RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473789.5

FAM208B-205, Transcript of family with sequence similarity 208 member B, human

TSL 5

Gene FAM208B, Length 506 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM208B-205	ENST00000473789	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		33.39	■■■□□ 2.94
FAM208B-205	ENST00000473789	CASZ1	Q86V15	1759 aa		33.37	■■■□□ 2.93
FAM208B-205	ENST00000473789	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	33.37	■■■□□ 2.93
FAM208B-205	ENST00000473789	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		33.34	■■■□□ 2.93
FAM208B-205	ENST00000473789	SPON1	Q9HCB6	807 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FAM208B-205	ENST00000473789	PAPPA	Q13219	1627 aa		33.32	■■■□□ 2.92
FAM208B-205	ENST00000473789	SLC15A2	Q16348	729 aa		33.32	■■■□□ 2.92
FAM208B-205	ENST00000473789	STK32B	Q9NY57	414 aa		33.32	■■■□□ 2.92
FAM208B-205	ENST00000473789	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FAM208B-205	ENST00000473789	NSD2	O96028	1365 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FAM208B-205	ENST00000473789	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
FAM208B-205	ENST00000473789	PANK3	Q9H999	370 aa		33.3	■■■□□ 2.92
FAM208B-205	ENST00000473789	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		33.3	■■■□□ 2.92
FAM208B-205	ENST00000473789	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FAM208B-205	ENST00000473789	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		33.28	■■■□□ 2.92
FAM208B-205	ENST00000473789	NCAPD2	Q15021	1401 aa		33.28	■■■□□ 2.92
FAM208B-205	ENST00000473789	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
FAM208B-205	ENST00000473789	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
FAM208B-205	ENST00000473789	POLK	Q9UBT6	870 aa		33.28	■■■□□ 2.92
FAM208B-205	ENST00000473789	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
FAM208B-205	ENST00000473789	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
FAM208B-205	ENST00000473789	ZBTB7A	O95365	584 aa		33.23	■■■□□ 2.91
FAM208B-205	ENST00000473789	ZNF827	Q17R98	1081 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FAM208B-205	ENST00000473789	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
FAM208B-205	ENST00000473789	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FAM208B-205	ENST00000473789	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FAM208B-205	ENST00000473789	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		33.2	■■■□□ 2.91
FAM208B-205	ENST00000473789	EYA1	Q99502	592 aa		33.2	■■■□□ 2.91
FAM208B-205	ENST00000473789	CYP27B1	O15528	508 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FAM208B-205	ENST00000473789	PTGER2	P43116	358 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FAM208B-205	ENST00000473789	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
FAM208B-205	ENST00000473789	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		33.17	■■■□□ 2.9
FAM208B-205	ENST00000473789	AKT1S1	Q96B36	256 aa		33.17	■■■□□ 2.9
FAM208B-205	ENST00000473789	LY75	O60449	1722 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FAM208B-205	ENST00000473789	KCNQ4	P56696	695 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FAM208B-205	ENST00000473789	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
FAM208B-205	ENST00000473789	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
FAM208B-205	ENST00000473789	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FAM208B-205	ENST00000473789	MTFR1L	Q9H019	292 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FAM208B-205	ENST00000473789	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FAM208B-205	ENST00000473789	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FAM208B-205	ENST00000473789	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
FAM208B-205	ENST00000473789	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	33.07	■■■□□ 2.88
FAM208B-205	ENST00000473789	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
FAM208B-205	ENST00000473789	SPG7	Q9UQ90	795 aa		33.07	■■■□□ 2.88
FAM208B-205	ENST00000473789	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		33.06	■■■□□ 2.88
FAM208B-205	ENST00000473789	MORC1	Q86VD1	984 aa		33.06	■■■□□ 2.88
FAM208B-205	ENST00000473789	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		33.06	■■■□□ 2.88
FAM208B-205	ENST00000473789	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		33.05	■■■□□ 2.88
FAM208B-205	ENST00000473789	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		33.05	■■■□□ 2.88
FAM208B-205	ENST00000473789	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
FAM208B-205	ENST00000473789	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		33.04	■■■□□ 2.88
FAM208B-205	ENST00000473789	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		33.04	■■■□□ 2.88
FAM208B-205	ENST00000473789	ITGB4	P16144	1822 aa		33.02	■■■□□ 2.88
FAM208B-205	ENST00000473789	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		33.01	■■■□□ 2.87
FAM208B-205	ENST00000473789	PALLD	Q8WX93	1383 aa		33	■■■□□ 2.87
FAM208B-205	ENST00000473789	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		32.99	■■■□□ 2.87
FAM208B-205	ENST00000473789	PHKG2	P15735	406 aa		32.99	■■■□□ 2.87
FAM208B-205	ENST00000473789	PIGB	Q92521	554 aa		32.99	■■■□□ 2.87
FAM208B-205	ENST00000473789	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		32.97	■■■□□ 2.87
FAM208B-205	ENST00000473789	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.96	■■■□□ 2.87
FAM208B-205	ENST00000473789	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
FAM208B-205	ENST00000473789	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
FAM208B-205	ENST00000473789	ARX	Q96QS3	562 aa		32.94	■■■□□ 2.86
FAM208B-205	ENST00000473789	SYT17	Q9BSW7	474 aa		32.94	■■■□□ 2.86
FAM208B-205	ENST00000473789	C5	P01031	1676 aa		32.94	■■■□□ 2.86
FAM208B-205	ENST00000473789	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		32.94	■■■□□ 2.86
FAM208B-205	ENST00000473789	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
FAM208B-205	ENST00000473789	UTRN	P46939	3433 aa		32.92	■■■□□ 2.86
FAM208B-205	ENST00000473789	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		32.91	■■■□□ 2.86
FAM208B-205	ENST00000473789	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		32.91	■■■□□ 2.86
FAM208B-205	ENST00000473789	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
FAM208B-205	ENST00000473789	IL13	P35225	146 aa		32.89	■■■□□ 2.86
FAM208B-205	ENST00000473789	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.89	■■■□□ 2.86
FAM208B-205	ENST00000473789	MAP3K5	Q99683	1374 aa		32.88	■■■□□ 2.85
FAM208B-205	ENST00000473789	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.86	■■■□□ 2.85
FAM208B-205	ENST00000473789	KDR	P35968	1356 aa		32.85	■■■□□ 2.85
FAM208B-205	ENST00000473789	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
FAM208B-205	ENST00000473789	C4B	P0C0L5	1744 aa		32.84	■■■□□ 2.85
FAM208B-205	ENST00000473789	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.83	■■■□□ 2.85
FAM208B-205	ENST00000473789	SIK1	P57059	783 aa		32.83	■■■□□ 2.85
FAM208B-205	ENST00000473789	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		32.83	■■■□□ 2.85
FAM208B-205	ENST00000473789	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		32.83	■■■□□ 2.85
FAM208B-205	ENST00000473789	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		32.82	■■■□□ 2.84
FAM208B-205	ENST00000473789	POLD1	P28340	1107 aa		32.82	■■■□□ 2.84
FAM208B-205	ENST00000473789	MTHFS	P49914	203 aa		32.82	■■■□□ 2.84
FAM208B-205	ENST00000473789	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.82	■■■□□ 2.84
FAM208B-205	ENST00000473789	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
FAM208B-205	ENST00000473789	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.82	■■■□□ 2.84
FAM208B-205	ENST00000473789	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
FAM208B-205	ENST00000473789	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
FAM208B-205	ENST00000473789	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
FAM208B-205	ENST00000473789	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.8	■■■□□ 2.84
FAM208B-205	ENST00000473789	MSH5	O43196	834 aa		32.8	■■■□□ 2.84
FAM208B-205	ENST00000473789	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32.8	■■■□□ 2.84
FAM208B-205	ENST00000473789	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
FAM208B-205	ENST00000473789	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		32.79	■■■□□ 2.84
FAM208B-205	ENST00000473789	ITPK1	Q13572	414 aa		32.78	■■■□□ 2.84
FAM208B-205	ENST00000473789	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		32.78	■■■□□ 2.84
FAM208B-205	ENST00000473789	YY1	P25490	414 aa		32.76	■■■□□ 2.83

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