RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466657.1

SIKE1-205, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIKE1, Length 415 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-205ENST00000466657 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.94■■□□□ 1.58
SIKE1-205ENST00000466657 FLT4P35916 1363 aa24.93■■□□□ 1.58
SIKE1-205ENST00000466657 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.93■■□□□ 1.58
SIKE1-205ENST00000466657 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SIKE1-205ENST00000466657 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.92■■□□□ 1.58
SIKE1-205ENST00000466657 PTGER2P43116 358 aa24.92■■□□□ 1.58
SIKE1-205ENST00000466657 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SIKE1-205ENST00000466657 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.92■■□□□ 1.58
SIKE1-205ENST00000466657 NSD2O96028 1365 aa24.92■■□□□ 1.58
SIKE1-205ENST00000466657 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SIKE1-205ENST00000466657 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.9■■□□□ 1.58
SIKE1-205ENST00000466657 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.9■■□□□ 1.58
SIKE1-205ENST00000466657 NCAPD2Q15021 1401 aa24.89■■□□□ 1.58
SIKE1-205ENST00000466657 ZBTB7AO95365 584 aa24.89■■□□□ 1.58
SIKE1-205ENST00000466657 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.89■■□□□ 1.58
SIKE1-205ENST00000466657 ITGB4P16144 1822 aa24.87■■□□□ 1.57
SIKE1-205ENST00000466657 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.87■■□□□ 1.57
SIKE1-205ENST00000466657 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.87■■□□□ 1.57
SIKE1-205ENST00000466657 MTFR1LQ9H019 292 aa24.87■■□□□ 1.57
SIKE1-205ENST00000466657 ZNF827Q17R98 1081 aa24.86■■□□□ 1.57
SIKE1-205ENST00000466657 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SIKE1-205ENST00000466657 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.85■■□□□ 1.57
SIKE1-205ENST00000466657 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.85■■□□□ 1.57
SIKE1-205ENST00000466657 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.84■■□□□ 1.57
SIKE1-205ENST00000466657 AKT1S1Q96B36 256 aa24.84■■□□□ 1.57
SIKE1-205ENST00000466657 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.84■■□□□ 1.57
SIKE1-205ENST00000466657 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.84■■□□□ 1.57
SIKE1-205ENST00000466657 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SIKE1-205ENST00000466657 C5P01031 1676 aa24.81■■□□□ 1.56
SIKE1-205ENST00000466657 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SIKE1-205ENST00000466657 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.81■■□□□ 1.56
SIKE1-205ENST00000466657 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.81■■□□□ 1.56
SIKE1-205ENST00000466657 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SIKE1-205ENST00000466657 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.8■■□□□ 1.56
SIKE1-205ENST00000466657 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
SIKE1-205ENST00000466657 MAP3K5Q99683 1374 aa24.77■■□□□ 1.56
SIKE1-205ENST00000466657 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.76■■□□□ 1.55
SIKE1-205ENST00000466657 UTRNP46939 3433 aa24.76■■□□□ 1.55
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SIKE1-205ENST00000466657 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.75■■□□□ 1.55
SIKE1-205ENST00000466657 SYT17Q9BSW7 474 aa24.75■■□□□ 1.55
SIKE1-205ENST00000466657 CHD4Q14839 1912 aa24.74■■□□□ 1.55
SIKE1-205ENST00000466657 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SIKE1-205ENST00000466657 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SIKE1-205ENST00000466657 POLKQ9UBT6 870 aa24.74■■□□□ 1.55
SIKE1-205ENST00000466657 KCNQ4P56696 695 aa24.73■■□□□ 1.55
SIKE1-205ENST00000466657 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.72■■□□□ 1.55
SIKE1-205ENST00000466657 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.72■■□□□ 1.55
SIKE1-205ENST00000466657 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SIKE1-205ENST00000466657 ARXQ96QS3 562 aa24.71■■□□□ 1.55
SIKE1-205ENST00000466657 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SIKE1-205ENST00000466657 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SIKE1-205ENST00000466657 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SIKE1-205ENST00000466657 EYA1Q99502 592 aa24.7■■□□□ 1.54
SIKE1-205ENST00000466657 YY1P25490 414 aa24.69■■□□□ 1.54
SIKE1-205ENST00000466657 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.543e-8■■■□□ 14.7
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SIKE1-205ENST00000466657 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.68■■□□□ 1.54
SIKE1-205ENST00000466657 PALLDQ8WX93 1383 aa24.67■■□□□ 1.54
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SIKE1-205ENST00000466657 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.67■■□□□ 1.54
SIKE1-205ENST00000466657 PANK3Q9H999 370 aa24.66■■□□□ 1.54
SIKE1-205ENST00000466657 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
SIKE1-205ENST00000466657 SPG7Q9UQ90 795 aa24.65■■□□□ 1.54
SIKE1-205ENST00000466657 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
SIKE1-205ENST00000466657 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.64■■□□□ 1.54
SIKE1-205ENST00000466657 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.62■■□□□ 1.53
SIKE1-205ENST00000466657 POLD1P28340 1107 aa24.61■■□□□ 1.53
SIKE1-205ENST00000466657 PIGBQ92521 554 aa24.61■■□□□ 1.53
SIKE1-205ENST00000466657 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SIKE1-205ENST00000466657 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.61■■□□□ 1.53
SIKE1-205ENST00000466657 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SIKE1-205ENST00000466657 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SIKE1-205ENST00000466657 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SIKE1-205ENST00000466657 PHKG2P15735 406 aa24.59■■□□□ 1.53
SIKE1-205ENST00000466657 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.58■■□□□ 1.53
SIKE1-205ENST00000466657 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.56■■□□□ 1.52
SIKE1-205ENST00000466657 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SIKE1-205ENST00000466657 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.53■■□□□ 1.52
SIKE1-205ENST00000466657 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SIKE1-205ENST00000466657 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.51■■□□□ 1.51
SIKE1-205ENST00000466657 SIK1P57059 783 aa24.51■■□□□ 1.51
SIKE1-205ENST00000466657 MORC1Q86VD1 984 aa24.51■■□□□ 1.51
SIKE1-205ENST00000466657 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.51■■□□□ 1.51
SIKE1-205ENST00000466657 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SIKE1-205ENST00000466657 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.5■■□□□ 1.51
SIKE1-205ENST00000466657 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.5■■□□□ 1.51
SIKE1-205ENST00000466657 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.5■■□□□ 1.51
SIKE1-205ENST00000466657 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.5■■□□□ 1.51
SIKE1-205ENST00000466657 KDRP35968 1356 aa24.5■■□□□ 1.51
SIKE1-205ENST00000466657 MSH5O43196 834 aa24.49■■□□□ 1.51
SIKE1-205ENST00000466657 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.48■■□□□ 1.51
SIKE1-205ENST00000466657 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
SIKE1-205ENST00000466657 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.48■■□□□ 1.51
SIKE1-205ENST00000466657 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.48■■□□□ 1.51
SIKE1-205ENST00000466657 AK7Q96M32 723 aa24.48■■□□□ 1.51
SIKE1-205ENST00000466657 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SIKE1-205ENST00000466657 DCAF5Q96JK2 942 aa24.47■■□□□ 1.51
SIKE1-205ENST00000466657 ATG3Q9NT62 314 aa24.47■■□□□ 1.51
SIKE1-205ENST00000466657 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
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