RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439686.6

ARL6IP4-208, Transcript of ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 4, human

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene ARL6IP4, Length 796 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MTHFS	P49914	203 aa		33.44	■■■□□ 2.94
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		33.41	■■■□□ 2.94
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NCAPD2	Q15021	1401 aa		33.39	■■■□□ 2.94
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PLSCR1	O15162	318 aa		33.38	■■■□□ 2.93
ARL6IP4-208	ENST00000439686	IL13	P35225	146 aa		33.37	■■■□□ 2.93
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PROM2	Q8N271	834 aa		33.37	■■■□□ 2.93
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SBF2	Q86WG5	1849 aa		33.37	■■■□□ 2.93
ARL6IP4-208	ENST00000439686	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		33.35	■■■□□ 2.93
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CYP27B1	O15528	508 aa		33.35	■■■□□ 2.93
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
ARL6IP4-208	ENST00000439686	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		33.33	■■■□□ 2.93
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		33.33	■■■□□ 2.93
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
ARL6IP4-208	ENST00000439686	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SPG7	Q9UQ90	795 aa		33.29	■■■□□ 2.92
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		33.28	■■■□□ 2.92
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		33.28	■■■□□ 2.92
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		33.28	■■■□□ 2.92
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		33.27	■■■□□ 2.92
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TXNRD1	Q16881	649 aa		33.26	■■■□□ 2.91
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	33.26	■■■□□ 2.91	3e-20	■□□□□ 8.7
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NHS	Q6T4R5	1651 aa		33.23	■■■□□ 2.91
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PPP2R1A	P30153	589 aa		33.21	■■■□□ 2.91
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NBPF14	Q5TI25	921 aa		33.21	■■■□□ 2.91
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PHKG2	P15735	406 aa		33.2	■■■□□ 2.91
ARL6IP4-208	ENST00000439686	HMOX1	P09601	288 aa		33.19	■■■□□ 2.9
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
ARL6IP4-208	ENST00000439686	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		33.18	■■■□□ 2.9
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		33.16	■■■□□ 2.9
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		33.16	■■■□□ 2.9
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RREB1	Q92766	1687 aa		33.16	■■■□□ 2.9
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KDR	P35968	1356 aa		33.15	■■■□□ 2.9
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KCNQ4	P56696	695 aa		33.15	■■■□□ 2.9
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		33.14	■■■□□ 2.89
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		33.14	■■■□□ 2.89
ARL6IP4-208	ENST00000439686	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		33.13	■■■□□ 2.89
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BTAF1	O14981	1849 aa		33.13	■■■□□ 2.89
ARL6IP4-208	ENST00000439686	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
ARL6IP4-208	ENST00000439686	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PIGB	Q92521	554 aa		33.12	■■■□□ 2.89
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		33.12	■■■□□ 2.89
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		33.11	■■■□□ 2.89
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CFAP53	Q96M91	514 aa		33.08	■■■□□ 2.89
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		33.08	■■■□□ 2.89
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		33.06	■■■□□ 2.88
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SLC15A2	Q16348	729 aa		33.05	■■■□□ 2.88
ARL6IP4-208	ENST00000439686	STK32B	Q9NY57	414 aa		33.05	■■■□□ 2.88
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		33.04	■■■□□ 2.88
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
ARL6IP4-208	ENST00000439686	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		33.02	■■■□□ 2.88
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DCAF5	Q96JK2	942 aa		33.02	■■■□□ 2.88
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		33.02	■■■□□ 2.88
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		33.02	■■■□□ 2.88
ARL6IP4-208	ENST00000439686	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZNF827	Q17R98	1081 aa		33.01	■■■□□ 2.87
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		33	■■■□□ 2.87
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.98	■■■□□ 2.87
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
ARL6IP4-208	ENST00000439686	AKT1S1	Q96B36	256 aa		32.98	■■■□□ 2.87
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.97	■■■□□ 2.87
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.97	■■■□□ 2.87
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NUDC	Q9Y266	331 aa		32.97	■■■□□ 2.87
ARL6IP4-208	ENST00000439686	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
ARL6IP4-208	ENST00000439686	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	32.96	■■■□□ 2.87
ARL6IP4-208	ENST00000439686	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		32.96	■■■□□ 2.87
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.96	■■■□□ 2.87
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CABP4	P57796	275 aa		32.94	■■■□□ 2.86
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RALBP1	Q15311	655 aa		32.94	■■■□□ 2.86
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		32.94	■■■□□ 2.86
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		32.94	■■■□□ 2.86
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PRKAR2B	P31323	418 aa		32.92	■■■□□ 2.86
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.92	■■■□□ 2.86
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ITGB4	P16144	1822 aa		32.92	■■■□□ 2.86
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.89	■■■□□ 2.86
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZBTB7A	O95365	584 aa		32.89	■■■□□ 2.86
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.88	■■■□□ 2.85
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SIK1	P57059	783 aa		32.88	■■■□□ 2.85
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LY75	O60449	1722 aa		32.87	■■■□□ 2.85
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		32.86	■■■□□ 2.85
ARL6IP4-208	ENST00000439686	FCHSD2	O94868	740 aa		32.85	■■■□□ 2.85
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ITPK1	Q13572	414 aa		32.84	■■■□□ 2.85
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		32.84	■■■□□ 2.85
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SPON1	Q9HCB6	807 aa		32.84	■■■□□ 2.85
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		32.83	■■■□□ 2.85

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