RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487577.5

TYMP-208, Transcript of thymidine phosphorylase, human

TSL 1 (best)

Gene TYMP, Length 1,751 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TYMP-208	ENST00000487577	NCAPD2	Q15021	1401 aa		31.8	■■■□□ 2.68
TYMP-208	ENST00000487577	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
TYMP-208	ENST00000487577	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		31.79	■■■□□ 2.68
TYMP-208	ENST00000487577	CHRNA2	Q15822	529 aa		31.79	■■■□□ 2.68
TYMP-208	ENST00000487577	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		31.79	■■■□□ 2.68
TYMP-208	ENST00000487577	MAP3K5	Q99683	1374 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TYMP-208	ENST00000487577	PDE3A	Q14432	1141 aa		31.77	■■■□□ 2.68
TYMP-208	ENST00000487577	CRB1	P82279	1406 aa		31.77	■■■□□ 2.68
TYMP-208	ENST00000487577	ZNF428	Q96B54	188 aa		31.76	■■■□□ 2.68
TYMP-208	ENST00000487577	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		31.76	■■■□□ 2.67
TYMP-208	ENST00000487577	CHL1	O00533	1208 aa		31.76	■■■□□ 2.67
TYMP-208	ENST00000487577	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TYMP-208	ENST00000487577	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TYMP-208	ENST00000487577	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
TYMP-208	ENST00000487577	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TYMP-208	ENST00000487577	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TYMP-208	ENST00000487577	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TYMP-208	ENST00000487577	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TYMP-208	ENST00000487577	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TYMP-208	ENST00000487577	ABCA3	Q99758	1704 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TYMP-208	ENST00000487577	VAMP4	O75379	141 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TYMP-208	ENST00000487577	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
TYMP-208	ENST00000487577	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	31.71	■■■□□ 2.67
TYMP-208	ENST00000487577	TSPYL6	Q8N831	410 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TYMP-208	ENST00000487577	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		31.7	■■■□□ 2.67
TYMP-208	ENST00000487577	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
TYMP-208	ENST00000487577	LRRC37A3	O60309	1634 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TYMP-208	ENST00000487577	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		31.68	■■■□□ 2.66
TYMP-208	ENST00000487577	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
TYMP-208	ENST00000487577	PANK1	Q8TE04	598 aa		31.68	■■■□□ 2.66
TYMP-208	ENST00000487577	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TYMP-208	ENST00000487577	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TYMP-208	ENST00000487577	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
TYMP-208	ENST00000487577	KIF16B	Q96L93	1317 aa		31.66	■■■□□ 2.66
TYMP-208	ENST00000487577	MS4A1	P11836	297 aa		31.66	■■■□□ 2.66
TYMP-208	ENST00000487577	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		31.66	■■■□□ 2.66
TYMP-208	ENST00000487577	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		31.66	■■■□□ 2.66
TYMP-208	ENST00000487577	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		31.65	■■■□□ 2.66
TYMP-208	ENST00000487577	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		31.64	■■■□□ 2.66
TYMP-208	ENST00000487577	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
TYMP-208	ENST00000487577	COG6	Q9Y2V7	657 aa		31.63	■■■□□ 2.65
TYMP-208	ENST00000487577	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
TYMP-208	ENST00000487577	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
TYMP-208	ENST00000487577	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	31.61	■■■□□ 2.65
TYMP-208	ENST00000487577	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	31.61	■■■□□ 2.65
TYMP-208	ENST00000487577	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		31.61	■■■□□ 2.65
TYMP-208	ENST00000487577	TNN	Q9UQP3	1299 aa		31.61	■■■□□ 2.65
TYMP-208	ENST00000487577	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
TYMP-208	ENST00000487577	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		31.6	■■■□□ 2.65
TYMP-208	ENST00000487577	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
TYMP-208	ENST00000487577	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		31.6	■■■□□ 2.65
TYMP-208	ENST00000487577	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		31.6	■■■□□ 2.65
TYMP-208	ENST00000487577	RLBP1	P12271	317 aa		31.59	■■■□□ 2.65
TYMP-208	ENST00000487577	KRT24	Q2M2I5	525 aa		31.58	■■■□□ 2.65
TYMP-208	ENST00000487577	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	31.58	■■■□□ 2.65
TYMP-208	ENST00000487577	TOM1	O60784	492 aa		31.58	■■■□□ 2.65
TYMP-208	ENST00000487577	TRIM27	P14373	513 aa		31.58	■■■□□ 2.65
TYMP-208	ENST00000487577	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		31.57	■■■□□ 2.65
TYMP-208	ENST00000487577	LGR6	Q9HBX8	967 aa		31.56	■■■□□ 2.64
TYMP-208	ENST00000487577	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	31.56	■■■□□ 2.64
TYMP-208	ENST00000487577	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		31.56	■■■□□ 2.64
TYMP-208	ENST00000487577	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		31.56	■■■□□ 2.64
TYMP-208	ENST00000487577	SPG7	Q9UQ90	795 aa		31.55	■■■□□ 2.64
TYMP-208	ENST00000487577	MEGF6	O75095	1541 aa		31.55	■■■□□ 2.64
TYMP-208	ENST00000487577	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		31.55	■■■□□ 2.64
TYMP-208	ENST00000487577	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	31.54	■■■□□ 2.64
TYMP-208	ENST00000487577	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	31.53	■■■□□ 2.64
TYMP-208	ENST00000487577	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	31.53	■■■□□ 2.64
TYMP-208	ENST00000487577	TEF	Q10587	303 aa		31.53	■■■□□ 2.64
TYMP-208	ENST00000487577	PHLPP1	O60346	1717 aa		31.52	■■■□□ 2.64
TYMP-208	ENST00000487577	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	31.52	■■■□□ 2.64
TYMP-208	ENST00000487577	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	31.52	■■■□□ 2.64
TYMP-208	ENST00000487577	EVA1C	P58658	441 aa		31.51	■■■□□ 2.64
TYMP-208	ENST00000487577	AAMP	Q13685	434 aa		31.51	■■■□□ 2.64
TYMP-208	ENST00000487577	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		31.51	■■■□□ 2.64
TYMP-208	ENST00000487577	PIP4K2B	P78356	416 aa		31.51	■■■□□ 2.63
TYMP-208	ENST00000487577	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		31.51	■■■□□ 2.63
TYMP-208	ENST00000487577	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	31.5	■■■□□ 2.63
TYMP-208	ENST00000487577	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
TYMP-208	ENST00000487577	STRN4	Q9NRL3	753 aa		31.49	■■■□□ 2.63
TYMP-208	ENST00000487577	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		31.46	■■■□□ 2.63
TYMP-208	ENST00000487577	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	31.46	■■■□□ 2.63
TYMP-208	ENST00000487577	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		31.45	■■■□□ 2.63
TYMP-208	ENST00000487577	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		31.45	■■■□□ 2.63
TYMP-208	ENST00000487577	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
TYMP-208	ENST00000487577	PHKG2	P15735	406 aa		31.45	■■■□□ 2.62
TYMP-208	ENST00000487577	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		31.45	■■■□□ 2.62
TYMP-208	ENST00000487577	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		31.45	■■■□□ 2.62
TYMP-208	ENST00000487577	BTBD11	A6QL63	1104 aa		31.44	■■■□□ 2.62
TYMP-208	ENST00000487577	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
TYMP-208	ENST00000487577	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		31.44	■■■□□ 2.62
TYMP-208	ENST00000487577	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
TYMP-208	ENST00000487577	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		31.43	■■■□□ 2.62
TYMP-208	ENST00000487577	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
TYMP-208	ENST00000487577	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
TYMP-208	ENST00000487577	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		31.43	■■■□□ 2.62
TYMP-208	ENST00000487577	BTG4	Q9NY30	223 aa		31.43	■■■□□ 2.62
TYMP-208	ENST00000487577	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		31.42	■■■□□ 2.62
TYMP-208	ENST00000487577	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
TYMP-208	ENST00000487577	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		31.4	■■■□□ 2.62

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