RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436071.1

PGAM1P2-201, Transcript of phosphoglycerate mutase 1 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGAM1P2, Length 725 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P2-201ENST00000436071 TESK2Q96S53 571 aa16.18■□□□□ 0.18
PGAM1P2-201ENST00000436071 KAT6BQ8WYB5 2073 aa16.16■□□□□ 0.18
PGAM1P2-201ENST00000436071 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PGAM1P2-201ENST00000436071 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PGAM1P2-201ENST00000436071 NSD2O96028 1365 aa16.14■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa16.14■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 MSH5O43196 834 aa16.14■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 C1QTNF8P60827 252 aa16.14■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 NBPF6Q5VWK0 638 aa16.14■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 USHBP1Q8N6Y0 703 aa16.14■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 NLGN2Q8NFZ4 835 aa16.14■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 NBPF4Q96M43 638 aa16.14■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 MEGF6O75095 1541 aa16.14■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 SLC24A1O60721 1099 aa16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 GGNBP2Q9H3C7 697 aa16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 USP47Q96K76 1375 aa16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 FYB1O15117 783 aa16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 RTL1A6NKG5 1358 aa16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 DOT1LQ8TEK3 1739 aa16.09■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 TATP17735 454 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 MSL1Q68DK7 614 aa16.09■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 CGNL1Q0VF96 1302 aa16.09■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PGAM1P2-201ENST00000436071 CHD4Q14839 1912 aa16.08■□□□□ 0.16
PGAM1P2-201ENST00000436071 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PGAM1P2-201ENST00000436071 TMF1P82094 1093 aa16.08■□□□□ 0.16
PGAM1P2-201ENST00000436071 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa16.08■□□□□ 0.16
PGAM1P2-201ENST00000436071 QSER1Q2KHR3 1735 aa16.08■□□□□ 0.16
PGAM1P2-201ENST00000436071 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
PGAM1P2-201ENST00000436071 GRIN3BO60391 1043 aa16.06■□□□□ 0.16
PGAM1P2-201ENST00000436071 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa16.06■□□□□ 0.16
PGAM1P2-201ENST00000436071 RGPD2P0DJD1 1756 aa16.05■□□□□ 0.16
PGAM1P2-201ENST00000436071 LY75O60449 1722 aa16.05■□□□□ 0.16
PGAM1P2-201ENST00000436071 SHANK3Q9BYB0 1731 aa16.05■□□□□ 0.16
PGAM1P2-201ENST00000436071 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa16.05■□□□□ 0.16
PGAM1P2-201ENST00000436071 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa16.05■□□□□ 0.16
PGAM1P2-201ENST00000436071 COL24A1Q17RW2 1714 aa16.05■□□□□ 0.16
PGAM1P2-201ENST00000436071 INSRP06213 1382 aa16.04■□□□□ 0.16
PGAM1P2-201ENST00000436071 PALLDQ8WX93 1383 aa16.04■□□□□ 0.16
PGAM1P2-201ENST00000436071 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa16.04■□□□□ 0.16
PGAM1P2-201ENST00000436071 CYP27B1O15528 508 aa16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P2-201ENST00000436071 FLAD1Q8NFF5 587 aa16.03■□□□□ 0.16
PGAM1P2-201ENST00000436071 FLT4P35916 1363 aa16.02■□□□□ 0.16
PGAM1P2-201ENST00000436071 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P2-201ENST00000436071 CDCA8Q53HL2 280 aa16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P2-201ENST00000436071 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P2-201ENST00000436071 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PGAM1P2-201ENST00000436071 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PGAM1P2-201ENST00000436071 AK7Q96M32 723 aa16■□□□□ 0.15
PGAM1P2-201ENST00000436071 CARD14Q9BXL6 1004 aa16■□□□□ 0.15
PGAM1P2-201ENST00000436071 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16■□□□□ 0.15
PGAM1P2-201ENST00000436071 KIF24Q5T7B8 1368 aa16■□□□□ 0.15
PGAM1P2-201ENST00000436071 PHF14O94880 888 aa15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P2-201ENST00000436071 SMIM5Q71RC9 77 aa15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P2-201ENST00000436071 AMIGO3Q86WK7 504 aa15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P2-201ENST00000436071 PIGBQ92521 554 aa15.98■□□□□ 0.15
PGAM1P2-201ENST00000436071 C5P01031 1676 aa15.96■□□□□ 0.15
PGAM1P2-201ENST00000436071 NSD3Q9BZ95 1437 aa15.96■□□□□ 0.15
PGAM1P2-201ENST00000436071 ATP10DQ9P241 1426 aa15.96■□□□□ 0.15
PGAM1P2-201ENST00000436071 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PGAM1P2-201ENST00000436071 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PGAM1P2-201ENST00000436071 WWC3Q9ULE0 1092 aa15.96■□□□□ 0.15
PGAM1P2-201ENST00000436071 SPG7Q9UQ90 795 aa15.96■□□□□ 0.15
PGAM1P2-201ENST00000436071 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.94■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 SIK1P57059 783 aa15.94■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 LINC00116Q8NCU8 138 aa15.94■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 EYA1Q99502 592 aa15.94■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 TMOD3Q9NYL9 352 aa15.93■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 C4BP0C0L5 1744 aa15.93■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 WASHC2AQ641Q2 1341 aa15.93■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 IGSF1Q8N6C5 1336 aa15.93■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.92■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa15.92■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 SSFA2P28290 1259 aa15.92■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 ASAP1Q9ULH1 1129 aa15.92■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 ATP6V1AP38606 617 aa15.91■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 ITPK1Q13572 414 aa15.91■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 IFNL2Q8IZJ0 200 aa15.91■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 NCAPD2Q15021 1401 aa15.91■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 CEP350Q5VT06 3117 aa15.91■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 GNPATO15228 680 aa15.9■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 PHKG2P15735 406 aa15.9■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 POLKQ9UBT6 870 aa15.9■□□□□ 0.14
PGAM1P2-201ENST00000436071 TAF1LQ8IZX4 1826 aa15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P2-201ENST00000436071 POLR3GLQ9BT43 218 aa15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P2-201ENST00000436071 ATG3Q9NT62 314 aa15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P2-201ENST00000436071 ADCY9O60503 1353 aa15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P2-201ENST00000436071 PKD1L3Q7Z443 1732 aa15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P2-201ENST00000436071 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P2-201ENST00000436071 ITGB4P16144 1822 aa15.87■□□□□ 0.13
PGAM1P2-201ENST00000436071 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PGAM1P2-201ENST00000436071 MMP10P09238 476 aa15.86■□□□□ 0.13
PGAM1P2-201ENST00000436071 UBR3Q6ZT12 1888 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9 ms