RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430930.5

TNS1-207, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-207ENST00000430930 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.46■□□□□ 0.07
TNS1-207ENST00000430930 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.46■□□□□ 0.07
TNS1-207ENST00000430930 CCDC66A2RUB6 948 aa15.46■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 STK3Q13188 491 aa15.46■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 CCDC191Q8NCU4 936 aa15.46■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 SLFN5Q08AF3 891 aa15.45■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 ALDH1L2Q3SY69 923 aa15.45■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 SPATA32Q96LK8 384 aa15.45■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 CEP131Q9UPN4 1083 aa15.45■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 FAM135AQ9P2D6 1515 aa15.45■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 UBAC1Q9BSL1 405 aa15.45■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 IQCEQ6IPM2 695 aa15.45■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 SMTNL1A8MU46 457 aa15.44■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 DEF6Q9H4E7 631 aa15.44■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 AKAP2Q9Y2D5 859 aa15.44■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 TMPOP42166 694 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 TDO2P48775 406 aa15.44■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 ATP2B2Q01814 1243 aa15.44■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 CEP57L1Q8IYX8 460 aa15.44■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 NUP133Q8WUM0 1156 aa15.44■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.44■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.44■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 NESP48681 1621 aa15.43■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa15.43■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 GOLGA6L10A6NI86 522 aa15.43■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP15.43■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 WDR97A6NE52 1622 aa15.43■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 ERLIN1O75477 346 aa15.43■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 LEKR1Q6ZMV7 388 aa15.43■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 STARD3NLO95772 234 aa15.42■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 CCDC181Q5TID7 509 aa15.42■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa15.42■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 NUP62CLQ9H1M0 184 aa15.42■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 KIF1BPQ96EK5 621 aa15.42■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 H0YHG0 523 aa15.42■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 GRPEL1Q9HAV7 217 aa15.42■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 ZNF287Q9HBT7 754 aa15.42■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 PRDM11Q9NQV5 511 aa15.42■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 SPC24Q8NBT2 197 aa15.41■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.41■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 NAIPQ13075 1403 aa15.41■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 TANGO6Q9C0B7 1094 aa15.41■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 PDCL3Q9H2J4 239 aa15.41■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 AMOTQ4VCS5 1084 aa15.4■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 CCDC112Q8NEF3 446 aa15.4■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 RAI14Q9P0K7 980 aa15.4■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 MAP3K1Q13233 1512 aa15.4■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.4■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 ZNF652Q9Y2D9 606 aa15.4■□□□□ 0.06
TNS1-207ENST00000430930 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP15.39■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 NSD2O96028 1365 aa15.39■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 AIDAQ96BJ3 306 aa15.39■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 TMEM57Q8N5G2 664 aa15.39■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 LRP2BPQ9P2M1 347 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 DESP17661 470 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 MX1P20591 662 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 ZHX3Q9H4I2 956 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 FBXO3Q9UK99 471 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.37■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 CASTP20810 708 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 ARHGEF11O15085 1522 aa15.37■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 MAP3K11Q16584 847 aa15.36■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 STK11IPQ8N1F8 1099 aa15.36■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 MCM4P33991 863 aa15.36■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.35■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa15.35■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 ZNF76P36508 570 aa15.35■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 SLC26A8Q96RN1 970 aa15.35■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa15.35■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TNS1-207ENST00000430930 METTL24Q5JXM2 366 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms