RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 NHSQ6T4R5 1651 aa37.99■■■■□ 3.67
FAAP20-210ENST00000440825 KAT6BQ8WYB5 2073 aa37.99■■■■□ 3.67
FAAP20-210ENST00000440825 NSD2O96028 1365 aa37.98■■■■□ 3.67
FAAP20-210ENST00000440825 TATP17735 454 aaPredicted RBP37.98■■■■□ 3.67
FAAP20-210ENST00000440825 MORC1Q86VD1 984 aa37.98■■■■□ 3.67
FAAP20-210ENST00000440825 WASHC2AQ641Q2 1341 aa37.97■■■■□ 3.67
FAAP20-210ENST00000440825 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
FAAP20-210ENST00000440825 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa37.96■■■■□ 3.67
FAAP20-210ENST00000440825 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP37.93■■■■□ 3.66
FAAP20-210ENST00000440825 SHANK3Q9BYB0 1731 aa37.92■■■■□ 3.66
FAAP20-210ENST00000440825 TXNRD1Q16881 649 aa37.89■■■■□ 3.66
FAAP20-210ENST00000440825 PROM2Q8N271 834 aa37.89■■■■□ 3.66
FAAP20-210ENST00000440825 EYA1Q99502 592 aa37.88■■■■□ 3.65
FAAP20-210ENST00000440825 BTAF1O14981 1849 aa37.88■■■■□ 3.65
FAAP20-210ENST00000440825 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
FAAP20-210ENST00000440825 DOT1LQ8TEK3 1739 aa37.86■■■■□ 3.65
FAAP20-210ENST00000440825 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP37.85■■■■□ 3.65
FAAP20-210ENST00000440825 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
FAAP20-210ENST00000440825 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
FAAP20-210ENST00000440825 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
FAAP20-210ENST00000440825 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa37.83■■■■□ 3.65
FAAP20-210ENST00000440825 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa37.83■■■■□ 3.65
FAAP20-210ENST00000440825 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP37.8■■■■□ 3.64
FAAP20-210ENST00000440825 LRP5O75197 1615 aa37.79■■■■□ 3.64
FAAP20-210ENST00000440825 NCAPD2Q15021 1401 aa37.78■■■■□ 3.64
FAAP20-210ENST00000440825 STK32BQ9NY57 414 aa37.76■■■■□ 3.64
FAAP20-210ENST00000440825 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
FAAP20-210ENST00000440825 SPG7Q9UQ90 795 aa37.75■■■■□ 3.63
FAAP20-210ENST00000440825 CYP27B1O15528 508 aa37.74■■■■□ 3.63
FAAP20-210ENST00000440825 PKD1L3Q7Z443 1732 aa37.73■■■■□ 3.63
FAAP20-210ENST00000440825 IGSF1Q8N6C5 1336 aa37.69■■■■□ 3.62
FAAP20-210ENST00000440825 SLC15A2Q16348 729 aa37.67■■■■□ 3.62
FAAP20-210ENST00000440825 LRRC4BQ9NT99 713 aa37.67■■■■□ 3.62
FAAP20-210ENST00000440825 MTHFSP49914 203 aa37.65■■■■□ 3.62
FAAP20-210ENST00000440825 KCNQ4P56696 695 aa37.65■■■■□ 3.62
FAAP20-210ENST00000440825 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa37.65■■■■□ 3.62
FAAP20-210ENST00000440825 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
FAAP20-210ENST00000440825 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP37.62■■■■□ 3.61
FAAP20-210ENST00000440825 SLC27A3Q5K4L6 730 aa37.61■■■■□ 3.61
FAAP20-210ENST00000440825 SPON1Q9HCB6 807 aa37.61■■■■□ 3.61
FAAP20-210ENST00000440825 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa37.61■■■■□ 3.61
FAAP20-210ENST00000440825 AEBP1Q8IUX7 1158 aa37.6■■■■□ 3.61
FAAP20-210ENST00000440825 IFNL2Q8IZJ0 200 aa37.6■■■■□ 3.61
FAAP20-210ENST00000440825 PAPPAQ13219 1627 aa37.59■■■■□ 3.61
FAAP20-210ENST00000440825 ZBTB7AO95365 584 aa37.58■■■■□ 3.61
FAAP20-210ENST00000440825 PHKG2P15735 406 aa37.58■■■■□ 3.61
FAAP20-210ENST00000440825 IL13P35225 146 aa37.58■■■■□ 3.61
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF827Q17R98 1081 aa37.58■■■■□ 3.61
FAAP20-210ENST00000440825 SULT6B1Q6IMI4 303 aa37.58■■■■□ 3.61
FAAP20-210ENST00000440825 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP37.58■■■■□ 3.61
FAAP20-210ENST00000440825 CASZ1Q86V15 1759 aa37.57■■■■□ 3.61
FAAP20-210ENST00000440825 LY75O60449 1722 aa37.56■■■■□ 3.6
FAAP20-210ENST00000440825 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP37.56■■■■□ 3.6
FAAP20-210ENST00000440825 ITGB4P16144 1822 aa37.55■■■■□ 3.6
FAAP20-210ENST00000440825 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP37.55■■■■□ 3.6
FAAP20-210ENST00000440825 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP37.55■■■■□ 3.6
FAAP20-210ENST00000440825 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa37.55■■■■□ 3.6
FAAP20-210ENST00000440825 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP37.52■■■■□ 3.6
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.6
FAAP20-210ENST00000440825 PIGBQ92521 554 aa37.51■■■■□ 3.6
FAAP20-210ENST00000440825 PALLDQ8WX93 1383 aa37.51■■■■□ 3.59
FAAP20-210ENST00000440825 TMOD3Q9NYL9 352 aa37.5■■■■□ 3.59
FAAP20-210ENST00000440825 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa37.48■■■■□ 3.59
FAAP20-210ENST00000440825 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP37.48■■■■□ 3.59
FAAP20-210ENST00000440825 AMOTQ4VCS5 1084 aa37.48■■■■□ 3.59
FAAP20-210ENST00000440825 AKT1S1Q96B36 256 aa37.48■■■■□ 3.59
FAAP20-210ENST00000440825 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa37.48■■■■□ 3.59
FAAP20-210ENST00000440825 HMOX1P09601 288 aa37.47■■■■□ 3.59
FAAP20-210ENST00000440825 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP37.46■■■■□ 3.59
FAAP20-210ENST00000440825 C1orf141Q5JVX7 400 aa37.44■■■■□ 3.58
FAAP20-210ENST00000440825 KDRP35968 1356 aa37.43■■■■□ 3.58
FAAP20-210ENST00000440825 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
FAAP20-210ENST00000440825 MTFR1LQ9H019 292 aa37.41■■■■□ 3.58
FAAP20-210ENST00000440825 DCAF5Q96JK2 942 aa37.4■■■■□ 3.58
FAAP20-210ENST00000440825 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
FAAP20-210ENST00000440825 ASAP1Q9ULH1 1129 aa37.39■■■■□ 3.58
FAAP20-210ENST00000440825 C5P01031 1676 aa37.38■■■■□ 3.57
FAAP20-210ENST00000440825 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa37.38■■■■□ 3.57
FAAP20-210ENST00000440825 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa37.37■■■■□ 3.57
FAAP20-210ENST00000440825 MSH5O43196 834 aa37.37■■■■□ 3.57
FAAP20-210ENST00000440825 ERVV-2B6SEH9 535 aa37.35■■■■□ 3.57
FAAP20-210ENST00000440825 PTGER2P43116 358 aa37.35■■■■□ 3.57
FAAP20-210ENST00000440825 CABP4P57796 275 aa37.35■■■■□ 3.57
FAAP20-210ENST00000440825 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP37.35■■■■□ 3.57
FAAP20-210ENST00000440825 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
FAAP20-210ENST00000440825 QSER1Q2KHR3 1735 aa37.33■■■■□ 3.57
FAAP20-210ENST00000440825 CFAP53Q96M91 514 aa37.33■■■■□ 3.57
FAAP20-210ENST00000440825 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa37.32■■■■□ 3.56
FAAP20-210ENST00000440825 SIK1P57059 783 aa37.32■■■■□ 3.56
FAAP20-210ENST00000440825 ATG3Q9NT62 314 aa37.32■■■■□ 3.56
FAAP20-210ENST00000440825 TAF1LQ8IZX4 1826 aa37.31■■■■□ 3.56
FAAP20-210ENST00000440825 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
FAAP20-210ENST00000440825 PPP2R1AP30153 589 aa37.29■■■■□ 3.56
FAAP20-210ENST00000440825 AK7Q96M32 723 aa37.28■■■■□ 3.56
FAAP20-210ENST00000440825 ATP6V1AP38606 617 aa37.27■■■■□ 3.56
FAAP20-210ENST00000440825 AKAP4Q5JQC9 854 aa37.27■■■■□ 3.56
FAAP20-210ENST00000440825 SLC16A10Q8TF71 515 aa37.27■■■■□ 3.56
FAAP20-210ENST00000440825 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
FAAP20-210ENST00000440825 C4BP0C0L5 1744 aa37.26■■■■□ 3.56
FAAP20-210ENST00000440825 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms