RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466676.5

RUNDC3B-204, Transcript of RUN domain containing 3B, human

TSL 2

Gene RUNDC3B, Length 582 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	12.05	□□□□□ -0.48
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MTFR1L	Q9H019	292 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SLIT3	O75094	1523 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SLC24A1	O60721	1099 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SLC15A2	Q16348	729 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ABCC6	O95255	1503 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TXNRD1	Q16881	649 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PEAK1	Q9H792	1746 aa		12	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SBF2	Q86WG5	1849 aa		12	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZBTB7A	O95365	584 aa		12	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		12	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LRRC37A3	O60309	1634 aa		12	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		12	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	AKAP12	Q02952	1782 aa		12	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IL2RB	P14784	551 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	POLD1	P28340	1107 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SYT17	Q9BSW7	474 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TNS2	Q63HR2	1409 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MAP3K5	Q99683	1374 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ARX	Q96QS3	562 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PTGER2	P43116	358 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LHX8	Q68G74	356 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	USP31	Q70CQ4	1352 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	COL18A1	P39060	1754 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CASZ1	Q86V15	1759 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ERBB3	P21860	1342 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PIK3C2A	O00443	1686 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SOX12	O15370	315 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GPR162	Q16538	588 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CHD4	Q14839	1912 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	11.94	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GRIN3B	O60391	1043 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CHADL	Q6NUI6	762 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NUBP1	P53384	320 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	11.92	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TMC1	Q8TDI8	760 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NFAT5	O94916	1531 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NHS	Q6T4R5	1651 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C1QTNF8	P60827	252 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GSE1	Q14687	1217 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GABBR2	O75899	941 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IP6K1	Q92551	441 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FAM212A	Q96EL1	285 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MYOM1	P52179	1685 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RGPD5	Q99666	1765 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	COG3	Q96JB2	828 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	AMPH	P49418	695 aa		11.87	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	USP54	Q70EL1	1684 aa		11.87	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		11.86	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NME9	Q86XW9	330 aa		11.86	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		11.86	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MRS2	Q9HD23	443 aa		11.86	□□□□□ -0.51

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