RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, human

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLR1A-204	ENST00000424089	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	LRRC37A3	O60309	1634 aa		13.12	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	CHD4	Q14839	1912 aa		13.11	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		13.11	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	SYT17	Q9BSW7	474 aa		13.11	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.11	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		13.11	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		13.1	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		13.09	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	WDR63	Q8IWG1	891 aa		13.09	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		13.09	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	STK32B	Q9NY57	414 aa		13.09	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		13.08	□□□□□ -0.31
POLR1A-204	ENST00000424089	PTGER2	P43116	358 aa		13.08	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		13.08	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		13.08	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	NLRP6	P59044	892 aa		13.07	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	GPR162	Q16538	588 aa		13.07	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	WWC1	Q8IX03	1113 aa		13.06	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	BCL9	O00512	1426 aa		13.05	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		13.05	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	CEP350	Q5VT06	3117 aa		13.05	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	SLIT3	O75094	1523 aa		13.05	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	13.05	□□□□□ -0.32	4e-6	■■■□□ 19.2
POLR1A-204	ENST00000424089	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.05	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		13.05	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	SLC15A2	Q16348	729 aa		13.04	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	TXNRD1	Q16881	649 aa		13.04	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	MTFR1L	Q9H019	292 aa		13.04	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	COL18A1	P39060	1754 aa		13.03	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		13.03	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	USP6	P35125	1406 aa		13.03	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	RGPD5	Q99666	1765 aa		13.02	□□□□□ -0.32
POLR1A-204	ENST00000424089	EXOC5	O00471	708 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	FCHSD2	O94868	740 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	PROM2	Q8N271	834 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	COG3	Q96JB2	828 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	ARX	Q96QS3	562 aa		13.02	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	UTRN	P46939	3433 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	KLHL34	Q8N239	644 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	PIK3C2A	O00443	1686 aa		13.01	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	IL16	Q14005	1332 aa		13	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		13	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	13	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		13	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		13	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		13	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	POLK	Q9UBT6	870 aa		13	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		12.99	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	NHS	Q6T4R5	1651 aa		12.99	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	NEFM	P07197	916 aa		12.99	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		12.99	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		12.99	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	AAMP	Q13685	434 aa		12.98	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	TNS2	Q63HR2	1409 aa		12.97	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	MAP3K5	Q99683	1374 aa		12.97	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		12.97	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	SOX12	O15370	315 aa		12.97	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	PDE3A	Q14432	1141 aa		12.97	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		12.97	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	ABCC6	O95255	1503 aa		12.97	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		12.96	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	NME9	Q86XW9	330 aa		12.96	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		12.96	□□□□□ -0.33
POLR1A-204	ENST00000424089	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		12.96	□□□□□ -0.34
POLR1A-204	ENST00000424089	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
POLR1A-204	ENST00000424089	NEUROD2	Q15784	382 aa		12.95	□□□□□ -0.34
POLR1A-204	ENST00000424089	CRBN	Q96SW2	442 aa		12.95	□□□□□ -0.34
POLR1A-204	ENST00000424089	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
POLR1A-204	ENST00000424089	BTAF1	O14981	1849 aa		12.95	□□□□□ -0.34
POLR1A-204	ENST00000424089	PLIN1	O60240	522 aa		12.94	□□□□□ -0.34
POLR1A-204	ENST00000424089	POLD1	P28340	1107 aa		12.94	□□□□□ -0.34
POLR1A-204	ENST00000424089	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		12.94	□□□□□ -0.34
POLR1A-204	ENST00000424089	PAPPA	Q13219	1627 aa		12.94	□□□□□ -0.34
POLR1A-204	ENST00000424089	MS4A1	P11836	297 aa		12.93	□□□□□ -0.34
POLR1A-204	ENST00000424089	IL13	P35225	146 aa		12.93	□□□□□ -0.34
POLR1A-204	ENST00000424089	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		12.93	□□□□□ -0.34
POLR1A-204	ENST00000424089	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		12.93	□□□□□ -0.34
POLR1A-204	ENST00000424089	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
POLR1A-204	ENST00000424089	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		12.93	□□□□□ -0.34
POLR1A-204	ENST00000424089	USP31	Q70CQ4	1352 aa		12.93	□□□□□ -0.34

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