RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485537.1

TTL-204, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

TSL 3

Gene TTL, Length 1,094 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-204ENST00000485537 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa32.07■■■□□ 2.73
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TTL-204ENST00000485537 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP32.04■■■□□ 2.72
TTL-204ENST00000485537 IP6K1Q92551 441 aa32.04■■■□□ 2.72
TTL-204ENST00000485537 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
TTL-204ENST00000485537 SIN3AQ96ST3 1273 aa32.03■■■□□ 2.72
TTL-204ENST00000485537 NEUROD1Q13562 356 aa32.02■■■□□ 2.72
TTL-204ENST00000485537 TERF2IPQ9NYB0 399 aa32.02■■■□□ 2.72
TTL-204ENST00000485537 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa32.01■■■□□ 2.71
TTL-204ENST00000485537 A0A1W2PP64 1363 aa32■■■□□ 2.71
TTL-204ENST00000485537 NSD2O96028 1365 aa32■■■□□ 2.71
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TTL-204ENST00000485537 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
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TTL-204ENST00000485537 CYP27B1O15528 508 aa31.6■■■□□ 2.65
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TTL-204ENST00000485537 FYB1O15117 783 aa31.58■■■□□ 2.65
TTL-204ENST00000485537 SLC24A1O60721 1099 aa31.58■■■□□ 2.65
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TTL-204ENST00000485537 GNPATO15228 680 aa31.53■■■□□ 2.64
TTL-204ENST00000485537 SIK1P57059 783 aa31.53■■■□□ 2.64
TTL-204ENST00000485537 LINC00116Q8NCU8 138 aa31.53■■■□□ 2.64
TTL-204ENST00000485537 KIF24Q5T7B8 1368 aa31.53■■■□□ 2.64
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TTL-204ENST00000485537 ITPK1Q13572 414 aa31.44■■■□□ 2.62
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TTL-204ENST00000485537 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa31.44■■■□□ 2.62
TTL-204ENST00000485537 ASAP1Q9ULH1 1129 aa31.43■■■□□ 2.62
TTL-204ENST00000485537 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa31.41■■■□□ 2.62
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