RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
ACTB-212ENST00000484841 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
ACTB-212ENST00000484841 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
ACTB-212ENST00000484841 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
ACTB-212ENST00000484841 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.89■■■□□ 2.05
ACTB-212ENST00000484841 INSRP06213 1382 aa27.88■■■□□ 2.05
ACTB-212ENST00000484841 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.88■■■□□ 2.05
ACTB-212ENST00000484841 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.88■■■□□ 2.05
ACTB-212ENST00000484841 CARD14Q9BXL6 1004 aa27.88■■■□□ 2.05
ACTB-212ENST00000484841 MEGF6O75095 1541 aa27.87■■■□□ 2.05
ACTB-212ENST00000484841 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
ACTB-212ENST00000484841 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
ACTB-212ENST00000484841 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.86■■■□□ 2.05
ACTB-212ENST00000484841 MTFR1LQ9H019 292 aa27.86■■■□□ 2.05
ACTB-212ENST00000484841 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.86■■■□□ 2.05
ACTB-212ENST00000484841 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.84■■■□□ 2.05
ACTB-212ENST00000484841 PAPPAQ13219 1627 aa27.83■■■□□ 2.05
ACTB-212ENST00000484841 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.81■■■□□ 2.04
ACTB-212ENST00000484841 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.81■■■□□ 2.04
ACTB-212ENST00000484841 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
ACTB-212ENST00000484841 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa27.8■■■□□ 2.04
ACTB-212ENST00000484841 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27.8■■■□□ 2.04
ACTB-212ENST00000484841 PTGER2P43116 358 aa27.79■■■□□ 2.04
ACTB-212ENST00000484841 ZNF827Q17R98 1081 aa27.78■■■□□ 2.04
ACTB-212ENST00000484841 LY75O60449 1722 aa27.77■■■□□ 2.04
ACTB-212ENST00000484841 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27.76■■■□□ 2.03
ACTB-212ENST00000484841 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
ACTB-212ENST00000484841 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
ACTB-212ENST00000484841 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
ACTB-212ENST00000484841 AKT1S1Q96B36 256 aa27.74■■■□□ 2.03
ACTB-212ENST00000484841 QSER1Q2KHR3 1735 aa27.74■■■□□ 2.03
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa27.74■■■□□ 2.03
ACTB-212ENST00000484841 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.73■■■□□ 2.03
ACTB-212ENST00000484841 YY1P25490 414 aa27.73■■■□□ 2.03
ACTB-212ENST00000484841 NSD2O96028 1365 aa27.73■■■□□ 2.03
ACTB-212ENST00000484841 KCNQ4P56696 695 aa27.72■■■□□ 2.03
ACTB-212ENST00000484841 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.72■■■□□ 2.03
ACTB-212ENST00000484841 ARXQ96QS3 562 aa27.72■■■□□ 2.03
ACTB-212ENST00000484841 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
ACTB-212ENST00000484841 SPG7Q9UQ90 795 aa27.72■■■□□ 2.03
ACTB-212ENST00000484841 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
ACTB-212ENST00000484841 POLD1P28340 1107 aa27.7■■■□□ 2.02
ACTB-212ENST00000484841 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.69■■■□□ 2.02
ACTB-212ENST00000484841 SYT17Q9BSW7 474 aa27.69■■■□□ 2.02
ACTB-212ENST00000484841 PANK3Q9H999 370 aa27.68■■■□□ 2.02
ACTB-212ENST00000484841 POLKQ9UBT6 870 aa27.68■■■□□ 2.02
ACTB-212ENST00000484841 PKD1L3Q7Z443 1732 aa27.67■■■□□ 2.02
ACTB-212ENST00000484841 MSH5O43196 834 aa27.67■■■□□ 2.02
ACTB-212ENST00000484841 SGIP1Q9BQI5 828 aa27.67■■■□□ 2.02
ACTB-212ENST00000484841 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.67■■■□□ 2.02
ACTB-212ENST00000484841 CYP27B1O15528 508 aa27.66■■■□□ 2.02
ACTB-212ENST00000484841 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.66■■■□□ 2.02
ACTB-212ENST00000484841 ITGB4P16144 1822 aa27.65■■■□□ 2.02
ACTB-212ENST00000484841 EYA1Q99502 592 aa27.65■■■□□ 2.02
ACTB-212ENST00000484841 KLHL34Q8N239 644 aa27.64■■■□□ 2.02
ACTB-212ENST00000484841 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
ACTB-212ENST00000484841 PALLDQ8WX93 1383 aa27.62■■■□□ 2.01
ACTB-212ENST00000484841 NCAPD2Q15021 1401 aa27.62■■■□□ 2.01
ACTB-212ENST00000484841 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.62■■■□□ 2.01
ACTB-212ENST00000484841 C5P01031 1676 aa27.62■■■□□ 2.01
ACTB-212ENST00000484841 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.59■■■□□ 2.01
ACTB-212ENST00000484841 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
ACTB-212ENST00000484841 MORC1Q86VD1 984 aa27.59■■■□□ 2.01
ACTB-212ENST00000484841 IFNL2Q8IZJ0 200 aa27.59■■■□□ 2.01
ACTB-212ENST00000484841 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
ACTB-212ENST00000484841 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.57■■■□□ 2
ACTB-212ENST00000484841 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.57■■■□□ 2
ACTB-212ENST00000484841 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.57■■■□□ 2
ACTB-212ENST00000484841 MAP3K5Q99683 1374 aa27.57■■■□□ 2
ACTB-212ENST00000484841 FLAD1Q8NFF5 587 aa27.56■■■□□ 2
ACTB-212ENST00000484841 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.55■■■□□ 2
ACTB-212ENST00000484841 PIGBQ92521 554 aa27.55■■■□□ 2
ACTB-212ENST00000484841 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
ACTB-212ENST00000484841 AK7Q96M32 723 aa27.54■■■□□ 2
ACTB-212ENST00000484841 PHKG2P15735 406 aa27.53■■■□□ 2
ACTB-212ENST00000484841 GPR162Q16538 588 aa27.52■■■□□ 2
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.51■■□□□ 1.99
ACTB-212ENST00000484841 C4BP0C0L5 1744 aa27.5■■□□□ 1.99
ACTB-212ENST00000484841 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.5■■□□□ 1.99
ACTB-212ENST00000484841 CHD4Q14839 1912 aa27.5■■□□□ 1.99
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
ACTB-212ENST00000484841 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
ACTB-212ENST00000484841 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
ACTB-212ENST00000484841 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.47■■□□□ 1.99
ACTB-212ENST00000484841 SIK1P57059 783 aa27.47■■□□□ 1.99
ACTB-212ENST00000484841 MSL1Q68DK7 614 aa27.47■■□□□ 1.99
ACTB-212ENST00000484841 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.46■■□□□ 1.99
ACTB-212ENST00000484841 PHF14O94880 888 aa27.44■■□□□ 1.98
ACTB-212ENST00000484841 ATP6V1AP38606 617 aa27.44■■□□□ 1.98
ACTB-212ENST00000484841 ASAP1Q9ULH1 1129 aa27.44■■□□□ 1.98
ACTB-212ENST00000484841 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.43■■□□□ 1.98
ACTB-212ENST00000484841 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
ACTB-212ENST00000484841 DCAF5Q96JK2 942 aa27.43■■□□□ 1.98
ACTB-212ENST00000484841 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.42■■□□□ 1.98
ACTB-212ENST00000484841 ERVV-2B6SEH9 535 aa27.42■■□□□ 1.98
ACTB-212ENST00000484841 UBR3Q6ZT12 1888 aa27.42■■□□□ 1.98
ACTB-212ENST00000484841 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
ACTB-212ENST00000484841 ATG3Q9NT62 314 aa27.4■■□□□ 1.98
ACTB-212ENST00000484841 SSFA2P28290 1259 aa27.39■■□□□ 1.98
ACTB-212ENST00000484841 CABP4P57796 275 aa27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms