RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.9■■□□□ 1.74
UPP1-211ENST00000482015 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
UPP1-211ENST00000482015 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
UPP1-211ENST00000482015 POLKQ9UBT6 870 aa25.87■■□□□ 1.73
UPP1-211ENST00000482015 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
UPP1-211ENST00000482015 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
UPP1-211ENST00000482015 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.86■■□□□ 1.73
UPP1-211ENST00000482015 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
UPP1-211ENST00000482015 STK32BQ9NY57 414 aa25.84■■□□□ 1.73
UPP1-211ENST00000482015 SLC15A2Q16348 729 aa25.83■■□□□ 1.73
UPP1-211ENST00000482015 BTAF1O14981 1849 aa25.82■■□□□ 1.72
UPP1-211ENST00000482015 SPON1Q9HCB6 807 aa25.82■■□□□ 1.72
UPP1-211ENST00000482015 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.82■■□□□ 1.72
UPP1-211ENST00000482015 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.81■■□□□ 1.72
UPP1-211ENST00000482015 EYA1Q99502 592 aa25.79■■□□□ 1.72
UPP1-211ENST00000482015 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.79■■□□□ 1.72
UPP1-211ENST00000482015 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.79■■□□□ 1.72
UPP1-211ENST00000482015 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.78■■□□□ 1.72
UPP1-211ENST00000482015 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.78■■□□□ 1.72
UPP1-211ENST00000482015 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.78■■□□□ 1.72
UPP1-211ENST00000482015 NSD2O96028 1365 aa25.78■■□□□ 1.72
UPP1-211ENST00000482015 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
UPP1-211ENST00000482015 ZBTB7AO95365 584 aa25.77■■□□□ 1.72
UPP1-211ENST00000482015 CYP27B1O15528 508 aa25.76■■□□□ 1.71
UPP1-211ENST00000482015 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
UPP1-211ENST00000482015 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.76■■□□□ 1.71
UPP1-211ENST00000482015 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.76■■□□□ 1.71
UPP1-211ENST00000482015 NCAPD2Q15021 1401 aa25.75■■□□□ 1.71
UPP1-211ENST00000482015 KCNQ4P56696 695 aa25.75■■□□□ 1.71
UPP1-211ENST00000482015 MORC1Q86VD1 984 aa25.75■■□□□ 1.71
UPP1-211ENST00000482015 ZNF827Q17R98 1081 aa25.74■■□□□ 1.71
UPP1-211ENST00000482015 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
UPP1-211ENST00000482015 CASZ1Q86V15 1759 aa25.74■■□□□ 1.71
UPP1-211ENST00000482015 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.73■■□□□ 1.71
UPP1-211ENST00000482015 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
UPP1-211ENST00000482015 PAPPAQ13219 1627 aa25.72■■□□□ 1.71
UPP1-211ENST00000482015 SPG7Q9UQ90 795 aa25.7■■□□□ 1.7
UPP1-211ENST00000482015 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
UPP1-211ENST00000482015 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.69■■□□□ 1.7
UPP1-211ENST00000482015 AKT1S1Q96B36 256 aa25.69■■□□□ 1.7
UPP1-211ENST00000482015 PTGER2P43116 358 aa25.67■■□□□ 1.7
UPP1-211ENST00000482015 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
UPP1-211ENST00000482015 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.7
UPP1-211ENST00000482015 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.66■■□□□ 1.7
UPP1-211ENST00000482015 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
UPP1-211ENST00000482015 MTFR1LQ9H019 292 aa25.65■■□□□ 1.7
UPP1-211ENST00000482015 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.64■■□□□ 1.7
UPP1-211ENST00000482015 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
UPP1-211ENST00000482015 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.63■■□□□ 1.69
UPP1-211ENST00000482015 PHKG2P15735 406 aa25.62■■□□□ 1.69
UPP1-211ENST00000482015 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.62■■□□□ 1.69
UPP1-211ENST00000482015 LY75O60449 1722 aa25.62■■□□□ 1.69
UPP1-211ENST00000482015 PIGBQ92521 554 aa25.61■■□□□ 1.69
UPP1-211ENST00000482015 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.61■■□□□ 1.69
UPP1-211ENST00000482015 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.6■■□□□ 1.69
UPP1-211ENST00000482015 PALLDQ8WX93 1383 aa25.6■■□□□ 1.69
UPP1-211ENST00000482015 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.6■■□□□ 1.69
UPP1-211ENST00000482015 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
UPP1-211ENST00000482015 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.59■■□□□ 1.69
UPP1-211ENST00000482015 IL13P35225 146 aa25.56■■□□□ 1.68
UPP1-211ENST00000482015 MTHFSP49914 203 aa25.56■■□□□ 1.68
UPP1-211ENST00000482015 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
UPP1-211ENST00000482015 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
UPP1-211ENST00000482015 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
UPP1-211ENST00000482015 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.55■■□□□ 1.68
UPP1-211ENST00000482015 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.54■■□□□ 1.68
UPP1-211ENST00000482015 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.54■■□□□ 1.68
UPP1-211ENST00000482015 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
UPP1-211ENST00000482015 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.54■■□□□ 1.68
UPP1-211ENST00000482015 ARXQ96QS3 562 aa25.53■■□□□ 1.68
UPP1-211ENST00000482015 ITGB4P16144 1822 aa25.53■■□□□ 1.68
UPP1-211ENST00000482015 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.52■■□□□ 1.68
UPP1-211ENST00000482015 MSH5O43196 834 aa25.51■■□□□ 1.67
UPP1-211ENST00000482015 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.51■■□□□ 1.67
UPP1-211ENST00000482015 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
UPP1-211ENST00000482015 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
UPP1-211ENST00000482015 SYT17Q9BSW7 474 aa25.51■■□□□ 1.67
UPP1-211ENST00000482015 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.49■■□□□ 1.67
UPP1-211ENST00000482015 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.49■■□□□ 1.67
UPP1-211ENST00000482015 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.48■■□□□ 1.67
UPP1-211ENST00000482015 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
UPP1-211ENST00000482015 SIK1P57059 783 aa25.48■■□□□ 1.67
UPP1-211ENST00000482015 DCAF5Q96JK2 942 aa25.48■■□□□ 1.67
UPP1-211ENST00000482015 ATG3Q9NT62 314 aa25.48■■□□□ 1.67
UPP1-211ENST00000482015 KDRP35968 1356 aa25.47■■□□□ 1.67
UPP1-211ENST00000482015 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25.47■■□□□ 1.67
UPP1-211ENST00000482015 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.47■■□□□ 1.67
UPP1-211ENST00000482015 C5P01031 1676 aa25.47■■□□□ 1.67
UPP1-211ENST00000482015 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
UPP1-211ENST00000482015 POLD1P28340 1107 aa25.46■■□□□ 1.67
UPP1-211ENST00000482015 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.45■■□□□ 1.67
UPP1-211ENST00000482015 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.45■■□□□ 1.66
UPP1-211ENST00000482015 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
UPP1-211ENST00000482015 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
UPP1-211ENST00000482015 HMOX1P09601 288 aa25.44■■□□□ 1.66
UPP1-211ENST00000482015 SMIM5Q71RC9 77 aa25.44■■□□□ 1.66
UPP1-211ENST00000482015 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.44■■□□□ 1.66
UPP1-211ENST00000482015 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.44■■□□□ 1.66
UPP1-211ENST00000482015 AK7Q96M32 723 aa25.44■■□□□ 1.66
UPP1-211ENST00000482015 ATP6V1AP38606 617 aa25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms