RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454825.1

REXO4-204, Transcript of REX4 homolog, 3'-5' exonuclease, human

TSL 3

Gene REXO4, Length 833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
REXO4-204	ENST00000454825	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	33.83	■■■■□ 3.01
REXO4-204	ENST00000454825	NBPF14	Q5TI25	921 aa		33.83	■■■■□ 3.01
REXO4-204	ENST00000454825	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	33.81	■■■■□ 3
REXO4-204	ENST00000454825	POLK	Q9UBT6	870 aa		33.81	■■■■□ 3
REXO4-204	ENST00000454825	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		33.79	■■■■□ 3
REXO4-204	ENST00000454825	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	33.79	■■■■□ 3
REXO4-204	ENST00000454825	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		33.79	■■■■□ 3
REXO4-204	ENST00000454825	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		33.79	■■■■□ 3
REXO4-204	ENST00000454825	TXNRD1	Q16881	649 aa		33.78	■■■■□ 3
REXO4-204	ENST00000454825	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	33.78	■■■■□ 3
REXO4-204	ENST00000454825	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		33.77	■■■■□ 3
REXO4-204	ENST00000454825	NSD2	O96028	1365 aa		33.74	■■■□□ 2.99
REXO4-204	ENST00000454825	NCAPD2	Q15021	1401 aa		33.74	■■■□□ 2.99
REXO4-204	ENST00000454825	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	33.73	■■■□□ 2.99
REXO4-204	ENST00000454825	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		33.7	■■■□□ 2.98
REXO4-204	ENST00000454825	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
REXO4-204	ENST00000454825	EYA1	Q99502	592 aa		33.69	■■■□□ 2.98
REXO4-204	ENST00000454825	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		33.68	■■■□□ 2.98
REXO4-204	ENST00000454825	CASZ1	Q86V15	1759 aa		33.67	■■■□□ 2.98
REXO4-204	ENST00000454825	PAPPA	Q13219	1627 aa		33.66	■■■□□ 2.98
REXO4-204	ENST00000454825	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	33.66	■■■□□ 2.98
REXO4-204	ENST00000454825	MORC1	Q86VD1	984 aa		33.65	■■■□□ 2.98
REXO4-204	ENST00000454825	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	33.65	■■■□□ 2.98
REXO4-204	ENST00000454825	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	33.64	■■■□□ 2.98
REXO4-204	ENST00000454825	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		33.63	■■■□□ 2.97
REXO4-204	ENST00000454825	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		33.63	■■■□□ 2.97
REXO4-204	ENST00000454825	CYP27B1	O15528	508 aa		33.62	■■■□□ 2.97
REXO4-204	ENST00000454825	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	33.62	■■■□□ 2.97
REXO4-204	ENST00000454825	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		33.61	■■■□□ 2.97
REXO4-204	ENST00000454825	STK32B	Q9NY57	414 aa		33.61	■■■□□ 2.97
REXO4-204	ENST00000454825	LY75	O60449	1722 aa		33.61	■■■□□ 2.97
REXO4-204	ENST00000454825	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		33.6	■■■□□ 2.97
REXO4-204	ENST00000454825	SLC15A2	Q16348	729 aa		33.59	■■■□□ 2.97
REXO4-204	ENST00000454825	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
REXO4-204	ENST00000454825	ITGB4	P16144	1822 aa		33.58	■■■□□ 2.97
REXO4-204	ENST00000454825	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		33.54	■■■□□ 2.96
REXO4-204	ENST00000454825	SPON1	Q9HCB6	807 aa		33.54	■■■□□ 2.96
REXO4-204	ENST00000454825	SPG7	Q9UQ90	795 aa		33.53	■■■□□ 2.96
REXO4-204	ENST00000454825	KCNQ4	P56696	695 aa		33.52	■■■□□ 2.96
REXO4-204	ENST00000454825	ZNF827	Q17R98	1081 aa		33.52	■■■□□ 2.96
REXO4-204	ENST00000454825	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		33.52	■■■□□ 2.96
REXO4-204	ENST00000454825	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	33.51	■■■□□ 2.95
REXO4-204	ENST00000454825	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	33.49	■■■□□ 2.95
REXO4-204	ENST00000454825	ZBTB7A	O95365	584 aa		33.48	■■■□□ 2.95
REXO4-204	ENST00000454825	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		33.48	■■■□□ 2.95
REXO4-204	ENST00000454825	AKT1S1	Q96B36	256 aa		33.47	■■■□□ 2.95
REXO4-204	ENST00000454825	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		33.46	■■■□□ 2.95
REXO4-204	ENST00000454825	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
REXO4-204	ENST00000454825	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		33.46	■■■□□ 2.95
REXO4-204	ENST00000454825	PHKG2	P15735	406 aa		33.44	■■■□□ 2.94
REXO4-204	ENST00000454825	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		33.43	■■■□□ 2.94
REXO4-204	ENST00000454825	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
REXO4-204	ENST00000454825	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		33.43	■■■□□ 2.94
REXO4-204	ENST00000454825	IL13	P35225	146 aa		33.42	■■■□□ 2.94
REXO4-204	ENST00000454825	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
REXO4-204	ENST00000454825	MTHFS	P49914	203 aa		33.41	■■■□□ 2.94
REXO4-204	ENST00000454825	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		33.41	■■■□□ 2.94
REXO4-204	ENST00000454825	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		33.4	■■■□□ 2.94
REXO4-204	ENST00000454825	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		33.4	■■■□□ 2.94
REXO4-204	ENST00000454825	PIGB	Q92521	554 aa		33.4	■■■□□ 2.94
REXO4-204	ENST00000454825	PALLD	Q8WX93	1383 aa		33.39	■■■□□ 2.94
REXO4-204	ENST00000454825	PTGER2	P43116	358 aa		33.39	■■■□□ 2.94
REXO4-204	ENST00000454825	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
REXO4-204	ENST00000454825	C5	P01031	1676 aa		33.39	■■■□□ 2.94
REXO4-204	ENST00000454825	MTFR1L	Q9H019	292 aa		33.37	■■■□□ 2.93
REXO4-204	ENST00000454825	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
REXO4-204	ENST00000454825	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		33.35	■■■□□ 2.93
REXO4-204	ENST00000454825	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		33.35	■■■□□ 2.93
REXO4-204	ENST00000454825	KDR	P35968	1356 aa		33.34	■■■□□ 2.93
REXO4-204	ENST00000454825	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
REXO4-204	ENST00000454825	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		33.33	■■■□□ 2.93
REXO4-204	ENST00000454825	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		33.33	■■■□□ 2.93
REXO4-204	ENST00000454825	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		33.32	■■■□□ 2.92
REXO4-204	ENST00000454825	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
REXO4-204	ENST00000454825	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		33.3	■■■□□ 2.92
REXO4-204	ENST00000454825	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
REXO4-204	ENST00000454825	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
REXO4-204	ENST00000454825	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		33.28	■■■□□ 2.92
REXO4-204	ENST00000454825	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		33.28	■■■□□ 2.92
REXO4-204	ENST00000454825	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.92
REXO4-204	ENST00000454825	C4B	P0C0L5	1744 aa		33.26	■■■□□ 2.92
REXO4-204	ENST00000454825	DCAF5	Q96JK2	942 aa		33.26	■■■□□ 2.91
REXO4-204	ENST00000454825	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
REXO4-204	ENST00000454825	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
REXO4-204	ENST00000454825	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		33.24	■■■□□ 2.91
REXO4-204	ENST00000454825	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		33.23	■■■□□ 2.91
REXO4-204	ENST00000454825	HMOX1	P09601	288 aa		33.23	■■■□□ 2.91
REXO4-204	ENST00000454825	ATG3	Q9NT62	314 aa		33.23	■■■□□ 2.91
REXO4-204	ENST00000454825	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		33.22	■■■□□ 2.91
REXO4-204	ENST00000454825	SIK1	P57059	783 aa		33.22	■■■□□ 2.91
REXO4-204	ENST00000454825	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
REXO4-204	ENST00000454825	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		33.21	■■■□□ 2.91
REXO4-204	ENST00000454825	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		33.2	■■■□□ 2.91
REXO4-204	ENST00000454825	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		33.2	■■■□□ 2.91
REXO4-204	ENST00000454825	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
REXO4-204	ENST00000454825	ARX	Q96QS3	562 aa		33.18	■■■□□ 2.9
REXO4-204	ENST00000454825	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
REXO4-204	ENST00000454825	ITPK1	Q13572	414 aa		33.17	■■■□□ 2.9
REXO4-204	ENST00000454825	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		33.16	■■■□□ 2.9
REXO4-204	ENST00000454825	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		33.16	■■■□□ 2.9

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