RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 GAS2L2Q8NHY3 880 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 PKD1L3Q7Z443 1732 aa17.21■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 MEGF6O75095 1541 aa17.21■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 SPG7Q9UQ90 795 aa17.2■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 LMOD3Q0VAK6 560 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 NFE2L2Q16236 605 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 CCDC27Q2M243 656 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 CCDC146Q8IYE0 955 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 USP35Q9P2H5 1018 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 APAF1O14727 1248 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 GLI3P10071 1580 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 TMPOP42166 694 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 PHACTR3Q96KR7 559 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa17.17■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 TNS2Q63HR2 1409 aa17.16■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa17.16■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
NISCH-208ENST00000481211 EXOC5O00471 708 aa17.14■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP17.14■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 AKAP4Q5JQC9 854 aa17.14■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 C1orf141Q5JVX7 400 aa17.14■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 IFNL2Q8IZJ0 200 aa17.14■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 MAP3K5Q99683 1374 aa17.14■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 RIPK4P57078 832 aa17.13■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 DDB1Q16531 1140 aa17.13■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 LRRC37A3O60309 1634 aa17.13■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 GNAT3A8MTJ3 354 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 ZBED9Q6R2W3 1325 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 PHKG2P15735 406 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 SHANK3Q9BYB0 1731 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 RXRBP28702 533 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 DCAF5Q96JK2 942 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 DLG5Q8TDM6 1919 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-208ENST00000481211 CYP27B1O15528 508 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 NEUROD2Q15784 382 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 WDR63Q8IWG1 891 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 WWC1Q8IX03 1113 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 TRIM35Q9UPQ4 493 aa17.08■□□□□ 0.32
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NISCH-208ENST00000481211 IL16Q14005 1332 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 ZNF521Q96K83 1311 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 PDE3BQ13370 1112 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 BCL9O00512 1426 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 A0A0G2JS52 829 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 MYT1Q01538 1121 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 SEPT12Q8IYM1 358 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 BABAM1Q9NWV8 329 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 ERVV-2B6SEH9 535 aa17.04■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 RNMTO43148 476 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 SCN11AQ9UI33 1791 aa17.04■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 MRC1P22897 1456 aa17.04■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 GOLGA2Q08379 1002 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 POTEAQ6S8J7 498 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 TEFQ10587 303 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 IL17REQ8NFR9 667 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 IFT57Q9NWB7 429 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
NISCH-208ENST00000481211 E9PSI1 815 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-208ENST00000481211 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
NISCH-208ENST00000481211 RGS12O14924 1447 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-208ENST00000481211 GNAI1P63096 354 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-208ENST00000481211 MCM10Q7L590 875 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-208ENST00000481211 KRT27Q7Z3Y8 459 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-208ENST00000481211 MYH16Q9H6N6 1097 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-208ENST00000481211 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
NISCH-208ENST00000481211 CFAP44Q96MT7 982 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-208ENST00000481211 SLC52A2Q9HAB3 445 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-208ENST00000481211 CABP4P57796 275 aa16.98■□□□□ 0.31
NISCH-208ENST00000481211 DCTN1Q14203 1278 aa16.98■□□□□ 0.31
NISCH-208ENST00000481211 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
NISCH-208ENST00000481211 LGR6Q9HBX8 967 aa16.98■□□□□ 0.31
NISCH-208ENST00000481211 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
NISCH-208ENST00000481211 ZNF853P0CG23 659 aa16.97■□□□□ 0.31
NISCH-208ENST00000481211 FAM196AQ6ZSG2 479 aa16.97■□□□□ 0.31
NISCH-208ENST00000481211 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa16.96■□□□□ 0.31
NISCH-208ENST00000481211 BRWD3Q6RI45 1802 aa16.96■□□□□ 0.31
NISCH-208ENST00000481211 CHL1O00533 1208 aa16.96■□□□□ 0.31
NISCH-208ENST00000481211 SLFN5Q08AF3 891 aa16.96■□□□□ 0.31
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