RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489616.1

THUMPD3-AS1-206, THUMPD3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene THUMPD3-AS1, Length 583 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TMC1Q8TDI8 760 aa22.62■■□□□ 1.21
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 KCNQ4P56696 695 aa22.61■■□□□ 1.21
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 IP6K1Q92551 441 aa22.61■■□□□ 1.21
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ATP10DQ9P241 1426 aa22.61■■□□□ 1.21
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.59■■□□□ 1.21
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 NSD2O96028 1365 aa22.59■■□□□ 1.21
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 USP47Q96K76 1375 aa22.57■■□□□ 1.2
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 A0A1W2PP64 1363 aa22.55■■□□□ 1.2
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.55■■□□□ 1.2
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MSL1Q68DK7 614 aa22.54■■□□□ 1.2
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.54■■□□□ 1.2
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 HSPA6P17066 643 aa22.52■■□□□ 1.2
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.52■■□□□ 1.2
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MEGF6O75095 1541 aa22.52■■□□□ 1.19
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ADCY9O60503 1353 aa22.51■■□□□ 1.19
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THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 C5P01031 1676 aa22.51■■□□□ 1.19
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 HOXC9P31274 260 aa22.5■■□□□ 1.19
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.5■■□□□ 1.19
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.5■■□□□ 1.19
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 COG3Q96JB2 828 aa22.49■■□□□ 1.19
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.49■■□□□ 1.19
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 NEUROD1Q13562 356 aa22.48■■□□□ 1.19
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THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.48■■□□□ 1.19
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THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 RTL1A6NKG5 1358 aa22.47■■□□□ 1.19
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.45■■□□□ 1.18
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.43■■□□□ 1.18
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.43■■□□□ 1.18
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PALLDQ8WX93 1383 aa22.43■■□□□ 1.18
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.41■■□□□ 1.18
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.41■■□□□ 1.18
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.41■■□□□ 1.18
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 AK7Q96M32 723 aa22.41■■□□□ 1.18
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 C4BP0C0L5 1744 aa22.4■■□□□ 1.18
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.4■■□□□ 1.18
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 NBPF4Q96M43 638 aa22.4■■□□□ 1.18
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.37■■□□□ 1.17
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.37■■□□□ 1.17
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 FBLN1P23142 703 aa22.36■■□□□ 1.17
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.35■■□□□ 1.17
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THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.34■■□□□ 1.17
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 KIF3CO14782 793 aa22.34■■□□□ 1.17
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SLC24A1O60721 1099 aa22.34■■□□□ 1.17
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PHF14O94880 888 aa22.34■■□□□ 1.17
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 APLP1P51693 650 aa22.34■■□□□ 1.17
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.34■■□□□ 1.17
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SSFA2P28290 1259 aa22.33■■□□□ 1.17
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ITGB4P16144 1822 aa22.31■■□□□ 1.16
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 INSRP06213 1382 aa22.31■■□□□ 1.16
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.3■■□□□ 1.16
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 FLT4P35916 1363 aa22.29■■□□□ 1.16
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.29■■□□□ 1.16
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CYP27B1O15528 508 aa22.29■■□□□ 1.16
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TESK2Q96S53 571 aa22.28■■□□□ 1.16
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.28■■□□□ 1.16
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.27■■□□□ 1.16
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.26■■□□□ 1.15
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 FYB1O15117 783 aa22.26■■□□□ 1.15
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TOMM70O94826 608 aa22.26■■□□□ 1.15
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SIK1P57059 783 aa22.26■■□□□ 1.15
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.26■■□□□ 1.15
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PIGBQ92521 554 aa22.26■■□□□ 1.15
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TONSLQ96HA7 1378 aa22.25■■□□□ 1.15
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.24■■□□□ 1.15
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 GNPATO15228 680 aa22.24■■□□□ 1.15
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SMIM5Q71RC9 77 aa22.24■■□□□ 1.15
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.24■■□□□ 1.15
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.23■■□□□ 1.15
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MMP10P09238 476 aa22.23■■□□□ 1.15
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.22■■□□□ 1.15
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.22■■□□□ 1.15
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.22■■□□□ 1.15
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SPG7Q9UQ90 795 aa22.22■■□□□ 1.15
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TGFB2P61812 414 aa22.21■■□□□ 1.15
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.2■■□□□ 1.14
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 BCS1LQ9Y276 419 aa22.2■■□□□ 1.14
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 NCAPD2Q15021 1401 aa22.19■■□□□ 1.14
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.18■■□□□ 1.14
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ATP6V1AP38606 617 aa22.18■■□□□ 1.14
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.17■■□□□ 1.14
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ITPK1Q13572 414 aa22.17■■□□□ 1.14
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.17■■□□□ 1.14
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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