RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462996.1

PTPN18-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18, human

TSL 4

Gene PTPN18, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN18-208	ENST00000462996	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PTPN18-208	ENST00000462996	TMC1	Q8TDI8	760 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PTPN18-208	ENST00000462996	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PTPN18-208	ENST00000462996	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
PTPN18-208	ENST00000462996	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
PTPN18-208	ENST00000462996	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
PTPN18-208	ENST00000462996	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
PTPN18-208	ENST00000462996	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
PTPN18-208	ENST00000462996	MSH5	O43196	834 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PTPN18-208	ENST00000462996	ATP10D	Q9P241	1426 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PTPN18-208	ENST00000462996	MSL1	Q68DK7	614 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PTPN18-208	ENST00000462996		A0A1W2PP64	1363 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PTPN18-208	ENST00000462996	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PTPN18-208	ENST00000462996	NEUROD1	Q13562	356 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PTPN18-208	ENST00000462996	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
PTPN18-208	ENST00000462996	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PTPN18-208	ENST00000462996	MEGF6	O75095	1541 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PTPN18-208	ENST00000462996	FBLN1	P23142	703 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PTPN18-208	ENST00000462996	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PTPN18-208	ENST00000462996	HOXC9	P31274	260 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PTPN18-208	ENST00000462996	USP47	Q96K76	1375 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PTPN18-208	ENST00000462996	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
PTPN18-208	ENST00000462996	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PTPN18-208	ENST00000462996	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PTPN18-208	ENST00000462996	ADCY9	O60503	1353 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PTPN18-208	ENST00000462996	AMPH	P49418	695 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PTPN18-208	ENST00000462996	C5	P01031	1676 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PTPN18-208	ENST00000462996	HSPA6	P17066	643 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PTPN18-208	ENST00000462996	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
PTPN18-208	ENST00000462996	COG3	Q96JB2	828 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PTPN18-208	ENST00000462996	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PTPN18-208	ENST00000462996	NBPF4	Q96M43	638 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PTPN18-208	ENST00000462996	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PTPN18-208	ENST00000462996	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PTPN18-208	ENST00000462996	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PTPN18-208	ENST00000462996	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PTPN18-208	ENST00000462996	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PTPN18-208	ENST00000462996	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PTPN18-208	ENST00000462996	PALLD	Q8WX93	1383 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PTPN18-208	ENST00000462996	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	28.5	■■■□□ 2.15
PTPN18-208	ENST00000462996	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PTPN18-208	ENST00000462996	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PTPN18-208	ENST00000462996	RTL1	A6NKG5	1358 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PTPN18-208	ENST00000462996	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		28.48	■■■□□ 2.15
PTPN18-208	ENST00000462996	SMIM5	Q71RC9	77 aa		28.48	■■■□□ 2.15
PTPN18-208	ENST00000462996	C4B	P0C0L5	1744 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PTPN18-208	ENST00000462996	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PTPN18-208	ENST00000462996	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PTPN18-208	ENST00000462996	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	28.46	■■■□□ 2.15
PTPN18-208	ENST00000462996	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
PTPN18-208	ENST00000462996	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PTPN18-208	ENST00000462996	KIF3C	O14782	793 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PTPN18-208	ENST00000462996	AK7	Q96M32	723 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PTPN18-208	ENST00000462996	TESK2	Q96S53	571 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PTPN18-208	ENST00000462996	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PTPN18-208	ENST00000462996	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PTPN18-208	ENST00000462996	ITGB4	P16144	1822 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PTPN18-208	ENST00000462996	CYP27B1	O15528	508 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PTPN18-208	ENST00000462996	PHF14	O94880	888 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PTPN18-208	ENST00000462996	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
PTPN18-208	ENST00000462996	FYB1	O15117	783 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PTPN18-208	ENST00000462996	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PTPN18-208	ENST00000462996	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PTPN18-208	ENST00000462996	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	28.4	■■■□□ 2.14
PTPN18-208	ENST00000462996	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	28.39	■■■□□ 2.14
PTPN18-208	ENST00000462996	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PTPN18-208	ENST00000462996	INSR	P06213	1382 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PTPN18-208	ENST00000462996	PIGB	Q92521	554 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PTPN18-208	ENST00000462996	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
PTPN18-208	ENST00000462996	SSFA2	P28290	1259 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PTPN18-208	ENST00000462996	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PTPN18-208	ENST00000462996	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PTPN18-208	ENST00000462996	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	28.33	■■■□□ 2.13
PTPN18-208	ENST00000462996	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PTPN18-208	ENST00000462996	APLP1	P51693	650 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PTPN18-208	ENST00000462996	SIK1	P57059	783 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PTPN18-208	ENST00000462996	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PTPN18-208	ENST00000462996	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PTPN18-208	ENST00000462996	FLT4	P35916	1363 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PTPN18-208	ENST00000462996	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	28.3	■■■□□ 2.12
PTPN18-208	ENST00000462996	ITPK1	Q13572	414 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PTPN18-208	ENST00000462996	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PTPN18-208	ENST00000462996	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		28.26	■■■□□ 2.12
PTPN18-208	ENST00000462996	GNPAT	O15228	680 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PTPN18-208	ENST00000462996	SLC24A1	O60721	1099 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PTPN18-208	ENST00000462996	TOMM70	O94826	608 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PTPN18-208	ENST00000462996	MMP10	P09238	476 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PTPN18-208	ENST00000462996	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PTPN18-208	ENST00000462996	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PTPN18-208	ENST00000462996	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
PTPN18-208	ENST00000462996	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PTPN18-208	ENST00000462996	TONSL	Q96HA7	1378 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PTPN18-208	ENST00000462996	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PTPN18-208	ENST00000462996	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PTPN18-208	ENST00000462996	NCAPD2	Q15021	1401 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PTPN18-208	ENST00000462996		A0A0G2JLW4	131 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PTPN18-208	ENST00000462996	ATP6V1A	P38606	617 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PTPN18-208	ENST00000462996	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PTPN18-208	ENST00000462996	SPG7	Q9UQ90	795 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PTPN18-208	ENST00000462996	BCS1L	Q9Y276	419 aa		28.22	■■■□□ 2.11

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