RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PTF1AQ7RTS3 328 aa12.82□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AEBP1Q8IUX7 1158 aa12.82□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EYA1Q99502 592 aa12.82□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SCN11AQ9UI33 1791 aa12.81□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa12.81□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IL2RBP14784 551 aa12.81□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MTHFSP49914 203 aa12.81□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGSF1Q8N6C5 1336 aa12.81□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DDB1Q16531 1140 aa12.8□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PPP2R1AP30153 589 aa12.79□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LY75O60449 1722 aa12.79□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IL13P35225 146 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PDE3BQ13370 1112 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DEFB132Q7Z7B7 95 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRIM37O94972 964 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TAF1LQ8IZX4 1826 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ACSBG1Q96GR2 724 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KDRP35968 1356 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PAPPAQ13219 1627 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BCL9O00512 1426 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EXOC5O00471 708 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HMOX1P09601 288 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TATP17735 454 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CYP27B1O15528 508 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KCNQ2O43526 872 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SULT6B1Q6IMI4 303 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM196AQ6ZSG2 479 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C5P01031 1676 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa12.71□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa12.71□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-215ENST00000436996 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MRC1P22897 1456 aa12.7□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UBR2Q8IWV8 1755 aa12.69□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TJP1Q07157 1748 aa12.69□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CASZ1Q86V15 1759 aa12.69□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 APBA3O96018 575 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PHKG2P15735 406 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RALBP1Q15311 655 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC184Q52MB2 194 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RSPH6AQ9H0K4 717 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 QSER1Q2KHR3 1735 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CFAP53Q96M91 514 aa12.66□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UBR3Q6ZT12 1888 aa12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRKAR2BP31323 418 aa12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BAG6P46379 1132 aa12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CAMKK2Q96RR4 588 aa12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KDM3BQ7LBC6 1761 aa12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PHACTR3Q96KR7 559 aa12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPG7Q9UQ90 795 aa12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C4BP0C0L5 1744 aa12.63□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KCNQ4P56696 695 aa12.63□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa12.63□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C4AP0C0L4 1744 aa12.62□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF831Q5JPB2 1677 aa12.62□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC125Q86Z20 511 aa12.62□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IFNL2Q8IZJ0 200 aa12.62□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PROM2Q8N271 834 aa12.62□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP12.62□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KCPQ6ZWJ8 1503 aa12.62□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAP3K5Q99683 1374 aa12.61□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa12.61□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PALLDQ8WX93 1383 aa12.6□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PIGBQ92521 554 aa12.6□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LAMB4A4D0S4 1761 aa12.6□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C1orf141Q5JVX7 400 aa12.59□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC146Q8IYE0 955 aa12.59□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LGR6Q9HBX8 967 aa12.59□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LRRC4BQ9NT99 713 aa12.59□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa12.58□□□□□ -0.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TXNRD1Q16881 649 aa12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms