RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC35F4A4IF30 521 aa9.46□□□□□ -0.89
RABGGTB-204ENST00000461653 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.89
RABGGTB-204ENST00000461653 ABL2P42684 1182 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-204ENST00000461653 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-204ENST00000461653 MEN1O00255 615 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-204ENST00000461653 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A1W2PRU2 124 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-204ENST00000461653 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-204ENST00000461653 VAC14Q08AM6 782 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-204ENST00000461653 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
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RABGGTB-204ENST00000461653 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.43□□□□□ -0.9
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RABGGTB-204ENST00000461653 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-204ENST00000461653 TRAK2O60296 914 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-204ENST00000461653 ITGA6P23229 1130 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-204ENST00000461653 GPC1P35052 558 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-204ENST00000461653 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-204ENST00000461653 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
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RABGGTB-204ENST00000461653 WASHC4Q2M389 1173 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-204ENST00000461653 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-204ENST00000461653 RHOQP17081 205 aa9.39□□□□□ -0.91
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RABGGTB-204ENST00000461653 CDC14CA4D256 554 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-204ENST00000461653 RNF135Q8IUD6 432 aa9.39□□□□□ -0.91
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RABGGTB-204ENST00000461653 COG6Q9Y2V7 657 aa9.39□□□□□ -0.91
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RABGGTB-204ENST00000461653 VWA5B2Q8N398 1253 aa9.38□□□□□ -0.91
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RABGGTB-204ENST00000461653 KRT76Q01546 638 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-204ENST00000461653 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-204ENST00000461653 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-204ENST00000461653 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.36□□□□□ -0.91
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RABGGTB-204ENST00000461653 SOX11P35716 441 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-204ENST00000461653 POU4F2Q12837 409 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-204ENST00000461653 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-204ENST00000461653 CNKSR1Q969H4 720 aa9.34□□□□□ -0.91
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RABGGTB-204ENST00000461653 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.34□□□□□ -0.91
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RABGGTB-204ENST00000461653 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.34□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 RNFT1Q5M7Z0 435 aa9.33□□□□□ -0.92
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RABGGTB-204ENST00000461653 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 NBPF15Q8N660 670 aa9.32□□□□□ -0.92
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RABGGTB-204ENST00000461653 WWC1Q8IX03 1113 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 SIRT1Q96EB6 747 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 CENPCQ03188 943 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 ESCO1Q5FWF5 840 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 TAS1R3Q7RTX0 852 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 XAGE2Q96GT9 111 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 RAD21O60216 631 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 WDR44Q5JSH3 913 aa9.29□□□□□ -0.92
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RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 GMCL1Q96IK5 515 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 UBTFP17480 764 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
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RABGGTB-204ENST00000461653 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa9.28□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
RABGGTB-204ENST00000461653 PIK3CDO00329 1044 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 H7C1W4 665 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 DBN1Q16643 649 aa9.26□□□□□ -0.93
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RABGGTB-204ENST00000461653 PHKA2P46019 1235 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 GNASQ5JWF2 1037 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 SCNN1DP51172 638 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 GAS6Q14393 721 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 TLR1Q15399 786 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 GPR25O00155 361 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 F11P03951 625 aa9.24□□□□□ -0.93
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