RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451506.5

PTPRN-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 466 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-209ENST00000451506 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRN-209ENST00000451506 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.05■■□□□ 1.44
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PTPRN-209ENST00000451506 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PTPRN-209ENST00000451506 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
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PTPRN-209ENST00000451506 LY75O60449 1722 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRN-209ENST00000451506 RTL1A6NKG5 1358 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRN-209ENST00000451506 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.02■■□□□ 1.44
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PTPRN-209ENST00000451506 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRN-209ENST00000451506 PALLDQ8WX93 1383 aa23.85■■□□□ 1.41
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PTPRN-209ENST00000451506 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRN-209ENST00000451506 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRN-209ENST00000451506 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.83■■□□□ 1.41
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PTPRN-209ENST00000451506 ITGB4P16144 1822 aa23.77■■□□□ 1.4
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PTPRN-209ENST00000451506 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.39
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PTPRN-209ENST00000451506 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRN-209ENST00000451506 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRN-209ENST00000451506 ITPK1Q13572 414 aa23.66■■□□□ 1.38
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PTPRN-209ENST00000451506 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRN-209ENST00000451506 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PTPRN-209ENST00000451506 GNPATO15228 680 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRN-209ENST00000451506 ATP6V1AP38606 617 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRN-209ENST00000451506 ATG3Q9NT62 314 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRN-209ENST00000451506 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRN-209ENST00000451506 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PTPRN-209ENST00000451506 KDRP35968 1356 aa23.59■■□□□ 1.37
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