RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432588.5

ACTB-205, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-205ENST00000432588 MEGF6O75095 1541 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-205ENST00000432588 YY1P25490 414 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-205ENST00000432588 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-205ENST00000432588 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-205ENST00000432588 INSRP06213 1382 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-205ENST00000432588 FLT4P35916 1363 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-205ENST00000432588 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-205ENST00000432588 MYOM1P52179 1685 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-205ENST00000432588 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-205ENST00000432588 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-205ENST00000432588 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-205ENST00000432588 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-205ENST00000432588 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
ACTB-205ENST00000432588 ZNF827Q17R98 1081 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-205ENST00000432588 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-205ENST00000432588 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-205ENST00000432588 AKT1S1Q96B36 256 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-205ENST00000432588 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-205ENST00000432588 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-205ENST00000432588 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
ACTB-205ENST00000432588 NSD2O96028 1365 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-205ENST00000432588 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-205ENST00000432588 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-205ENST00000432588 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-205ENST00000432588 ARXQ96QS3 562 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-205ENST00000432588 SYT17Q9BSW7 474 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-205ENST00000432588 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-205ENST00000432588 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
ACTB-205ENST00000432588 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-205ENST00000432588 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
ACTB-205ENST00000432588 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ACTB-205ENST00000432588 KCNQ4P56696 695 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-205ENST00000432588 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-205ENST00000432588 LY75O60449 1722 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-205ENST00000432588 UTRNP46939 3433 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-205ENST00000432588 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-205ENST00000432588 POLD1P28340 1107 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-205ENST00000432588 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-205ENST00000432588 MAP3K5Q99683 1374 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-205ENST00000432588 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-205ENST00000432588 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
ACTB-205ENST00000432588 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-205ENST00000432588 CYP27B1O15528 508 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-205ENST00000432588 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-205ENST00000432588 SPG7Q9UQ90 795 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-205ENST00000432588 NCAPD2Q15021 1401 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-205ENST00000432588 MSH5O43196 834 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-205ENST00000432588 PALLDQ8WX93 1383 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-205ENST00000432588 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ACTB-205ENST00000432588 POLKQ9UBT6 870 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-205ENST00000432588 KLHL34Q8N239 644 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-205ENST00000432588 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ACTB-205ENST00000432588 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-205ENST00000432588 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-205ENST00000432588 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ACTB-205ENST00000432588 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
ACTB-205ENST00000432588 EYA1Q99502 592 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-205ENST00000432588 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
ACTB-205ENST00000432588 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
ACTB-205ENST00000432588 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ACTB-205ENST00000432588 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ACTB-205ENST00000432588 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-205ENST00000432588 GPR162Q16538 588 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-205ENST00000432588 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-205ENST00000432588 C5P01031 1676 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-205ENST00000432588 PANK3Q9H999 370 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-205ENST00000432588 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ACTB-205ENST00000432588 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-205ENST00000432588 PIGBQ92521 554 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-205ENST00000432588 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-205ENST00000432588 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-205ENST00000432588 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-205ENST00000432588 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ACTB-205ENST00000432588 AK7Q96M32 723 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-205ENST00000432588 ITGB4P16144 1822 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-205ENST00000432588 PHKG2P15735 406 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-205ENST00000432588 MSL1Q68DK7 614 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-205ENST00000432588 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ACTB-205ENST00000432588 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ACTB-205ENST00000432588 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-205ENST00000432588 C4BP0C0L5 1744 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-205ENST00000432588 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-205ENST00000432588 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-205ENST00000432588 SIK1P57059 783 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-205ENST00000432588 MORC1Q86VD1 984 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-205ENST00000432588 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-205ENST00000432588 CHD4Q14839 1912 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-205ENST00000432588 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-205ENST00000432588 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ACTB-205ENST00000432588 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-205ENST00000432588 PHF14O94880 888 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-205ENST00000432588 SSFA2P28290 1259 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-205ENST00000432588 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ACTB-205ENST00000432588 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ACTB-205ENST00000432588 ATP6V1AP38606 617 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-205ENST00000432588 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-205ENST00000432588 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-205ENST00000432588 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-205ENST00000432588 GRIN3BO60391 1043 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-205ENST00000432588 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.11■■□□□ 1.13
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