RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473023.1

POLE4-204, Transcript of DNA polymerase epsilon 4, accessory subunit, human

TSL 5

Gene POLE4, Length 357 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLE4-204	ENST00000473023	RETREG3	Q86VR2	466 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	HECW1	Q76N89	1606 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	NEO1	Q92859	1461 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	DLL1	O00548	723 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	GDF9	O60383	454 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	PRR20E	P86478	221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	PRR20C	P86479	221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	PRR20D	P86480	221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	PRR20B	P86481	221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	PRR20A	P86496	221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	IQGAP2	Q13576	1575 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	JUND	P17535	347 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	FMN1	Q68DA7	1419 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	MROH2A	A6NES4	1674 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	IQGAP1	P46940	1657 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	DESI1	Q6ICB0	168 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	C6orf229	H3BNL8	230 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	MTMR2	Q13614	643 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	MYOM1	P52179	1685 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	PRR7	Q8TB68	274 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	DISP1	Q96F81	1524 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	UNC13B	O14795	1591 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	DIP2A	Q14689	1571 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	ARID3C	A6NKF2	412 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	POTEC	B2RU33	542 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	CFAP99	D6REC4	459 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	ATP10A	O60312	1499 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	LILRB3	O75022	631 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	TRIM32	Q13049	653 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	NPAT	Q14207	1427 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	PTPRN	Q16849	979 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
POLE4-204	ENST00000473023	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	WNT7A	O00755	349 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	DGAT1	O75907	488 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	LYPD8	Q6UX82	237 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	NGLY1	Q96IV0	654 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	FAM117A	Q9C073	453 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	SAMD9	Q5K651	1589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	WNT7B	P56706	349 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	SKOR1	P84550	965 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	QPCT	Q16769	361 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	DEPDC5	O75140	1603 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
POLE4-204	ENST00000473023	TNFRSF10A	O00220	468 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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