RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 ERBB3P21860 1342 aa27.07■■□□□ 1.92
GPC1-202ENST00000420138 COL18A1P39060 1754 aa27.07■■□□□ 1.92
GPC1-202ENST00000420138 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.07■■□□□ 1.92
GPC1-202ENST00000420138 CPDO75976 1380 aa27.07■■□□□ 1.92
GPC1-202ENST00000420138 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
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GPC1-202ENST00000420138 CERKQ8TCT0 537 aa27.05■■□□□ 1.92
GPC1-202ENST00000420138 SSH1Q8WYL5 1049 aa27.05■■□□□ 1.92
GPC1-202ENST00000420138 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.05■■□□□ 1.92
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GPC1-202ENST00000420138 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
GPC1-202ENST00000420138 PDE3AQ14432 1141 aa27.04■■□□□ 1.92
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GPC1-202ENST00000420138 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.03■■□□□ 1.92
GPC1-202ENST00000420138 TSPYL6Q8N831 410 aa27.03■■□□□ 1.92
GPC1-202ENST00000420138 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
GPC1-202ENST00000420138 VAMP4O75379 141 aa27.02■■□□□ 1.92
GPC1-202ENST00000420138 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
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GPC1-202ENST00000420138 CHRNA2Q15822 529 aa27■■□□□ 1.91
GPC1-202ENST00000420138 TNNQ9UQP3 1299 aa27■■□□□ 1.91
GPC1-202ENST00000420138 C8orf58Q8NAV2 365 aa27■■□□□ 1.91
GPC1-202ENST00000420138 SMC4Q9NTJ3 1288 aa27■■□□□ 1.91
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GPC1-202ENST00000420138 IL17REQ8NFR9 667 aa26.99■■□□□ 1.91
GPC1-202ENST00000420138 ZNF428Q96B54 188 aa26.99■■□□□ 1.91
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GPC1-202ENST00000420138 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.96■■□□□ 1.91
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GPC1-202ENST00000420138 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.93■■□□□ 1.9
GPC1-202ENST00000420138 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.93■■□□□ 1.9
GPC1-202ENST00000420138 KRT24Q2M2I5 525 aa26.93■■□□□ 1.9
GPC1-202ENST00000420138 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.93■■□□□ 1.9
GPC1-202ENST00000420138 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
GPC1-202ENST00000420138 COG6Q9Y2V7 657 aa26.93■■□□□ 1.9
GPC1-202ENST00000420138 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
GPC1-202ENST00000420138 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.91■■□□□ 1.9
GPC1-202ENST00000420138 TRIM27P14373 513 aa26.9■■□□□ 1.9
GPC1-202ENST00000420138 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
GPC1-202ENST00000420138 KIF16BQ96L93 1317 aa26.89■■□□□ 1.9
GPC1-202ENST00000420138 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.89■■□□□ 1.9
GPC1-202ENST00000420138 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.89■■□□□ 1.9
GPC1-202ENST00000420138 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.89■■□□□ 1.9
GPC1-202ENST00000420138 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
GPC1-202ENST00000420138 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.88■■□□□ 1.89
GPC1-202ENST00000420138 LGR6Q9HBX8 967 aa26.88■■□□□ 1.89
GPC1-202ENST00000420138 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.87■■□□□ 1.89
GPC1-202ENST00000420138 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
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GPC1-202ENST00000420138 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
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GPC1-202ENST00000420138 MEGF6O75095 1541 aa26.85■■□□□ 1.89
GPC1-202ENST00000420138 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
GPC1-202ENST00000420138 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
GPC1-202ENST00000420138 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.83■■□□□ 1.89
GPC1-202ENST00000420138 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
GPC1-202ENST00000420138 MS4A1P11836 297 aa26.83■■□□□ 1.89
GPC1-202ENST00000420138 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
GPC1-202ENST00000420138 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.83■■□□□ 1.89
GPC1-202ENST00000420138 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.82■■□□□ 1.88
GPC1-202ENST00000420138 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.82■■□□□ 1.88
GPC1-202ENST00000420138 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.81■■□□□ 1.88
GPC1-202ENST00000420138 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.81■■□□□ 1.88
GPC1-202ENST00000420138 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
GPC1-202ENST00000420138 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
GPC1-202ENST00000420138 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
GPC1-202ENST00000420138 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.8■■□□□ 1.88
GPC1-202ENST00000420138 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.8■■□□□ 1.88
GPC1-202ENST00000420138 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.8■■□□□ 1.88
GPC1-202ENST00000420138 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.79■■□□□ 1.88
GPC1-202ENST00000420138 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
GPC1-202ENST00000420138 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.78■■□□□ 1.88
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GPC1-202ENST00000420138 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.77■■□□□ 1.88
GPC1-202ENST00000420138 JCADQ9P266 1359 aa26.77■■□□□ 1.88
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GPC1-202ENST00000420138 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
GPC1-202ENST00000420138 EVA1CP58658 441 aa26.76■■□□□ 1.87
GPC1-202ENST00000420138 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.76■■□□□ 1.87
GPC1-202ENST00000420138 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
GPC1-202ENST00000420138 STRN4Q9NRL3 753 aa26.76■■□□□ 1.87
GPC1-202ENST00000420138 BTG4Q9NY30 223 aa26.76■■□□□ 1.87
GPC1-202ENST00000420138 ADAMTS2O95450 1211 aa26.75■■□□□ 1.87
GPC1-202ENST00000420138 PHKG2P15735 406 aa26.74■■□□□ 1.87
GPC1-202ENST00000420138 SPG7Q9UQ90 795 aa26.74■■□□□ 1.87
GPC1-202ENST00000420138 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
GPC1-202ENST00000420138 TEFQ10587 303 aa26.73■■□□□ 1.87
GPC1-202ENST00000420138 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
GPC1-202ENST00000420138 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.73■■□□□ 1.87
GPC1-202ENST00000420138 ABCC4O15439 1325 aa26.73■■□□□ 1.87
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