RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485300.1

IL6-209, Transcript of interleukin 6, human

TSL 1 (best)

Gene IL6, Length 985 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IL6-209	ENST00000485300	NUDC	Q9Y266	331 aa		33.11	■■■□□ 2.89
IL6-209	ENST00000485300	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
IL6-209	ENST00000485300	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		33.08	■■■□□ 2.89
IL6-209	ENST00000485300	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
IL6-209	ENST00000485300	ANP32C	O43423	234 aa		33.06	■■■□□ 2.88
IL6-209	ENST00000485300	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	33.06	■■■□□ 2.88
IL6-209	ENST00000485300	HMOX1	P09601	288 aa		33.05	■■■□□ 2.88
IL6-209	ENST00000485300	SPG7	Q9UQ90	795 aa		33.05	■■■□□ 2.88
IL6-209	ENST00000485300	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		33.05	■■■□□ 2.88
IL6-209	ENST00000485300	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		33.04	■■■□□ 2.88
IL6-209	ENST00000485300	KDR	P35968	1356 aa		33.04	■■■□□ 2.88
IL6-209	ENST00000485300	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		33.03	■■■□□ 2.88
IL6-209	ENST00000485300	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		33.03	■■■□□ 2.88
IL6-209	ENST00000485300	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		33.02	■■■□□ 2.88
IL6-209	ENST00000485300	EP400	Q96L91	3159 aa		33.01	■■■□□ 2.88
IL6-209	ENST00000485300	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
IL6-209	ENST00000485300	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
IL6-209	ENST00000485300	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	32.99	■■■□□ 2.87
IL6-209	ENST00000485300	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
IL6-209	ENST00000485300	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	32.99	■■■□□ 2.87
IL6-209	ENST00000485300	CCDC125	Q86Z20	511 aa		32.98	■■■□□ 2.87
IL6-209	ENST00000485300	BCL9	O00512	1426 aa		32.97	■■■□□ 2.87
IL6-209	ENST00000485300	TRIM37	O94972	964 aa		32.97	■■■□□ 2.87
IL6-209	ENST00000485300	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.96	■■■□□ 2.87
IL6-209	ENST00000485300	SBF2	Q86WG5	1849 aa		32.95	■■■□□ 2.86
IL6-209	ENST00000485300	CYP27B1	O15528	508 aa		32.93	■■■□□ 2.86
IL6-209	ENST00000485300	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		32.92	■■■□□ 2.86
IL6-209	ENST00000485300	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
IL6-209	ENST00000485300	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.91	■■■□□ 2.86
IL6-209	ENST00000485300	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
IL6-209	ENST00000485300	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		32.89	■■■□□ 2.86
IL6-209	ENST00000485300	PHKG2	P15735	406 aa		32.88	■■■□□ 2.85
IL6-209	ENST00000485300	PRKAR2B	P31323	418 aa		32.88	■■■□□ 2.85
IL6-209	ENST00000485300	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		32.88	■■■□□ 2.85
IL6-209	ENST00000485300	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		32.88	■■■□□ 2.85
IL6-209	ENST00000485300	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		32.88	■■■□□ 2.85
IL6-209	ENST00000485300	NHS	Q6T4R5	1651 aa		32.88	■■■□□ 2.85
IL6-209	ENST00000485300	FCHSD2	O94868	740 aa		32.87	■■■□□ 2.85
IL6-209	ENST00000485300	BAG6	P46379	1132 aa		32.86	■■■□□ 2.85
IL6-209	ENST00000485300	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
IL6-209	ENST00000485300	APBA3	O96018	575 aa		32.85	■■■□□ 2.85
IL6-209	ENST00000485300	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	32.85	■■■□□ 2.85
IL6-209	ENST00000485300	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
IL6-209	ENST00000485300	NEFM	P07197	916 aa		32.84	■■■□□ 2.85
IL6-209	ENST00000485300	KCNQ2	O43526	872 aa		32.83	■■■□□ 2.85
IL6-209	ENST00000485300	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
IL6-209	ENST00000485300	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
IL6-209	ENST00000485300	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
IL6-209	ENST00000485300	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
IL6-209	ENST00000485300	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
IL6-209	ENST00000485300	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		32.8	■■■□□ 2.84
IL6-209	ENST00000485300	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		32.8	■■■□□ 2.84
IL6-209	ENST00000485300	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		32.8	■■■□□ 2.84
IL6-209	ENST00000485300	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		32.79	■■■□□ 2.84
IL6-209	ENST00000485300	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		32.78	■■■□□ 2.84
IL6-209	ENST00000485300	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32.77	■■■□□ 2.84
IL6-209	ENST00000485300	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		32.76	■■■□□ 2.83
IL6-209	ENST00000485300	MRS2	Q9HD23	443 aa		32.76	■■■□□ 2.83
IL6-209	ENST00000485300	BTAF1	O14981	1849 aa		32.76	■■■□□ 2.83
IL6-209	ENST00000485300	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
IL6-209	ENST00000485300	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		32.75	■■■□□ 2.83
IL6-209	ENST00000485300	ITGB4	P16144	1822 aa		32.73	■■■□□ 2.83
IL6-209	ENST00000485300	CCDC184	Q52MB2	194 aa		32.73	■■■□□ 2.83
IL6-209	ENST00000485300	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
IL6-209	ENST00000485300	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.73	■■■□□ 2.83
IL6-209	ENST00000485300	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
IL6-209	ENST00000485300	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.71	■■■□□ 2.83
IL6-209	ENST00000485300	MAP3K5	Q99683	1374 aa		32.7	■■■□□ 2.83
IL6-209	ENST00000485300	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		32.7	■■■□□ 2.83
IL6-209	ENST00000485300	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		32.69	■■■□□ 2.82
IL6-209	ENST00000485300	PLSCR1	O15162	318 aa		32.69	■■■□□ 2.82
IL6-209	ENST00000485300	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
IL6-209	ENST00000485300	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		32.69	■■■□□ 2.82
IL6-209	ENST00000485300	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
IL6-209	ENST00000485300	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		32.68	■■■□□ 2.82
IL6-209	ENST00000485300	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		32.68	■■■□□ 2.82
IL6-209	ENST00000485300	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.68	■■■□□ 2.82
IL6-209	ENST00000485300	CABP4	P57796	275 aa		32.67	■■■□□ 2.82
IL6-209	ENST00000485300	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		32.67	■■■□□ 2.82
IL6-209	ENST00000485300	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
IL6-209	ENST00000485300	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		32.66	■■■□□ 2.82
IL6-209	ENST00000485300	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
IL6-209	ENST00000485300	PIGB	Q92521	554 aa		32.64	■■■□□ 2.82
IL6-209	ENST00000485300	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
IL6-209	ENST00000485300	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.63	■■■□□ 2.81
IL6-209	ENST00000485300	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.62	■■■□□ 2.81
IL6-209	ENST00000485300	RUNDC1	Q96C34	613 aa		32.62	■■■□□ 2.81
IL6-209	ENST00000485300	RREB1	Q92766	1687 aa		32.6	■■■□□ 2.81
IL6-209	ENST00000485300	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		32.6	■■■□□ 2.81
IL6-209	ENST00000485300	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
IL6-209	ENST00000485300	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
IL6-209	ENST00000485300	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32.58	■■■□□ 2.81
IL6-209	ENST00000485300	TXNRD1	Q16881	649 aa		32.58	■■■□□ 2.81
IL6-209	ENST00000485300	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.58	■■■□□ 2.81
IL6-209	ENST00000485300	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		32.58	■■■□□ 2.81
IL6-209	ENST00000485300	MRC1	P22897	1456 aa		32.57	■■■□□ 2.8
IL6-209	ENST00000485300	TEF	Q10587	303 aa		32.57	■■■□□ 2.8
IL6-209	ENST00000485300	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.57	■■■□□ 2.8
IL6-209	ENST00000485300	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		32.55	■■■□□ 2.8
IL6-209	ENST00000485300	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8

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