RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442309.5

GCFC2-204, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 5

Gene GCFC2, Length 642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-204	ENST00000442309	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
GCFC2-204	ENST00000442309	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
GCFC2-204	ENST00000442309	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		28.77	■■■□□ 2.2
GCFC2-204	ENST00000442309	STK32B	Q9NY57	414 aa		28.76	■■■□□ 2.19
GCFC2-204	ENST00000442309	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		28.76	■■■□□ 2.19
GCFC2-204	ENST00000442309	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
GCFC2-204	ENST00000442309	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
GCFC2-204	ENST00000442309	PANK3	Q9H999	370 aa		28.75	■■■□□ 2.19
GCFC2-204	ENST00000442309	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		28.74	■■■□□ 2.19
GCFC2-204	ENST00000442309	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
GCFC2-204	ENST00000442309	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
GCFC2-204	ENST00000442309	CASZ1	Q86V15	1759 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GCFC2-204	ENST00000442309	SPON1	Q9HCB6	807 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GCFC2-204	ENST00000442309	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
GCFC2-204	ENST00000442309	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
GCFC2-204	ENST00000442309	SLC15A2	Q16348	729 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GCFC2-204	ENST00000442309	POLK	Q9UBT6	870 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GCFC2-204	ENST00000442309	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GCFC2-204	ENST00000442309	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
GCFC2-204	ENST00000442309	PAPPA	Q13219	1627 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GCFC2-204	ENST00000442309	NSD2	O96028	1365 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GCFC2-204	ENST00000442309	ZBTB7A	O95365	584 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GCFC2-204	ENST00000442309	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GCFC2-204	ENST00000442309	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GCFC2-204	ENST00000442309	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GCFC2-204	ENST00000442309	ZNF827	Q17R98	1081 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GCFC2-204	ENST00000442309	EYA1	Q99502	592 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GCFC2-204	ENST00000442309	NCAPD2	Q15021	1401 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GCFC2-204	ENST00000442309	KCNQ4	P56696	695 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GCFC2-204	ENST00000442309	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
GCFC2-204	ENST00000442309	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GCFC2-204	ENST00000442309	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GCFC2-204	ENST00000442309	CYP27B1	O15528	508 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GCFC2-204	ENST00000442309	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
GCFC2-204	ENST00000442309	LY75	O60449	1722 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GCFC2-204	ENST00000442309	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GCFC2-204	ENST00000442309	MORC1	Q86VD1	984 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GCFC2-204	ENST00000442309	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GCFC2-204	ENST00000442309	SPG7	Q9UQ90	795 aa		28.55	■■■□□ 2.16
GCFC2-204	ENST00000442309	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		28.55	■■■□□ 2.16
GCFC2-204	ENST00000442309	PTGER2	P43116	358 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GCFC2-204	ENST00000442309	AKT1S1	Q96B36	256 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GCFC2-204	ENST00000442309	MTFR1L	Q9H019	292 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GCFC2-204	ENST00000442309	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
GCFC2-204	ENST00000442309	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GCFC2-204	ENST00000442309	ITGB4	P16144	1822 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GCFC2-204	ENST00000442309	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GCFC2-204	ENST00000442309	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GCFC2-204	ENST00000442309	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		28.49	■■■□□ 2.15
GCFC2-204	ENST00000442309	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		28.47	■■■□□ 2.15
GCFC2-204	ENST00000442309	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	28.47	■■■□□ 2.15
GCFC2-204	ENST00000442309	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	28.47	■■■□□ 2.15	2e-7	■■■■□ 20.9
GCFC2-204	ENST00000442309	PALLD	Q8WX93	1383 aa		28.47	■■■□□ 2.15
GCFC2-204	ENST00000442309	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		28.46	■■■□□ 2.15
GCFC2-204	ENST00000442309	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	28.46	■■■□□ 2.15
GCFC2-204	ENST00000442309	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		28.45	■■■□□ 2.14
GCFC2-204	ENST00000442309	PHKG2	P15735	406 aa		28.44	■■■□□ 2.14
GCFC2-204	ENST00000442309	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		28.44	■■■□□ 2.14
GCFC2-204	ENST00000442309	C5	P01031	1676 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GCFC2-204	ENST00000442309	PIGB	Q92521	554 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GCFC2-204	ENST00000442309	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
GCFC2-204	ENST00000442309	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
GCFC2-204	ENST00000442309	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		28.4	■■■□□ 2.14
GCFC2-204	ENST00000442309	MSH5	O43196	834 aa		28.39	■■■□□ 2.14
GCFC2-204	ENST00000442309	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	28.39	■■■□□ 2.14
GCFC2-204	ENST00000442309	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		28.39	■■■□□ 2.14
GCFC2-204	ENST00000442309	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		28.39	■■■□□ 2.14
GCFC2-204	ENST00000442309	ARX	Q96QS3	562 aa		28.39	■■■□□ 2.14
GCFC2-204	ENST00000442309	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		28.39	■■■□□ 2.13
GCFC2-204	ENST00000442309	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		28.38	■■■□□ 2.13
GCFC2-204	ENST00000442309	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	28.38	■■■□□ 2.13
GCFC2-204	ENST00000442309	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		28.37	■■■□□ 2.13
GCFC2-204	ENST00000442309	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
GCFC2-204	ENST00000442309	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	28.36	■■■□□ 2.13
GCFC2-204	ENST00000442309	SYT17	Q9BSW7	474 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GCFC2-204	ENST00000442309	IL13	P35225	146 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GCFC2-204	ENST00000442309	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GCFC2-204	ENST00000442309	POLD1	P28340	1107 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GCFC2-204	ENST00000442309	MTHFS	P49914	203 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GCFC2-204	ENST00000442309	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
GCFC2-204	ENST00000442309	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
GCFC2-204	ENST00000442309	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GCFC2-204	ENST00000442309	C4B	P0C0L5	1744 aa		28.33	■■■□□ 2.13
GCFC2-204	ENST00000442309	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		28.32	■■■□□ 2.12
GCFC2-204	ENST00000442309	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		28.32	■■■□□ 2.12
GCFC2-204	ENST00000442309	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GCFC2-204	ENST00000442309	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
GCFC2-204	ENST00000442309	SIK1	P57059	783 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GCFC2-204	ENST00000442309	KLHL34	Q8N239	644 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GCFC2-204	ENST00000442309	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
GCFC2-204	ENST00000442309	AK7	Q96M32	723 aa		28.3	■■■□□ 2.12
GCFC2-204	ENST00000442309	DCAF5	Q96JK2	942 aa		28.29	■■■□□ 2.12
GCFC2-204	ENST00000442309	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
GCFC2-204	ENST00000442309	KDR	P35968	1356 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GCFC2-204	ENST00000442309	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GCFC2-204	ENST00000442309	MSL1	Q68DK7	614 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GCFC2-204	ENST00000442309	ATG3	Q9NT62	314 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GCFC2-204	ENST00000442309	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GCFC2-204	ENST00000442309	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GCFC2-204	ENST00000442309	MAP3K5	Q99683	1374 aa		28.25	■■■□□ 2.11

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