RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456467.1

SIX3-AS1-202, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 557 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa18.63■□□□□ 0.57
SIX3-AS1-202ENST00000456467 COL24A1Q17RW2 1714 aa18.63■□□□□ 0.57
SIX3-AS1-202ENST00000456467 LTN1O94822 1766 aa18.63■□□□□ 0.57
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SMIM5Q71RC9 77 aa18.62■□□□□ 0.57
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MON2Q7Z3U7 1717 aa18.62■□□□□ 0.57
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SIX3-AS1-202ENST00000456467 WWC3Q9ULE0 1092 aa18.61■□□□□ 0.57
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SIX3-AS1-202ENST00000456467 HOXC9P31274 260 aa18.6■□□□□ 0.57
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SIX3-AS1-202ENST00000456467 USHBP1Q8N6Y0 703 aa18.59■□□□□ 0.57
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NBPF4Q96M43 638 aa18.59■□□□□ 0.57
SIX3-AS1-202ENST00000456467 A0A1W2PP64 1363 aa18.58■□□□□ 0.57
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SIX3-AS1-202ENST00000456467 TERF2IPQ9NYB0 399 aa18.58■□□□□ 0.56
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SIX3-AS1-202ENST00000456467 HSPA6P17066 643 aa18.54■□□□□ 0.56
SIX3-AS1-202ENST00000456467 COG3Q96JB2 828 aa18.54■□□□□ 0.56
SIX3-AS1-202ENST00000456467 LY75O60449 1722 aa18.54■□□□□ 0.56
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa18.53■□□□□ 0.56
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RGPD2P0DJD1 1756 aa18.53■□□□□ 0.56
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SIX3-AS1-202ENST00000456467 ADCY9O60503 1353 aa18.49■□□□□ 0.55
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SIX3-AS1-202ENST00000456467 CYP27B1O15528 508 aa18.48■□□□□ 0.55
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PHF14O94880 888 aa18.48■□□□□ 0.55
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TATP17735 454 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
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SIX3-AS1-202ENST00000456467 TESK2Q96S53 571 aa18.48■□□□□ 0.55
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GGNBP2Q9H3C7 697 aa18.48■□□□□ 0.55
SIX3-AS1-202ENST00000456467 IGSF1Q8N6C5 1336 aa18.48■□□□□ 0.55
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SIX3-AS1-202ENST00000456467 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa18.4■□□□□ 0.54
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa18.4■□□□□ 0.54
SIX3-AS1-202ENST00000456467 C5P01031 1676 aa18.4■□□□□ 0.54
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ASAP1Q9ULH1 1129 aa18.39■□□□□ 0.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TAF1LQ8IZX4 1826 aa18.38■□□□□ 0.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa18.38■□□□□ 0.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 A0A0G2JLW4 131 aa18.38■□□□□ 0.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SIK1P57059 783 aa18.38■□□□□ 0.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RTL1A6NKG5 1358 aa18.37■□□□□ 0.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 INSRP06213 1382 aa18.37■□□□□ 0.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 C4BP0C0L5 1744 aa18.37■□□□□ 0.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MMP10P09238 476 aa18.36■□□□□ 0.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SSFA2P28290 1259 aa18.36■□□□□ 0.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa18.36■□□□□ 0.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa18.36■□□□□ 0.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GNPATO15228 680 aa18.35■□□□□ 0.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HTRA3P83110 453 aa18.35■□□□□ 0.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NMRK2Q9NPI5 230 aa18.35■□□□□ 0.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ATP6V1AP38606 617 aa18.34■□□□□ 0.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa18.34■□□□□ 0.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 BCS1LQ9Y276 419 aa18.34■□□□□ 0.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TOMM70O94826 608 aa18.33■□□□□ 0.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 APLP1P51693 650 aa18.33■□□□□ 0.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CARD14Q9BXL6 1004 aa18.33■□□□□ 0.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ATG3Q9NT62 314 aa18.33■□□□□ 0.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ITGB4P16144 1822 aa18.33■□□□□ 0.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 UBR3Q6ZT12 1888 aa18.32■□□□□ 0.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DPEP1P16444 411 aa18.31■□□□□ 0.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SLC4A9Q96Q91 983 aa18.31■□□□□ 0.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TMOD3Q9NYL9 352 aa18.31■□□□□ 0.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 EYA1Q99502 592 aa18.3■□□□□ 0.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SPG7Q9UQ90 795 aa18.3■□□□□ 0.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FLT4P35916 1363 aa18.3■□□□□ 0.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PXDNLA1KZ92 1463 aa18.29■□□□□ 0.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TGFB2P61812 414 aa18.29■□□□□ 0.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TRAPPC3LQ5T215 181 aa18.29■□□□□ 0.52
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