RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468077.5

TARBP1-204, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TARBP1, Length 514 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1-204ENST00000468077 IP6K1Q92551 441 aa22.06■■□□□ 1.12
TARBP1-204ENST00000468077 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.05■■□□□ 1.12
TARBP1-204ENST00000468077 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.05■■□□□ 1.12
TARBP1-204ENST00000468077 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.05■■□□□ 1.12
TARBP1-204ENST00000468077 KCNQ4P56696 695 aa22.04■■□□□ 1.12
TARBP1-204ENST00000468077 NSD2O96028 1365 aa22.03■■□□□ 1.12
TARBP1-204ENST00000468077 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TARBP1-204ENST00000468077 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TARBP1-204ENST00000468077 MEGF6O75095 1541 aa22.01■■□□□ 1.11
TARBP1-204ENST00000468077 MSH5O43196 834 aa22■■□□□ 1.11
TARBP1-204ENST00000468077 GRIN3BO60391 1043 aa22■■□□□ 1.11
TARBP1-204ENST00000468077 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.99■■□□□ 1.11
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TARBP1-204ENST00000468077 USP47Q96K76 1375 aa21.99■■□□□ 1.11
TARBP1-204ENST00000468077 HOXC9P31274 260 aa21.98■■□□□ 1.11
TARBP1-204ENST00000468077 AMPHP49418 695 aa21.98■■□□□ 1.11
TARBP1-204ENST00000468077 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TARBP1-204ENST00000468077 COG3Q96JB2 828 aa21.98■■□□□ 1.11
TARBP1-204ENST00000468077 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
TARBP1-204ENST00000468077 C5P01031 1676 aa21.97■■□□□ 1.11
TARBP1-204ENST00000468077 RTL1A6NKG5 1358 aa21.97■■□□□ 1.11
TARBP1-204ENST00000468077 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TARBP1-204ENST00000468077 ATP10DQ9P241 1426 aa21.95■■□□□ 1.1
TARBP1-204ENST00000468077 MSL1Q68DK7 614 aa21.94■■□□□ 1.1
TARBP1-204ENST00000468077 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TARBP1-204ENST00000468077 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
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TARBP1-204ENST00000468077 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.91■■□□□ 1.1
TARBP1-204ENST00000468077 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.9■■□□□ 1.1
TARBP1-204ENST00000468077 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
TARBP1-204ENST00000468077 TONSLQ96HA7 1378 aa21.88■■□□□ 1.09
TARBP1-204ENST00000468077 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.88■■□□□ 1.09
TARBP1-204ENST00000468077 FBLN1P23142 703 aa21.88■■□□□ 1.09
TARBP1-204ENST00000468077 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.88■■□□□ 1.09
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TARBP1-204ENST00000468077 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.88■■□□□ 1.09
TARBP1-204ENST00000468077 PALLDQ8WX93 1383 aa21.87■■□□□ 1.09
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TARBP1-204ENST00000468077 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
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TARBP1-204ENST00000468077 TESK2Q96S53 571 aa21.83■■□□□ 1.09
TARBP1-204ENST00000468077 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.83■■□□□ 1.08
TARBP1-204ENST00000468077 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.82■■□□□ 1.08
TARBP1-204ENST00000468077 AK7Q96M32 723 aa21.82■■□□□ 1.08
TARBP1-204ENST00000468077 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.81■■□□□ 1.08
TARBP1-204ENST00000468077 SLC24A1O60721 1099 aa21.81■■□□□ 1.08
TARBP1-204ENST00000468077 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.81■■□□□ 1.08
TARBP1-204ENST00000468077 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TARBP1-204ENST00000468077 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.8■■□□□ 1.08
TARBP1-204ENST00000468077 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.8■■□□□ 1.08
TARBP1-204ENST00000468077 INSRP06213 1382 aa21.8■■□□□ 1.08
TARBP1-204ENST00000468077 FLT4P35916 1363 aa21.8■■□□□ 1.08
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TARBP1-204ENST00000468077 ITGB4P16144 1822 aa21.79■■□□□ 1.08
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TARBP1-204ENST00000468077 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.79■■□□□ 1.08
TARBP1-204ENST00000468077 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.79■■□□□ 1.08
TARBP1-204ENST00000468077 HSPA6P17066 643 aa21.78■■□□□ 1.08
TARBP1-204ENST00000468077 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.77■■□□□ 1.08
TARBP1-204ENST00000468077 FYB1O15117 783 aa21.77■■□□□ 1.08
TARBP1-204ENST00000468077 PHF14O94880 888 aa21.77■■□□□ 1.08
TARBP1-204ENST00000468077 CYP27B1O15528 508 aa21.76■■□□□ 1.07
TARBP1-204ENST00000468077 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.76■■□□□ 1.07
TARBP1-204ENST00000468077 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.75■■□□□ 1.07
TARBP1-204ENST00000468077 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TARBP1-204ENST00000468077 SSFA2P28290 1259 aa21.73■■□□□ 1.07
TARBP1-204ENST00000468077 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.73■■□□□ 1.07
TARBP1-204ENST00000468077 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
TARBP1-204ENST00000468077 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
TARBP1-204ENST00000468077 TMF1P82094 1093 aa21.71■■□□□ 1.07
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TARBP1-204ENST00000468077 SMIM5Q71RC9 77 aa21.69■■□□□ 1.06
TARBP1-204ENST00000468077 NCAPD2Q15021 1401 aa21.69■■□□□ 1.06
TARBP1-204ENST00000468077 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.68■■□□□ 1.06
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TARBP1-204ENST00000468077 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.68■■□□□ 1.06
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TARBP1-204ENST00000468077 GNPATO15228 680 aa21.67■■□□□ 1.06
TARBP1-204ENST00000468077 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.67■■□□□ 1.06
TARBP1-204ENST00000468077 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.67■■□□□ 1.06
TARBP1-204ENST00000468077 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
TARBP1-204ENST00000468077 KIF3CO14782 793 aa21.65■■□□□ 1.06
TARBP1-204ENST00000468077 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.64■■□□□ 1.06
TARBP1-204ENST00000468077 CDCA8Q53HL2 280 aa21.64■■□□□ 1.05
TARBP1-204ENST00000468077 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.64■■□□□ 1.05
TARBP1-204ENST00000468077 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
TARBP1-204ENST00000468077 MMP10P09238 476 aa21.63■■□□□ 1.05
TARBP1-204ENST00000468077 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.63■■□□□ 1.05
TARBP1-204ENST00000468077 ATP6V1AP38606 617 aa21.62■■□□□ 1.05
TARBP1-204ENST00000468077 ITPK1Q13572 414 aa21.62■■□□□ 1.05
TARBP1-204ENST00000468077 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.059e-8■□□□□ 11.3
TARBP1-204ENST00000468077 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.61■■□□□ 1.05
TARBP1-204ENST00000468077 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.61■■□□□ 1.05
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