RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425753.6

TSTA3-201, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSTA3, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-201ENST00000425753 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
TSTA3-201ENST00000425753 RSPH6AQ9H0K4 717 aa27.22■■□□□ 1.95
TSTA3-201ENST00000425753 PKD1L3Q7Z443 1732 aa27.22■■□□□ 1.95
TSTA3-201ENST00000425753 FCHSD2O94868 740 aa27.22■■□□□ 1.95
TSTA3-201ENST00000425753 HMOX1P09601 288 aa27.22■■□□□ 1.95
TSTA3-201ENST00000425753 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.22■■□□□ 1.95
TSTA3-201ENST00000425753 DDB1Q16531 1140 aa27.2■■□□□ 1.94
TSTA3-201ENST00000425753 MIER1Q8N108 512 aa27.19■■□□□ 1.94
TSTA3-201ENST00000425753 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
TSTA3-201ENST00000425753 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.18■■□□□ 1.94
TSTA3-201ENST00000425753 A0A0G2JS52 829 aa27.17■■□□□ 1.94
TSTA3-201ENST00000425753 EXOC5O00471 708 aa27.17■■□□□ 1.94
TSTA3-201ENST00000425753 MYT1Q01538 1121 aa27.17■■□□□ 1.94
TSTA3-201ENST00000425753 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.17■■□□□ 1.94
TSTA3-201ENST00000425753 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
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TSTA3-201ENST00000425753 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.15■■□□□ 1.94
TSTA3-201ENST00000425753 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.14■■□□□ 1.94
TSTA3-201ENST00000425753 BRWD3Q6RI45 1802 aa27.14■■□□□ 1.93
TSTA3-201ENST00000425753 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.13■■□□□ 1.93
TSTA3-201ENST00000425753 SPG7Q9UQ90 795 aa27.13■■□□□ 1.93
TSTA3-201ENST00000425753 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa27.13■■□□□ 1.93
TSTA3-201ENST00000425753 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27.13■■□□□ 1.93
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TSTA3-201ENST00000425753 KRT27Q7Z3Y8 459 aa27.12■■□□□ 1.93
TSTA3-201ENST00000425753 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
TSTA3-201ENST00000425753 BCL9O00512 1426 aa27.12■■□□□ 1.93
TSTA3-201ENST00000425753 PDE3BQ13370 1112 aa27.11■■□□□ 1.93
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TSTA3-201ENST00000425753 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.09■■□□□ 1.93
TSTA3-201ENST00000425753 EP400Q96L91 3159 aa27.08■■□□□ 1.93
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TSTA3-201ENST00000425753 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.06■■□□□ 1.92
TSTA3-201ENST00000425753 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
TSTA3-201ENST00000425753 IFNL2Q8IZJ0 200 aa27.05■■□□□ 1.92
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
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TSTA3-201ENST00000425753 RUNDC1Q96C34 613 aa27.04■■□□□ 1.92
TSTA3-201ENST00000425753 NEFMP07197 916 aa27.03■■□□□ 1.92
TSTA3-201ENST00000425753 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.03■■□□□ 1.92
TSTA3-201ENST00000425753 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.02■■□□□ 1.92
TSTA3-201ENST00000425753 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27■■□□□ 1.91
TSTA3-201ENST00000425753 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27■■□□□ 1.91
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TSTA3-201ENST00000425753 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.99■■□□□ 1.91
TSTA3-201ENST00000425753 MAP3K5Q99683 1374 aa26.98■■□□□ 1.91
TSTA3-201ENST00000425753 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
TSTA3-201ENST00000425753 NFE2L2Q16236 605 aa26.97■■□□□ 1.91
TSTA3-201ENST00000425753 FAM182BQ5T319 152 aa26.97■■□□□ 1.91
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TSTA3-201ENST00000425753 DCAF5Q96JK2 942 aa26.97■■□□□ 1.91
TSTA3-201ENST00000425753 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.95■■□□□ 1.9
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TSTA3-201ENST00000425753 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.92■■□□□ 1.9
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TSTA3-201ENST00000425753 SBF2Q86WG5 1849 aa26.91■■□□□ 1.9
TSTA3-201ENST00000425753 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.9■■□□□ 1.9
TSTA3-201ENST00000425753 APAF1O14727 1248 aa26.9■■□□□ 1.9
TSTA3-201ENST00000425753 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.9■■□□□ 1.9
TSTA3-201ENST00000425753 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.89■■□□□ 1.9
TSTA3-201ENST00000425753 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
TSTA3-201ENST00000425753 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.88■■□□□ 1.89
TSTA3-201ENST00000425753 RIPK4P57078 832 aa26.87■■□□□ 1.89
TSTA3-201ENST00000425753 IL17REQ8NFR9 667 aa26.87■■□□□ 1.89
TSTA3-201ENST00000425753 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
TSTA3-201ENST00000425753 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.86■■□□□ 1.89
TSTA3-201ENST00000425753 LGR6Q9HBX8 967 aa26.86■■□□□ 1.89
TSTA3-201ENST00000425753 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
TSTA3-201ENST00000425753 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.85■■□□□ 1.89
TSTA3-201ENST00000425753 KCNQ2O43526 872 aa26.84■■□□□ 1.89
TSTA3-201ENST00000425753 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
TSTA3-201ENST00000425753 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.84■■□□□ 1.89
TSTA3-201ENST00000425753 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
TSTA3-201ENST00000425753 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
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TSTA3-201ENST00000425753 NGEFQ8N5V2 710 aa26.84■■□□□ 1.89
TSTA3-201ENST00000425753 TRIM37O94972 964 aa26.83■■□□□ 1.88
TSTA3-201ENST00000425753 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.83■■□□□ 1.88
TSTA3-201ENST00000425753 ITGB4P16144 1822 aa26.82■■□□□ 1.88
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TSTA3-201ENST00000425753 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.81■■□□□ 1.88
TSTA3-201ENST00000425753 CCDC125Q86Z20 511 aa26.81■■□□□ 1.88
TSTA3-201ENST00000425753 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.81■■□□□ 1.88
TSTA3-201ENST00000425753 CABP4P57796 275 aa26.8■■□□□ 1.88
TSTA3-201ENST00000425753 DCTN1Q14203 1278 aa26.8■■□□□ 1.88
TSTA3-201ENST00000425753 NEUROD2Q15784 382 aa26.8■■□□□ 1.88
TSTA3-201ENST00000425753 PIGBQ92521 554 aa26.8■■□□□ 1.88
TSTA3-201ENST00000425753 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
TSTA3-201ENST00000425753 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
TSTA3-201ENST00000425753 BTAF1O14981 1849 aa26.78■■□□□ 1.88
TSTA3-201ENST00000425753 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.78■■□□□ 1.88
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