RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421053.5

SEMA5B-204, Transcript of semaphorin 5B, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA5B, Length 716 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5B-204ENST00000421053 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SEMA5B-204ENST00000421053 TXNRD1Q16881 649 aa26.21■■□□□ 1.79
SEMA5B-204ENST00000421053 CASZ1Q86V15 1759 aa26.2■■□□□ 1.79
SEMA5B-204ENST00000421053 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
SEMA5B-204ENST00000421053 NBPF14Q5TI25 921 aa26.19■■□□□ 1.78
SEMA5B-204ENST00000421053 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.18■■□□□ 1.78
SEMA5B-204ENST00000421053 PAPPAQ13219 1627 aa26.17■■□□□ 1.78
SEMA5B-204ENST00000421053 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
SEMA5B-204ENST00000421053 NSD2O96028 1365 aa26.17■■□□□ 1.78
SEMA5B-204ENST00000421053 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
SEMA5B-204ENST00000421053 POLKQ9UBT6 870 aa26.16■■□□□ 1.78
SEMA5B-204ENST00000421053 KCNQ4P56696 695 aa26.14■■□□□ 1.78
SEMA5B-204ENST00000421053 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SEMA5B-204ENST00000421053 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.13■■□□□ 1.77
SEMA5B-204ENST00000421053 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.13■■□□□ 1.77
SEMA5B-204ENST00000421053 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.13■■□□□ 1.77
SEMA5B-204ENST00000421053 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.12■■□□□ 1.77
SEMA5B-204ENST00000421053 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
SEMA5B-204ENST00000421053 NCAPD2Q15021 1401 aa26.11■■□□□ 1.77
SEMA5B-204ENST00000421053 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.11■■□□□ 1.77
SEMA5B-204ENST00000421053 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.1■■□□□ 1.77
SEMA5B-204ENST00000421053 ZNF827Q17R98 1081 aa26.09■■□□□ 1.77
SEMA5B-204ENST00000421053 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.09■■□□□ 1.77
SEMA5B-204ENST00000421053 EYA1Q99502 592 aa26.09■■□□□ 1.77
SEMA5B-204ENST00000421053 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
SEMA5B-204ENST00000421053 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.07■■□□□ 1.76
SEMA5B-204ENST00000421053 CYP27B1O15528 508 aa26.07■■□□□ 1.76
SEMA5B-204ENST00000421053 ZBTB7AO95365 584 aa26.07■■□□□ 1.76
SEMA5B-204ENST00000421053 LY75O60449 1722 aa26.07■■□□□ 1.76
SEMA5B-204ENST00000421053 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SEMA5B-204ENST00000421053 SLC15A2Q16348 729 aa26.06■■□□□ 1.76
SEMA5B-204ENST00000421053 STK32BQ9NY57 414 aa26.05■■□□□ 1.76
SEMA5B-204ENST00000421053 ITGB4P16144 1822 aa26.04■■□□□ 1.76
SEMA5B-204ENST00000421053 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SEMA5B-204ENST00000421053 SPON1Q9HCB6 807 aa26.01■■□□□ 1.75
SEMA5B-204ENST00000421053 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26■■□□□ 1.75
SEMA5B-204ENST00000421053 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26■■□□□ 1.75
SEMA5B-204ENST00000421053 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SEMA5B-204ENST00000421053 MORC1Q86VD1 984 aa25.99■■□□□ 1.75
SEMA5B-204ENST00000421053 PTGER2P43116 358 aa25.97■■□□□ 1.75
SEMA5B-204ENST00000421053 AKT1S1Q96B36 256 aa25.97■■□□□ 1.75
SEMA5B-204ENST00000421053 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.95■■□□□ 1.74
SEMA5B-204ENST00000421053 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.94■■□□□ 1.74
SEMA5B-204ENST00000421053 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.94■■□□□ 1.74
SEMA5B-204ENST00000421053 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.94■■□□□ 1.74
SEMA5B-204ENST00000421053 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SEMA5B-204ENST00000421053 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SEMA5B-204ENST00000421053 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.93■■□□□ 1.74
SEMA5B-204ENST00000421053 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SEMA5B-204ENST00000421053 C5P01031 1676 aa25.92■■□□□ 1.74
SEMA5B-204ENST00000421053 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.91■■□□□ 1.74
SEMA5B-204ENST00000421053 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.91■■□□□ 1.74
SEMA5B-204ENST00000421053 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.91■■□□□ 1.74
SEMA5B-204ENST00000421053 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SEMA5B-204ENST00000421053 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SEMA5B-204ENST00000421053 PIGBQ92521 554 aa25.9■■□□□ 1.74
SEMA5B-204ENST00000421053 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.9■■□□□ 1.74
SEMA5B-204ENST00000421053 PHKG2P15735 406 aa25.89■■□□□ 1.74
SEMA5B-204ENST00000421053 PALLDQ8WX93 1383 aa25.89■■□□□ 1.74
SEMA5B-204ENST00000421053 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SEMA5B-204ENST00000421053 SMIM5Q71RC9 77 aa25.88■■□□□ 1.73
SEMA5B-204ENST00000421053 SPG7Q9UQ90 795 aa25.88■■□□□ 1.73
SEMA5B-204ENST00000421053 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.86■■□□□ 1.73
SEMA5B-204ENST00000421053 MTFR1LQ9H019 292 aa25.86■■□□□ 1.73
SEMA5B-204ENST00000421053 IL13P35225 146 aa25.85■■□□□ 1.73
SEMA5B-204ENST00000421053 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.84■■□□□ 1.73
SEMA5B-204ENST00000421053 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.83■■□□□ 1.73
SEMA5B-204ENST00000421053 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SEMA5B-204ENST00000421053 MTHFSP49914 203 aa25.83■■□□□ 1.73
SEMA5B-204ENST00000421053 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.83■■□□□ 1.73
SEMA5B-204ENST00000421053 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.82■■□□□ 1.72
SEMA5B-204ENST00000421053 C4BP0C0L5 1744 aa25.82■■□□□ 1.72
SEMA5B-204ENST00000421053 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.81■■□□□ 1.72
SEMA5B-204ENST00000421053 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.81■■□□□ 1.72
SEMA5B-204ENST00000421053 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
SEMA5B-204ENST00000421053 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
SEMA5B-204ENST00000421053 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
SEMA5B-204ENST00000421053 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.78■■□□□ 1.72
SEMA5B-204ENST00000421053 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.77■■□□□ 1.72
SEMA5B-204ENST00000421053 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
SEMA5B-204ENST00000421053 HMOX1P09601 288 aa25.76■■□□□ 1.71
SEMA5B-204ENST00000421053 ITPK1Q13572 414 aa25.76■■□□□ 1.71
SEMA5B-204ENST00000421053 MSL1Q68DK7 614 aa25.76■■□□□ 1.71
SEMA5B-204ENST00000421053 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.76■■□□□ 1.71
SEMA5B-204ENST00000421053 ATG3Q9NT62 314 aa25.76■■□□□ 1.71
SEMA5B-204ENST00000421053 KDRP35968 1356 aa25.76■■□□□ 1.71
SEMA5B-204ENST00000421053 ARXQ96QS3 562 aa25.75■■□□□ 1.71
SEMA5B-204ENST00000421053 SYT17Q9BSW7 474 aa25.75■■□□□ 1.71
SEMA5B-204ENST00000421053 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
SEMA5B-204ENST00000421053 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.74■■□□□ 1.71
SEMA5B-204ENST00000421053 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.73■■□□□ 1.71
SEMA5B-204ENST00000421053 MSH5O43196 834 aa25.73■■□□□ 1.71
SEMA5B-204ENST00000421053 SIK1P57059 783 aa25.73■■□□□ 1.71
SEMA5B-204ENST00000421053 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
SEMA5B-204ENST00000421053 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
SEMA5B-204ENST00000421053 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.71■■□□□ 1.71
SEMA5B-204ENST00000421053 PHF14O94880 888 aa25.7■■□□□ 1.7
SEMA5B-204ENST00000421053 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.69■■□□□ 1.7
SEMA5B-204ENST00000421053 KLHL34Q8N239 644 aa25.69■■□□□ 1.7
SEMA5B-204ENST00000421053 UTRNP46939 3433 aa25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms