RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490709.1

GLIS3-216, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 768 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-216ENST00000490709 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.87■■■□□ 2.05
GLIS3-216ENST00000490709 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
GLIS3-216ENST00000490709 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.86■■■□□ 2.05
GLIS3-216ENST00000490709 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.85■■■□□ 2.05
GLIS3-216ENST00000490709 POLKQ9UBT6 870 aa27.85■■■□□ 2.05
GLIS3-216ENST00000490709 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
GLIS3-216ENST00000490709 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.84■■■□□ 2.05
GLIS3-216ENST00000490709 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.84■■■□□ 2.05
GLIS3-216ENST00000490709 NSD2O96028 1365 aa27.83■■■□□ 2.05
GLIS3-216ENST00000490709 BTAF1O14981 1849 aa27.83■■■□□ 2.05
GLIS3-216ENST00000490709 PROM2Q8N271 834 aa27.8■■■□□ 2.04
GLIS3-216ENST00000490709 TXNRD1Q16881 649 aa27.79■■■□□ 2.04
GLIS3-216ENST00000490709 MORC1Q86VD1 984 aa27.79■■■□□ 2.04
GLIS3-216ENST00000490709 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.78■■■□□ 2.04
GLIS3-216ENST00000490709 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
GLIS3-216ENST00000490709 EYA1Q99502 592 aa27.74■■■□□ 2.03
GLIS3-216ENST00000490709 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
GLIS3-216ENST00000490709 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
GLIS3-216ENST00000490709 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa27.72■■■□□ 2.03
GLIS3-216ENST00000490709 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27.72■■■□□ 2.03
GLIS3-216ENST00000490709 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
GLIS3-216ENST00000490709 NCAPD2Q15021 1401 aa27.7■■■□□ 2.03
GLIS3-216ENST00000490709 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
GLIS3-216ENST00000490709 STK32BQ9NY57 414 aa27.7■■■□□ 2.02
GLIS3-216ENST00000490709 PKD1L3Q7Z443 1732 aa27.7■■■□□ 2.02
GLIS3-216ENST00000490709 SPG7Q9UQ90 795 aa27.66■■■□□ 2.02
GLIS3-216ENST00000490709 CYP27B1O15528 508 aa27.65■■■□□ 2.02
GLIS3-216ENST00000490709 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
GLIS3-216ENST00000490709 SLC15A2Q16348 729 aa27.65■■■□□ 2.02
GLIS3-216ENST00000490709 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
GLIS3-216ENST00000490709 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.62■■■□□ 2.01
GLIS3-216ENST00000490709 CASZ1Q86V15 1759 aa27.62■■■□□ 2.01
GLIS3-216ENST00000490709 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.62■■■□□ 2.01
GLIS3-216ENST00000490709 LY75O60449 1722 aa27.61■■■□□ 2.01
GLIS3-216ENST00000490709 PAPPAQ13219 1627 aa27.61■■■□□ 2.01
GLIS3-216ENST00000490709 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
GLIS3-216ENST00000490709 ITGB4P16144 1822 aa27.61■■■□□ 2.01
GLIS3-216ENST00000490709 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.6■■■□□ 2.01
GLIS3-216ENST00000490709 SPON1Q9HCB6 807 aa27.6■■■□□ 2.01
GLIS3-216ENST00000490709 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.6■■■□□ 2.01
GLIS3-216ENST00000490709 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.59■■■□□ 2.01
GLIS3-216ENST00000490709 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
GLIS3-216ENST00000490709 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.59■■■□□ 2.01
GLIS3-216ENST00000490709 KCNQ4P56696 695 aa27.57■■■□□ 2
GLIS3-216ENST00000490709 IFNL2Q8IZJ0 200 aa27.56■■■□□ 2
GLIS3-216ENST00000490709 MTHFSP49914 203 aa27.55■■■□□ 2
GLIS3-216ENST00000490709 ZNF827Q17R98 1081 aa27.55■■■□□ 2
GLIS3-216ENST00000490709 ZBTB7AO95365 584 aa27.54■■■□□ 2
GLIS3-216ENST00000490709 PHKG2P15735 406 aa27.54■■■□□ 2
GLIS3-216ENST00000490709 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
GLIS3-216ENST00000490709 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
GLIS3-216ENST00000490709 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
GLIS3-216ENST00000490709 IL13P35225 146 aa27.52■■■□□ 2
GLIS3-216ENST00000490709 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
GLIS3-216ENST00000490709 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27.52■■■□□ 2
GLIS3-216ENST00000490709 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.51■■□□□ 1.99
GLIS3-216ENST00000490709 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.51■■□□□ 1.99
GLIS3-216ENST00000490709 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.51■■□□□ 1.99
GLIS3-216ENST00000490709 AKT1S1Q96B36 256 aa27.5■■□□□ 1.99
GLIS3-216ENST00000490709 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
GLIS3-216ENST00000490709 PALLDQ8WX93 1383 aa27.49■■□□□ 1.99
GLIS3-216ENST00000490709 PIGBQ92521 554 aa27.48■■□□□ 1.99
GLIS3-216ENST00000490709 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.48■■□□□ 1.99
GLIS3-216ENST00000490709 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.48■■□□□ 1.99
GLIS3-216ENST00000490709 QSER1Q2KHR3 1735 aa27.47■■□□□ 1.99
GLIS3-216ENST00000490709 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.47■■□□□ 1.99
GLIS3-216ENST00000490709 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
GLIS3-216ENST00000490709 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27.47■■□□□ 1.99
GLIS3-216ENST00000490709 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
GLIS3-216ENST00000490709 C5P01031 1676 aa27.46■■□□□ 1.99
GLIS3-216ENST00000490709 MTFR1LQ9H019 292 aa27.45■■□□□ 1.98
GLIS3-216ENST00000490709 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.44■■□□□ 1.98
GLIS3-216ENST00000490709 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
GLIS3-216ENST00000490709 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
GLIS3-216ENST00000490709 KDRP35968 1356 aa27.44■■□□□ 1.98
GLIS3-216ENST00000490709 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.42■■□□□ 1.98
GLIS3-216ENST00000490709 HMOX1P09601 288 aa27.42■■□□□ 1.98
GLIS3-216ENST00000490709 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.42■■□□□ 1.98
GLIS3-216ENST00000490709 PTGER2P43116 358 aa27.41■■□□□ 1.98
GLIS3-216ENST00000490709 DCAF5Q96JK2 942 aa27.41■■□□□ 1.98
GLIS3-216ENST00000490709 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
GLIS3-216ENST00000490709 ASAP1Q9ULH1 1129 aa27.39■■□□□ 1.98
GLIS3-216ENST00000490709 ERVV-2B6SEH9 535 aa27.38■■□□□ 1.97
GLIS3-216ENST00000490709 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
GLIS3-216ENST00000490709 MSH5O43196 834 aa27.37■■□□□ 1.97
GLIS3-216ENST00000490709 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.37■■□□□ 1.97
GLIS3-216ENST00000490709 C4BP0C0L5 1744 aa27.36■■□□□ 1.97
GLIS3-216ENST00000490709 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.35■■□□□ 1.97
GLIS3-216ENST00000490709 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
GLIS3-216ENST00000490709 SIK1P57059 783 aa27.35■■□□□ 1.97
GLIS3-216ENST00000490709 CABP4P57796 275 aa27.35■■□□□ 1.97
GLIS3-216ENST00000490709 ATG3Q9NT62 314 aa27.35■■□□□ 1.97
GLIS3-216ENST00000490709 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
GLIS3-216ENST00000490709 SGIP1Q9BQI5 828 aa27.34■■□□□ 1.97
GLIS3-216ENST00000490709 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.32■■□□□ 1.96
GLIS3-216ENST00000490709 ATP6V1AP38606 617 aa27.32■■□□□ 1.96
GLIS3-216ENST00000490709 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
GLIS3-216ENST00000490709 AK7Q96M32 723 aa27.32■■□□□ 1.96
GLIS3-216ENST00000490709 CFAP53Q96M91 514 aa27.32■■□□□ 1.96
GLIS3-216ENST00000490709 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms