RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP38.59■■■■□ 3.77
HOXB3-211ENST00000490677 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa38.59■■■■□ 3.77
HOXB3-211ENST00000490677 LY75O60449 1722 aa38.58■■■■□ 3.77
HOXB3-211ENST00000490677 USHBP1Q8N6Y0 703 aa38.58■■■■□ 3.77
HOXB3-211ENST00000490677 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP38.58■■■■□ 3.77
HOXB3-211ENST00000490677 NCAPD2Q15021 1401 aa38.55■■■■□ 3.76
HOXB3-211ENST00000490677 PKD1L3Q7Z443 1732 aa38.55■■■■□ 3.76
HOXB3-211ENST00000490677 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP38.55■■■■□ 3.76
HOXB3-211ENST00000490677 CGNL1Q0VF96 1302 aa38.55■■■■□ 3.76
HOXB3-211ENST00000490677 NSD2O96028 1365 aa38.54■■■■□ 3.76
HOXB3-211ENST00000490677 SLC15A2Q16348 729 aa38.5■■■■□ 3.75
HOXB3-211ENST00000490677 POLR3GLQ9BT43 218 aa38.5■■■■□ 3.75
HOXB3-211ENST00000490677 SPON1Q9HCB6 807 aa38.5■■■■□ 3.75
HOXB3-211ENST00000490677 QSER1Q2KHR3 1735 aa38.49■■■■□ 3.75
HOXB3-211ENST00000490677 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa38.49■■■■□ 3.75
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC4BQ9NT99 713 aa38.48■■■■□ 3.75
HOXB3-211ENST00000490677 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa38.47■■■■□ 3.75
HOXB3-211ENST00000490677 STK32BQ9NY57 414 aa38.46■■■■□ 3.75
HOXB3-211ENST00000490677 ITGB4P16144 1822 aa38.45■■■■□ 3.75
HOXB3-211ENST00000490677 WASHC2AQ641Q2 1341 aa38.45■■■■□ 3.75
HOXB3-211ENST00000490677 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP38.45■■■■□ 3.75
HOXB3-211ENST00000490677 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa38.44■■■■□ 3.74
HOXB3-211ENST00000490677 POLKQ9UBT6 870 aa38.44■■■■□ 3.74
HOXB3-211ENST00000490677 PANK3Q9H999 370 aa38.43■■■■□ 3.74
HOXB3-211ENST00000490677 TATP17735 454 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF827Q17R98 1081 aa38.39■■■■□ 3.74
HOXB3-211ENST00000490677 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP38.38■■■■□ 3.73
HOXB3-211ENST00000490677 ZBTB7AO95365 584 aa38.37■■■■□ 3.73
HOXB3-211ENST00000490677 PTGER2P43116 358 aa38.37■■■■□ 3.73
HOXB3-211ENST00000490677 COL24A1Q17RW2 1714 aa38.36■■■■□ 3.73
HOXB3-211ENST00000490677 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP38.36■■■■□ 3.73
HOXB3-211ENST00000490677 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa38.36■■■■□ 3.73
HOXB3-211ENST00000490677 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa38.36■■■■□ 3.73
HOXB3-211ENST00000490677 CYP27B1O15528 508 aa38.35■■■■□ 3.73
HOXB3-211ENST00000490677 SLC27A3Q5K4L6 730 aa38.35■■■■□ 3.73
HOXB3-211ENST00000490677 AKT1S1Q96B36 256 aa38.34■■■■□ 3.73
HOXB3-211ENST00000490677 EYA1Q99502 592 aa38.34■■■■□ 3.73
HOXB3-211ENST00000490677 TAF1LQ8IZX4 1826 aa38.33■■■■□ 3.73
HOXB3-211ENST00000490677 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP38.31■■■■□ 3.72
HOXB3-211ENST00000490677 SGIP1Q9BQI5 828 aa38.31■■■■□ 3.72
HOXB3-211ENST00000490677 KCNQ4P56696 695 aa38.3■■■■□ 3.72
HOXB3-211ENST00000490677 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP38.29■■■■□ 3.72
HOXB3-211ENST00000490677 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP38.29■■■■□ 3.72
HOXB3-211ENST00000490677 C5P01031 1676 aa38.29■■■■□ 3.72
HOXB3-211ENST00000490677 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP38.28■■■■□ 3.72
HOXB3-211ENST00000490677 MTFR1LQ9H019 292 aa38.27■■■■□ 3.72
HOXB3-211ENST00000490677 KIF7Q2M1P5 1343 aa38.25■■■■□ 3.71
HOXB3-211ENST00000490677 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP38.22■■■■□ 3.71
HOXB3-211ENST00000490677 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa38.2■■■■□ 3.71
HOXB3-211ENST00000490677 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP38.2■■■■□ 3.71
HOXB3-211ENST00000490677 IGSF1Q8N6C5 1336 aa38.19■■■■□ 3.7
HOXB3-211ENST00000490677 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP38.18■■■■□ 3.7
HOXB3-211ENST00000490677 SPG7Q9UQ90 795 aa38.17■■■■□ 3.7
HOXB3-211ENST00000490677 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa38.17■■■■□ 3.7
HOXB3-211ENST00000490677 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP38.16■■■■□ 3.7
HOXB3-211ENST00000490677 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa38.14■■■■□ 3.7
HOXB3-211ENST00000490677 PALLDQ8WX93 1383 aa38.14■■■■□ 3.7
HOXB3-211ENST00000490677 MORC1Q86VD1 984 aa38.13■■■■□ 3.69
HOXB3-211ENST00000490677 KNSTRNQ9Y448 316 aa38.12■■■■□ 3.69
HOXB3-211ENST00000490677 C4BP0C0L5 1744 aa38.1■■■■□ 3.69
HOXB3-211ENST00000490677 PHKG2P15735 406 aa38.1■■■■□ 3.69
HOXB3-211ENST00000490677 SLC16A10Q8TF71 515 aa38.1■■■■□ 3.69
HOXB3-211ENST00000490677 PIGBQ92521 554 aa38.1■■■■□ 3.69
HOXB3-211ENST00000490677 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa38.1■■■■□ 3.69
HOXB3-211ENST00000490677 UBR3Q6ZT12 1888 aa38.09■■■■□ 3.69
HOXB3-211ENST00000490677 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP38.09■■■■□ 3.69
HOXB3-211ENST00000490677 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP38.09■■■■□ 3.69
HOXB3-211ENST00000490677 IFNL2Q8IZJ0 200 aa38.06■■■■□ 3.68
HOXB3-211ENST00000490677 SYT17Q9BSW7 474 aa38.06■■■■□ 3.68
HOXB3-211ENST00000490677 ARXQ96QS3 562 aa38.05■■■■□ 3.68
HOXB3-211ENST00000490677 MAP3K5Q99683 1374 aa38.05■■■■□ 3.68
HOXB3-211ENST00000490677 UTRNP46939 3433 aa38.04■■■■□ 3.68
HOXB3-211ENST00000490677 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.68
HOXB3-211ENST00000490677 AEBP1Q8IUX7 1158 aa38.01■■■■□ 3.68
HOXB3-211ENST00000490677 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.68
HOXB3-211ENST00000490677 KDRP35968 1356 aa38■■■■□ 3.67
HOXB3-211ENST00000490677 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF831Q5JPB2 1677 aa37.98■■■■□ 3.67
HOXB3-211ENST00000490677 IL13P35225 146 aa37.98■■■■□ 3.67
HOXB3-211ENST00000490677 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP37.97■■■■□ 3.67
HOXB3-211ENST00000490677 TMOD3Q9NYL9 352 aa37.96■■■■□ 3.67
HOXB3-211ENST00000490677 ASAP1Q9ULH1 1129 aa37.96■■■■□ 3.67
HOXB3-211ENST00000490677 SCN11AQ9UI33 1791 aa37.96■■■■□ 3.67
HOXB3-211ENST00000490677 AMIGO3Q86WK7 504 aa37.94■■■■□ 3.66
HOXB3-211ENST00000490677 CHD4Q14839 1912 aa37.92■■■■□ 3.66
HOXB3-211ENST00000490677 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP37.92■■■■□ 3.66
HOXB3-211ENST00000490677 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa37.91■■■■□ 3.66
HOXB3-211ENST00000490677 SIK1P57059 783 aa37.91■■■■□ 3.66
HOXB3-211ENST00000490677 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
HOXB3-211ENST00000490677 ATG3Q9NT62 314 aa37.91■■■■□ 3.66
HOXB3-211ENST00000490677 SULT6B1Q6IMI4 303 aa37.9■■■■□ 3.66
HOXB3-211ENST00000490677 MTHFSP49914 203 aa37.89■■■■□ 3.66
HOXB3-211ENST00000490677 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa37.89■■■■□ 3.66
HOXB3-211ENST00000490677 ERVV-2B6SEH9 535 aa37.88■■■■□ 3.65
HOXB3-211ENST00000490677 POLD1P28340 1107 aa37.88■■■■□ 3.65
HOXB3-211ENST00000490677 AMOTQ4VCS5 1084 aa37.88■■■■□ 3.65
HOXB3-211ENST00000490677 LINC00116Q8NCU8 138 aa37.88■■■■□ 3.65
HOXB3-211ENST00000490677 DCAF5Q96JK2 942 aa37.88■■■■□ 3.65
HOXB3-211ENST00000490677 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
HOXB3-211ENST00000490677 ITPK1Q13572 414 aa37.87■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms