RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TNNQ9UQP3 1299 aa22.23■■□□□ 1.15
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.21■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TSPYL6Q8N831 410 aa22.2■■□□□ 1.15
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.14■■□□□ 1.13
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.11■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.11■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.11■■□□□ 1.13
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 BRINP3Q76B58 766 aa22.09■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ABCC4O15439 1325 aa22.08■■□□□ 1.13
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 RGS3P49796 1198 aa22.03■■□□□ 1.12
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 STK31Q9BXU1 1019 aa22■■□□□ 1.11
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.98■■□□□ 1.11
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM161AQ3B820 660 aa21.97■■□□□ 1.11
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.96■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.95■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LGR6Q9HBX8 967 aa21.95■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ABCA3Q99758 1704 aa21.94■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HOXB7P09629 217 aa21.93■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CHRNA2Q15822 529 aa21.93■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.93■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SMC5Q8IY18 1101 aa21.93■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.11e-9■■□□□ 12.8
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