RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491036.2

LAMA5-210, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5, Length 728 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-210ENST00000491036 MEGF6O75095 1541 aa22.38■■□□□ 1.17
LAMA5-210ENST00000491036 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.38■■□□□ 1.17
LAMA5-210ENST00000491036 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.38■■□□□ 1.17
LAMA5-210ENST00000491036 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
LAMA5-210ENST00000491036 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.36■■□□□ 1.17
LAMA5-210ENST00000491036 INSRP06213 1382 aa22.36■■□□□ 1.17
LAMA5-210ENST00000491036 FLT4P35916 1363 aa22.36■■□□□ 1.17
LAMA5-210ENST00000491036 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
LAMA5-210ENST00000491036 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
LAMA5-210ENST00000491036 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.34■■□□□ 1.17
LAMA5-210ENST00000491036 PAPPAQ13219 1627 aa22.34■■□□□ 1.17
LAMA5-210ENST00000491036 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.33■■□□□ 1.17
LAMA5-210ENST00000491036 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
LAMA5-210ENST00000491036 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.33■■□□□ 1.17
LAMA5-210ENST00000491036 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.33■■□□□ 1.17
LAMA5-210ENST00000491036 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
LAMA5-210ENST00000491036 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.32■■□□□ 1.16
LAMA5-210ENST00000491036 MTFR1LQ9H019 292 aa22.32■■□□□ 1.16
LAMA5-210ENST00000491036 PTGER2P43116 358 aa22.31■■□□□ 1.16
LAMA5-210ENST00000491036 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
LAMA5-210ENST00000491036 ZNF827Q17R98 1081 aa22.31■■□□□ 1.16
LAMA5-210ENST00000491036 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.31■■□□□ 1.16
LAMA5-210ENST00000491036 LY75O60449 1722 aa22.29■■□□□ 1.16
LAMA5-210ENST00000491036 KCNQ4P56696 695 aa22.29■■□□□ 1.16
LAMA5-210ENST00000491036 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
LAMA5-210ENST00000491036 NSD2O96028 1365 aa22.27■■□□□ 1.16
LAMA5-210ENST00000491036 AKT1S1Q96B36 256 aa22.26■■□□□ 1.15
LAMA5-210ENST00000491036 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.26■■□□□ 1.15
LAMA5-210ENST00000491036 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.26■■□□□ 1.15
LAMA5-210ENST00000491036 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.26■■□□□ 1.15
LAMA5-210ENST00000491036 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.25■■□□□ 1.15
LAMA5-210ENST00000491036 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
LAMA5-210ENST00000491036 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
LAMA5-210ENST00000491036 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.24■■□□□ 1.15
LAMA5-210ENST00000491036 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.24■■□□□ 1.15
LAMA5-210ENST00000491036 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
LAMA5-210ENST00000491036 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.23■■□□□ 1.15
LAMA5-210ENST00000491036 YY1P25490 414 aa22.22■■□□□ 1.15
LAMA5-210ENST00000491036 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.22■■□□□ 1.15
LAMA5-210ENST00000491036 POLKQ9UBT6 870 aa22.22■■□□□ 1.15
LAMA5-210ENST00000491036 CYP27B1O15528 508 aa22.21■■□□□ 1.15
LAMA5-210ENST00000491036 ARXQ96QS3 562 aa22.21■■□□□ 1.15
LAMA5-210ENST00000491036 SYT17Q9BSW7 474 aa22.21■■□□□ 1.15
LAMA5-210ENST00000491036 PANK3Q9H999 370 aa22.21■■□□□ 1.15
LAMA5-210ENST00000491036 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.2■■□□□ 1.14
LAMA5-210ENST00000491036 ITGB4P16144 1822 aa22.2■■□□□ 1.14
LAMA5-210ENST00000491036 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.2■■□□□ 1.14
LAMA5-210ENST00000491036 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.2■■□□□ 1.14
LAMA5-210ENST00000491036 EYA1Q99502 592 aa22.2■■□□□ 1.14
LAMA5-210ENST00000491036 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.2■■□□□ 1.14
LAMA5-210ENST00000491036 SPG7Q9UQ90 795 aa22.19■■□□□ 1.14
LAMA5-210ENST00000491036 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.17■■□□□ 1.14
LAMA5-210ENST00000491036 NCAPD2Q15021 1401 aa22.16■■□□□ 1.14
LAMA5-210ENST00000491036 MSH5O43196 834 aa22.16■■□□□ 1.14
LAMA5-210ENST00000491036 C5P01031 1676 aa22.15■■□□□ 1.14
LAMA5-210ENST00000491036 POLD1P28340 1107 aa22.15■■□□□ 1.14
LAMA5-210ENST00000491036 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
LAMA5-210ENST00000491036 KLHL34Q8N239 644 aa22.15■■□□□ 1.14
LAMA5-210ENST00000491036 PALLDQ8WX93 1383 aa22.14■■□□□ 1.14
LAMA5-210ENST00000491036 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.14■■□□□ 1.13
LAMA5-210ENST00000491036 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.12■■□□□ 1.13
LAMA5-210ENST00000491036 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
LAMA5-210ENST00000491036 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
LAMA5-210ENST00000491036 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LAMA5-210ENST00000491036 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
LAMA5-210ENST00000491036 PIGBQ92521 554 aa22.11■■□□□ 1.13
LAMA5-210ENST00000491036 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
LAMA5-210ENST00000491036 MORC1Q86VD1 984 aa22.1■■□□□ 1.13
LAMA5-210ENST00000491036 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.1■■□□□ 1.13
LAMA5-210ENST00000491036 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.09■■□□□ 1.13
LAMA5-210ENST00000491036 MAP3K5Q99683 1374 aa22.09■■□□□ 1.13
LAMA5-210ENST00000491036 PHKG2P15735 406 aa22.08■■□□□ 1.13
LAMA5-210ENST00000491036 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.08■■□□□ 1.13
LAMA5-210ENST00000491036 C4BP0C0L5 1744 aa22.06■■□□□ 1.12
LAMA5-210ENST00000491036 MSL1Q68DK7 614 aa22.06■■□□□ 1.12
LAMA5-210ENST00000491036 CHD4Q14839 1912 aa22.06■■□□□ 1.12
LAMA5-210ENST00000491036 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.06■■□□□ 1.12
LAMA5-210ENST00000491036 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.05■■□□□ 1.12
LAMA5-210ENST00000491036 AK7Q96M32 723 aa22.05■■□□□ 1.12
LAMA5-210ENST00000491036 GPR162Q16538 588 aa22.04■■□□□ 1.12
LAMA5-210ENST00000491036 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
LAMA5-210ENST00000491036 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.03■■□□□ 1.12
LAMA5-210ENST00000491036 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.02■■□□□ 1.12
LAMA5-210ENST00000491036 SIK1P57059 783 aa22.02■■□□□ 1.12
LAMA5-210ENST00000491036 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
LAMA5-210ENST00000491036 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.01■■□□□ 1.11
LAMA5-210ENST00000491036 PHF14O94880 888 aa22.01■■□□□ 1.11
LAMA5-210ENST00000491036 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.01■■□□□ 1.11
LAMA5-210ENST00000491036 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
LAMA5-210ENST00000491036 ATP6V1AP38606 617 aa22■■□□□ 1.11
LAMA5-210ENST00000491036 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22■■□□□ 1.11
LAMA5-210ENST00000491036 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.99■■□□□ 1.11
LAMA5-210ENST00000491036 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
LAMA5-210ENST00000491036 SMIM5Q71RC9 77 aa21.99■■□□□ 1.11
LAMA5-210ENST00000491036 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.99■■□□□ 1.11
LAMA5-210ENST00000491036 ATG3Q9NT62 314 aa21.99■■□□□ 1.11
LAMA5-210ENST00000491036 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.98■■□□□ 1.11
LAMA5-210ENST00000491036 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.98■■□□□ 1.11
LAMA5-210ENST00000491036 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
LAMA5-210ENST00000491036 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.97■■□□□ 1.11
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