000495022 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF831Q5JPB2 1677 aa30.96■■■□□ 2.55
TRDMT1-211ENST00000495022 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
TRDMT1-211ENST00000495022 SSFA2P28290 1259 aa30.94■■■□□ 2.54
TRDMT1-211ENST00000495022 AMIGO3Q86WK7 504 aa30.94■■■□□ 2.54
TRDMT1-211ENST00000495022 ASAP1Q9ULH1 1129 aa30.94■■■□□ 2.54
TRDMT1-211ENST00000495022 CD2APQ9Y5K6 639 aa30.94■■■□□ 2.54
TRDMT1-211ENST00000495022 LINC00116Q8NCU8 138 aa30.93■■■□□ 2.54
TRDMT1-211ENST00000495022 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
TRDMT1-211ENST00000495022 GRIN3BO60391 1043 aa30.92■■■□□ 2.54
TRDMT1-211ENST00000495022 PHF14O94880 888 aa30.91■■■□□ 2.54
TRDMT1-211ENST00000495022 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP30.91■■■□□ 2.54
TRDMT1-211ENST00000495022 ATG3Q9NT62 314 aa30.91■■■□□ 2.54
TRDMT1-211ENST00000495022 ERVV-2B6SEH9 535 aa30.9■■■□□ 2.54
TRDMT1-211ENST00000495022 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms