RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
SENP6-211ENST00000493959 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa31.21■■■□□ 2.59
SENP6-211ENST00000493959 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa31.21■■■□□ 2.59
SENP6-211ENST00000493959 NHSQ6T4R5 1651 aa31.21■■■□□ 2.59
SENP6-211ENST00000493959 LRP5O75197 1615 aa31.2■■■□□ 2.59
SENP6-211ENST00000493959 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
SENP6-211ENST00000493959 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
SENP6-211ENST00000493959 WASHC2AQ641Q2 1341 aa31.19■■■□□ 2.58
SENP6-211ENST00000493959 TATP17735 454 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
SENP6-211ENST00000493959 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
SENP6-211ENST00000493959 BTAF1O14981 1849 aa31.16■■■□□ 2.58
SENP6-211ENST00000493959 KIF7Q2M1P5 1343 aa31.16■■■□□ 2.58
SENP6-211ENST00000493959 SHANK3Q9BYB0 1731 aa31.15■■■□□ 2.58
SENP6-211ENST00000493959 EYA1Q99502 592 aa31.14■■■□□ 2.58
SENP6-211ENST00000493959 LRRC4BQ9NT99 713 aa31.12■■■□□ 2.57
SENP6-211ENST00000493959 SLC15A2Q16348 729 aa31.1■■■□□ 2.57
SENP6-211ENST00000493959 STK32BQ9NY57 414 aa31.1■■■□□ 2.57
SENP6-211ENST00000493959 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa31.1■■■□□ 2.57
SENP6-211ENST00000493959 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
SENP6-211ENST00000493959 MORC1Q86VD1 984 aa31.09■■■□□ 2.57
SENP6-211ENST00000493959 KNSTRNQ9Y448 316 aa31.09■■■□□ 2.57
SENP6-211ENST00000493959 CYP27B1O15528 508 aa31.08■■■□□ 2.57
SENP6-211ENST00000493959 KCNQ4P56696 695 aa31.08■■■□□ 2.57
SENP6-211ENST00000493959 NSD2O96028 1365 aa31.07■■■□□ 2.56
SENP6-211ENST00000493959 SPON1Q9HCB6 807 aa31.06■■■□□ 2.56
SENP6-211ENST00000493959 DOT1LQ8TEK3 1739 aa31.05■■■□□ 2.56
SENP6-211ENST00000493959 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
SENP6-211ENST00000493959 NCAPD2Q15021 1401 aa31.04■■■□□ 2.56
SENP6-211ENST00000493959 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa31.03■■■□□ 2.56
SENP6-211ENST00000493959 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa31.03■■■□□ 2.56
SENP6-211ENST00000493959 ZBTB7AO95365 584 aa31.03■■■□□ 2.56
SENP6-211ENST00000493959 ZNF827Q17R98 1081 aa31.02■■■□□ 2.56
SENP6-211ENST00000493959 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
SENP6-211ENST00000493959 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
SENP6-211ENST00000493959 CASZ1Q86V15 1759 aa30.99■■■□□ 2.55
SENP6-211ENST00000493959 SLC27A3Q5K4L6 730 aa30.98■■■□□ 2.55
SENP6-211ENST00000493959 SPG7Q9UQ90 795 aa30.98■■■□□ 2.55
SENP6-211ENST00000493959 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa30.97■■■□□ 2.55
SENP6-211ENST00000493959 AKT1S1Q96B36 256 aa30.96■■■□□ 2.55
SENP6-211ENST00000493959 PAPPAQ13219 1627 aa30.95■■■□□ 2.55
SENP6-211ENST00000493959 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
SENP6-211ENST00000493959 PKD1L3Q7Z443 1732 aa30.93■■■□□ 2.54
SENP6-211ENST00000493959 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
SENP6-211ENST00000493959 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
SENP6-211ENST00000493959 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP30.93■■■□□ 2.543e-8■■■□□ 17.9
SENP6-211ENST00000493959 IGSF1Q8N6C5 1336 aa30.93■■■□□ 2.54
SENP6-211ENST00000493959 PTGER2P43116 358 aa30.92■■■□□ 2.54
SENP6-211ENST00000493959 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
SENP6-211ENST00000493959 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
SENP6-211ENST00000493959 AEBP1Q8IUX7 1158 aa30.9■■■□□ 2.54
SENP6-211ENST00000493959 PIGBQ92521 554 aa30.9■■■□□ 2.54
SENP6-211ENST00000493959 LY75O60449 1722 aa30.9■■■□□ 2.54
SENP6-211ENST00000493959 PHKG2P15735 406 aa30.89■■■□□ 2.54
SENP6-211ENST00000493959 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa30.88■■■□□ 2.53
SENP6-211ENST00000493959 IFNL2Q8IZJ0 200 aa30.88■■■□□ 2.53
SENP6-211ENST00000493959 ITGB4P16144 1822 aa30.87■■■□□ 2.53
SENP6-211ENST00000493959 IL13P35225 146 aa30.87■■■□□ 2.53
SENP6-211ENST00000493959 MTHFSP49914 203 aa30.87■■■□□ 2.53
SENP6-211ENST00000493959 MTFR1LQ9H019 292 aa30.87■■■□□ 2.53
SENP6-211ENST00000493959 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa30.86■■■□□ 2.53
SENP6-211ENST00000493959 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa30.84■■■□□ 2.53
SENP6-211ENST00000493959 SULT6B1Q6IMI4 303 aa30.84■■■□□ 2.53
SENP6-211ENST00000493959 SGIP1Q9BQI5 828 aa30.84■■■□□ 2.53
SENP6-211ENST00000493959 PALLDQ8WX93 1383 aa30.83■■■□□ 2.53
SENP6-211ENST00000493959 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
SENP6-211ENST00000493959 ASAP1Q9ULH1 1129 aa30.8■■■□□ 2.52
SENP6-211ENST00000493959 TMOD3Q9NYL9 352 aa30.79■■■□□ 2.52
SENP6-211ENST00000493959 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
SENP6-211ENST00000493959 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
SENP6-211ENST00000493959 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa30.77■■■□□ 2.52
SENP6-211ENST00000493959 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
SENP6-211ENST00000493959 AMOTQ4VCS5 1084 aa30.75■■■□□ 2.51
SENP6-211ENST00000493959 ATG3Q9NT62 314 aa30.75■■■□□ 2.51
SENP6-211ENST00000493959 SLC16A10Q8TF71 515 aa30.74■■■□□ 2.51
SENP6-211ENST00000493959 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
SENP6-211ENST00000493959 MSH5O43196 834 aa30.73■■■□□ 2.51
SENP6-211ENST00000493959 HMOX1P09601 288 aa30.73■■■□□ 2.51
SENP6-211ENST00000493959 SMIM5Q71RC9 77 aa30.73■■■□□ 2.51
SENP6-211ENST00000493959 ARXQ96QS3 562 aa30.73■■■□□ 2.51
SENP6-211ENST00000493959 KDRP35968 1356 aa30.72■■■□□ 2.51
SENP6-211ENST00000493959 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa30.72■■■□□ 2.51
SENP6-211ENST00000493959 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa30.72■■■□□ 2.51
SENP6-211ENST00000493959 SIK1P57059 783 aa30.72■■■□□ 2.51
SENP6-211ENST00000493959 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa30.71■■■□□ 2.51
SENP6-211ENST00000493959 QSER1Q2KHR3 1735 aa30.71■■■□□ 2.51
SENP6-211ENST00000493959 AMIGO3Q86WK7 504 aa30.71■■■□□ 2.51
SENP6-211ENST00000493959 DCAF5Q96JK2 942 aa30.71■■■□□ 2.51
SENP6-211ENST00000493959 SYT17Q9BSW7 474 aa30.71■■■□□ 2.51
SENP6-211ENST00000493959 ERVV-2B6SEH9 535 aa30.7■■■□□ 2.51
SENP6-211ENST00000493959 TAF1LQ8IZX4 1826 aa30.7■■■□□ 2.5
SENP6-211ENST00000493959 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
SENP6-211ENST00000493959 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
SENP6-211ENST00000493959 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
SENP6-211ENST00000493959 C5P01031 1676 aa30.68■■■□□ 2.5
SENP6-211ENST00000493959 ITPK1Q13572 414 aa30.68■■■□□ 2.5
SENP6-211ENST00000493959 LINC00116Q8NCU8 138 aa30.68■■■□□ 2.5
SENP6-211ENST00000493959 C1orf141Q5JVX7 400 aa30.67■■■□□ 2.5
SENP6-211ENST00000493959 ATP6V1AP38606 617 aa30.65■■■□□ 2.5
SENP6-211ENST00000493959 CABP4P57796 275 aa30.65■■■□□ 2.5
SENP6-211ENST00000493959 SLC4A9Q96Q91 983 aa30.65■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms