RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRU-207ENST00000492954 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PTPRU-207ENST00000492954 POLKQ9UBT6 870 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRU-207ENST00000492954 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRU-207ENST00000492954 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRU-207ENST00000492954 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRU-207ENST00000492954 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PTPRU-207ENST00000492954 BTAF1O14981 1849 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRU-207ENST00000492954 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRU-207ENST00000492954 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRU-207ENST00000492954 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRU-207ENST00000492954 NSD2O96028 1365 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRU-207ENST00000492954 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRU-207ENST00000492954 NCAPD2Q15021 1401 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRU-207ENST00000492954 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PTPRU-207ENST00000492954 EYA1Q99502 592 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRU-207ENST00000492954 STK32BQ9NY57 414 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRU-207ENST00000492954 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRU-207ENST00000492954 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PTPRU-207ENST00000492954 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRU-207ENST00000492954 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRU-207ENST00000492954 SLC15A2Q16348 729 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRU-207ENST00000492954 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRU-207ENST00000492954 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PTPRU-207ENST00000492954 MORC1Q86VD1 984 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRU-207ENST00000492954 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRU-207ENST00000492954 SPON1Q9HCB6 807 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRU-207ENST00000492954 CYP27B1O15528 508 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRU-207ENST00000492954 PAPPAQ13219 1627 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRU-207ENST00000492954 CASZ1Q86V15 1759 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRU-207ENST00000492954 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF827Q17R98 1081 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRU-207ENST00000492954 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRU-207ENST00000492954 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRU-207ENST00000492954 ZBTB7AO95365 584 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRU-207ENST00000492954 KCNQ4P56696 695 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRU-207ENST00000492954 SPG7Q9UQ90 795 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRU-207ENST00000492954 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PTPRU-207ENST00000492954 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRU-207ENST00000492954 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PTPRU-207ENST00000492954 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRU-207ENST00000492954 AKT1S1Q96B36 256 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRU-207ENST00000492954 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
PTPRU-207ENST00000492954 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PTPRU-207ENST00000492954 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
PTPRU-207ENST00000492954 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
PTPRU-207ENST00000492954 LY75O60449 1722 aa24.58■■□□□ 1.52
PTPRU-207ENST00000492954 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.58■■□□□ 1.52
PTPRU-207ENST00000492954 PTGER2P43116 358 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRU-207ENST00000492954 PHKG2P15735 406 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRU-207ENST00000492954 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PTPRU-207ENST00000492954 MTFR1LQ9H019 292 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRU-207ENST00000492954 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRU-207ENST00000492954 PALLDQ8WX93 1383 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRU-207ENST00000492954 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRU-207ENST00000492954 PIGBQ92521 554 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRU-207ENST00000492954 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRU-207ENST00000492954 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRU-207ENST00000492954 IL13P35225 146 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRU-207ENST00000492954 MTHFSP49914 203 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRU-207ENST00000492954 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRU-207ENST00000492954 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRU-207ENST00000492954 ITGB4P16144 1822 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRU-207ENST00000492954 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PTPRU-207ENST00000492954 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRU-207ENST00000492954 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PTPRU-207ENST00000492954 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRU-207ENST00000492954 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
PTPRU-207ENST00000492954 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PTPRU-207ENST00000492954 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRU-207ENST00000492954 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRU-207ENST00000492954 KDRP35968 1356 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRU-207ENST00000492954 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRU-207ENST00000492954 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRU-207ENST00000492954 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRU-207ENST00000492954 C5P01031 1676 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRU-207ENST00000492954 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PTPRU-207ENST00000492954 DCAF5Q96JK2 942 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRU-207ENST00000492954 ARXQ96QS3 562 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRU-207ENST00000492954 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PTPRU-207ENST00000492954 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PTPRU-207ENST00000492954 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRU-207ENST00000492954 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRU-207ENST00000492954 SIK1P57059 783 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRU-207ENST00000492954 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PTPRU-207ENST00000492954 MSH5O43196 834 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRU-207ENST00000492954 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRU-207ENST00000492954 ATG3Q9NT62 314 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRU-207ENST00000492954 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
PTPRU-207ENST00000492954 HMOX1P09601 288 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRU-207ENST00000492954 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
PTPRU-207ENST00000492954 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRU-207ENST00000492954 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRU-207ENST00000492954 SYT17Q9BSW7 474 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRU-207ENST00000492954 POLD1P28340 1107 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRU-207ENST00000492954 AK7Q96M32 723 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRU-207ENST00000492954 C4BP0C0L5 1744 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRU-207ENST00000492954 CABP4P57796 275 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRU-207ENST00000492954 ITPK1Q13572 414 aa24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms