RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471494.5

RNF220-208, Transcript of ring finger protein 220, human

TSL 5

Gene RNF220, Length 720 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF220-208	ENST00000471494	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		32.23	■■■□□ 2.75
RNF220-208	ENST00000471494	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
RNF220-208	ENST00000471494	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		32.22	■■■□□ 2.75
RNF220-208	ENST00000471494	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
RNF220-208	ENST00000471494	TXNRD1	Q16881	649 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RNF220-208	ENST00000471494	PROM2	Q8N271	834 aa		32.18	■■■□□ 2.74
RNF220-208	ENST00000471494	NSD2	O96028	1365 aa		32.18	■■■□□ 2.74
RNF220-208	ENST00000471494	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
RNF220-208	ENST00000471494	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
RNF220-208	ENST00000471494	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
RNF220-208	ENST00000471494	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		32.15	■■■□□ 2.74
RNF220-208	ENST00000471494	POLK	Q9UBT6	870 aa		32.14	■■■□□ 2.74
RNF220-208	ENST00000471494	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		32.12	■■■□□ 2.73
RNF220-208	ENST00000471494	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RNF220-208	ENST00000471494	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
RNF220-208	ENST00000471494	CASZ1	Q86V15	1759 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RNF220-208	ENST00000471494	NCAPD2	Q15021	1401 aa		32.1	■■■□□ 2.73
RNF220-208	ENST00000471494	STK32B	Q9NY57	414 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RNF220-208	ENST00000471494	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RNF220-208	ENST00000471494	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		32.08	■■■□□ 2.73
RNF220-208	ENST00000471494	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		32.08	■■■□□ 2.73
RNF220-208	ENST00000471494	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.08	■■■□□ 2.73
RNF220-208	ENST00000471494	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
RNF220-208	ENST00000471494	MORC1	Q86VD1	984 aa		32.06	■■■□□ 2.72
RNF220-208	ENST00000471494	LY75	O60449	1722 aa		32.04	■■■□□ 2.72
RNF220-208	ENST00000471494	EYA1	Q99502	592 aa		32.03	■■■□□ 2.72
RNF220-208	ENST00000471494	SPON1	Q9HCB6	807 aa		32.03	■■■□□ 2.72
RNF220-208	ENST00000471494	SLC15A2	Q16348	729 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RNF220-208	ENST00000471494	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
RNF220-208	ENST00000471494	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RNF220-208	ENST00000471494	ITGB4	P16144	1822 aa		31.98	■■■□□ 2.71
RNF220-208	ENST00000471494	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		31.98	■■■□□ 2.71
RNF220-208	ENST00000471494	SPG7	Q9UQ90	795 aa		31.98	■■■□□ 2.71
RNF220-208	ENST00000471494	CYP27B1	O15528	508 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RNF220-208	ENST00000471494	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RNF220-208	ENST00000471494	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
RNF220-208	ENST00000471494	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
RNF220-208	ENST00000471494	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
RNF220-208	ENST00000471494	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		31.94	■■■□□ 2.7
RNF220-208	ENST00000471494	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		31.93	■■■□□ 2.7
RNF220-208	ENST00000471494	ZBTB7A	O95365	584 aa		31.92	■■■□□ 2.7
RNF220-208	ENST00000471494	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	31.92	■■■□□ 2.7
RNF220-208	ENST00000471494	ZNF827	Q17R98	1081 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RNF220-208	ENST00000471494	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RNF220-208	ENST00000471494	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RNF220-208	ENST00000471494	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		31.88	■■■□□ 2.69
RNF220-208	ENST00000471494	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
RNF220-208	ENST00000471494	KCNQ4	P56696	695 aa		31.87	■■■□□ 2.69
RNF220-208	ENST00000471494	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
RNF220-208	ENST00000471494	AKT1S1	Q96B36	256 aa		31.86	■■■□□ 2.69
RNF220-208	ENST00000471494	C5	P01031	1676 aa		31.86	■■■□□ 2.69
RNF220-208	ENST00000471494	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
RNF220-208	ENST00000471494	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
RNF220-208	ENST00000471494	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RNF220-208	ENST00000471494	MTFR1L	Q9H019	292 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RNF220-208	ENST00000471494	PALLD	Q8WX93	1383 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RNF220-208	ENST00000471494	PHKG2	P15735	406 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RNF220-208	ENST00000471494	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RNF220-208	ENST00000471494	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
RNF220-208	ENST00000471494	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RNF220-208	ENST00000471494	PTGER2	P43116	358 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RNF220-208	ENST00000471494	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
RNF220-208	ENST00000471494	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
RNF220-208	ENST00000471494	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RNF220-208	ENST00000471494	MTHFS	P49914	203 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RNF220-208	ENST00000471494	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RNF220-208	ENST00000471494	PIGB	Q92521	554 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RNF220-208	ENST00000471494	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RNF220-208	ENST00000471494	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		31.76	■■■□□ 2.68
RNF220-208	ENST00000471494	IL13	P35225	146 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RNF220-208	ENST00000471494	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
RNF220-208	ENST00000471494	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RNF220-208	ENST00000471494	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RNF220-208	ENST00000471494	KDR	P35968	1356 aa		31.74	■■■□□ 2.67
RNF220-208	ENST00000471494	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
RNF220-208	ENST00000471494	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
RNF220-208	ENST00000471494	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
RNF220-208	ENST00000471494	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		31.73	■■■□□ 2.67
RNF220-208	ENST00000471494	C4B	P0C0L5	1744 aa		31.72	■■■□□ 2.67
RNF220-208	ENST00000471494	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RNF220-208	ENST00000471494	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RNF220-208	ENST00000471494	DCAF5	Q96JK2	942 aa		31.69	■■■□□ 2.66
RNF220-208	ENST00000471494	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		31.68	■■■□□ 2.66
RNF220-208	ENST00000471494	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RNF220-208	ENST00000471494	MSH5	O43196	834 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RNF220-208	ENST00000471494	ARX	Q96QS3	562 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RNF220-208	ENST00000471494	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RNF220-208	ENST00000471494	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
RNF220-208	ENST00000471494	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		31.65	■■■□□ 2.66
RNF220-208	ENST00000471494	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	31.65	■■■□□ 2.66
RNF220-208	ENST00000471494	SIK1	P57059	783 aa		31.65	■■■□□ 2.66
RNF220-208	ENST00000471494	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		31.65	■■■□□ 2.66
RNF220-208	ENST00000471494	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		31.64	■■■□□ 2.66
RNF220-208	ENST00000471494	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		31.64	■■■□□ 2.66
RNF220-208	ENST00000471494	POLD1	P28340	1107 aa		31.63	■■■□□ 2.65
RNF220-208	ENST00000471494	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	31.63	■■■□□ 2.65
RNF220-208	ENST00000471494	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
RNF220-208	ENST00000471494	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
RNF220-208	ENST00000471494	HMOX1	P09601	288 aa		31.62	■■■□□ 2.65
RNF220-208	ENST00000471494	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65

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