RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464957.1

CPTP-202, Transcript of ceramide-1-phosphate transfer protein, humanhuman

TSL 2

Gene CPTP, Length 1,101 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPTP-202ENST00000464957 AKT1S1Q96B36 256 aa42.35■■■■■ 4.37
CPTP-202ENST00000464957 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
CPTP-202ENST00000464957 MEGF6O75095 1541 aa42.34■■■■■ 4.37
CPTP-202ENST00000464957 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
CPTP-202ENST00000464957 CDCA8Q53HL2 280 aa42.32■■■■■ 4.37
CPTP-202ENST00000464957 NBPF6Q5VWK0 638 aa42.31■■■■■ 4.36
CPTP-202ENST00000464957 NBPF4Q96M43 638 aa42.31■■■■■ 4.36
CPTP-202ENST00000464957 USHBP1Q8N6Y0 703 aa42.3■■■■■ 4.36
CPTP-202ENST00000464957 SHANK3Q9BYB0 1731 aa42.29■■■■■ 4.36
CPTP-202ENST00000464957 SLC16A10Q8TF71 515 aa42.29■■■■■ 4.36
CPTP-202ENST00000464957 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa42.29■■■■■ 4.36
CPTP-202ENST00000464957 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa42.29■■■■■ 4.36
CPTP-202ENST00000464957 KCNQ4P56696 695 aa42.28■■■■■ 4.36
CPTP-202ENST00000464957 CGNL1Q0VF96 1302 aa42.26■■■■■ 4.36
CPTP-202ENST00000464957 QSER1Q2KHR3 1735 aa42.26■■■■■ 4.36
CPTP-202ENST00000464957 NSD2O96028 1365 aa42.25■■■■■ 4.35
CPTP-202ENST00000464957 TATP17735 454 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
CPTP-202ENST00000464957 POLD1P28340 1107 aa42.24■■■■■ 4.35
CPTP-202ENST00000464957 KIF20BQ96Q89 1820 aa42.24■■■■■ 4.35
CPTP-202ENST00000464957 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa42.23■■■■■ 4.35
CPTP-202ENST00000464957 KLHL34Q8N239 644 aa42.22■■■■■ 4.35
CPTP-202ENST00000464957 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
CPTP-202ENST00000464957 MAP3K5Q99683 1374 aa42.22■■■■■ 4.35
CPTP-202ENST00000464957 LY75O60449 1722 aa42.21■■■■■ 4.35
CPTP-202ENST00000464957 INSRP06213 1382 aa42.2■■■■■ 4.35
CPTP-202ENST00000464957 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa42.2■■■■■ 4.35
CPTP-202ENST00000464957 FLT4P35916 1363 aa42.19■■■■■ 4.34
CPTP-202ENST00000464957 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa42.16■■■■■ 4.34
CPTP-202ENST00000464957 KIF24Q5T7B8 1368 aa42.14■■■■■ 4.34
CPTP-202ENST00000464957 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa42.14■■■■■ 4.34
CPTP-202ENST00000464957 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa42.14■■■■■ 4.34
CPTP-202ENST00000464957 MSH5O43196 834 aa42.13■■■■■ 4.33
CPTP-202ENST00000464957 GPR162Q16538 588 aa42.13■■■■■ 4.33
CPTP-202ENST00000464957 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP42.12■■■■■ 4.33
CPTP-202ENST00000464957 NSD3Q9BZ95 1437 aa42.12■■■■■ 4.33
CPTP-202ENST00000464957 CARD14Q9BXL6 1004 aa42.09■■■■■ 4.33
CPTP-202ENST00000464957 CHD4Q14839 1912 aa42.08■■■■■ 4.33
CPTP-202ENST00000464957 COL24A1Q17RW2 1714 aa42.07■■■■■ 4.33
CPTP-202ENST00000464957 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa42.07■■■■■ 4.33
CPTP-202ENST00000464957 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
CPTP-202ENST00000464957 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
CPTP-202ENST00000464957 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa42.03■■■■■ 4.32
CPTP-202ENST00000464957 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
CPTP-202ENST00000464957 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
CPTP-202ENST00000464957 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa42.01■■■■■ 4.32
CPTP-202ENST00000464957 CYP27B1O15528 508 aa41.99■■■■■ 4.31
CPTP-202ENST00000464957 PALLDQ8WX93 1383 aa41.99■■■■■ 4.31
CPTP-202ENST00000464957 C5P01031 1676 aa41.97■■■■■ 4.31
CPTP-202ENST00000464957 NLGN2Q8NFZ4 835 aa41.96■■■■■ 4.31
CPTP-202ENST00000464957 MSL1Q68DK7 614 aa41.94■■■■■ 4.3
CPTP-202ENST00000464957 POLR3GLQ9BT43 218 aa41.94■■■■■ 4.3
CPTP-202ENST00000464957 UTRNP46939 3433 aa41.94■■■■■ 4.3
CPTP-202ENST00000464957 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
CPTP-202ENST00000464957 SPG7Q9UQ90 795 aa41.93■■■■■ 4.3
CPTP-202ENST00000464957 PKD1L3Q7Z443 1732 aa41.92■■■■■ 4.3
CPTP-202ENST00000464957 FLAD1Q8NFF5 587 aa41.92■■■■■ 4.3
CPTP-202ENST00000464957 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa41.9■■■■■ 4.3
CPTP-202ENST00000464957 WASHC2AQ641Q2 1341 aa41.9■■■■■ 4.3
CPTP-202ENST00000464957 ITGB4P16144 1822 aa41.88■■■■■ 4.3
CPTP-202ENST00000464957 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa41.88■■■■■ 4.29
CPTP-202ENST00000464957 NCAPD2Q15021 1401 aa41.87■■■■■ 4.29
CPTP-202ENST00000464957 TAF1LQ8IZX4 1826 aa41.87■■■■■ 4.29
CPTP-202ENST00000464957 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP41.86■■■■■ 4.29
CPTP-202ENST00000464957 AK7Q96M32 723 aa41.86■■■■■ 4.29
CPTP-202ENST00000464957 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.86■■■■■ 4.29
CPTP-202ENST00000464957 EYA1Q99502 592 aa41.85■■■■■ 4.29
CPTP-202ENST00000464957 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
CPTP-202ENST00000464957 PIGBQ92521 554 aa41.84■■■■■ 4.29
CPTP-202ENST00000464957 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.83■■■■■ 4.29
CPTP-202ENST00000464957 C4BP0C0L5 1744 aa41.82■■■■■ 4.29
CPTP-202ENST00000464957 POLKQ9UBT6 870 aa41.82■■■■■ 4.29
CPTP-202ENST00000464957 GRIN3BO60391 1043 aa41.79■■■■■ 4.28
CPTP-202ENST00000464957 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
CPTP-202ENST00000464957 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP41.79■■■■■ 4.28
CPTP-202ENST00000464957 TMOD3Q9NYL9 352 aa41.78■■■■■ 4.28
CPTP-202ENST00000464957 PHF14O94880 888 aa41.77■■■■■ 4.28
CPTP-202ENST00000464957 IFNL2Q8IZJ0 200 aa41.76■■■■■ 4.28
CPTP-202ENST00000464957 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP41.75■■■■■ 4.27
CPTP-202ENST00000464957 CD2APQ9Y5K6 639 aa41.74■■■■■ 4.27
CPTP-202ENST00000464957 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa41.73■■■■■ 4.27
CPTP-202ENST00000464957 SIK1P57059 783 aa41.73■■■■■ 4.27
CPTP-202ENST00000464957 C1QTNF8P60827 252 aa41.73■■■■■ 4.27
CPTP-202ENST00000464957 PHKG2P15735 406 aa41.72■■■■■ 4.27
CPTP-202ENST00000464957 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
CPTP-202ENST00000464957 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
CPTP-202ENST00000464957 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP41.69■■■■■ 4.26
CPTP-202ENST00000464957 AMIGO3Q86WK7 504 aa41.69■■■■■ 4.26
CPTP-202ENST00000464957 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa41.68■■■■■ 4.26
CPTP-202ENST00000464957 ASAP1Q9ULH1 1129 aa41.68■■■■■ 4.26
CPTP-202ENST00000464957 UBR3Q6ZT12 1888 aa41.68■■■■■ 4.26
CPTP-202ENST00000464957 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
CPTP-202ENST00000464957 SSFA2P28290 1259 aa41.67■■■■■ 4.26
CPTP-202ENST00000464957 SMIM5Q71RC9 77 aa41.67■■■■■ 4.26
CPTP-202ENST00000464957 LINC00116Q8NCU8 138 aa41.67■■■■■ 4.26
CPTP-202ENST00000464957 ATP6V1AP38606 617 aa41.65■■■■■ 4.26
CPTP-202ENST00000464957 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
CPTP-202ENST00000464957 PANK3Q9H999 370 aa41.63■■■■■ 4.25
CPTP-202ENST00000464957 GNPATO15228 680 aa41.61■■■■■ 4.25
CPTP-202ENST00000464957 ITPK1Q13572 414 aa41.6■■■■■ 4.25
CPTP-202ENST00000464957 ATG3Q9NT62 314 aa41.6■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms