RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419593.5

SYS1-DBNDD2-201, Transcript of SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene SYS1-DBNDD2, Length 1,313 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.94■■□□□ 1.26
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SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.92■■□□□ 1.26
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SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ITGB4P16144 1822 aa22.8■■□□□ 1.24
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SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ATP10DQ9P241 1426 aa22.73■■□□□ 1.23
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.73■■□□□ 1.23
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 POLKQ9UBT6 870 aa22.73■■□□□ 1.23
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.72■■□□□ 1.23
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 PHKG2P15735 406 aa22.71■■□□□ 1.23
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ITPK1Q13572 414 aa22.71■■□□□ 1.23
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.7■■□□□ 1.23
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.7■■□□□ 1.22
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ATP6V1AP38606 617 aa22.7■■□□□ 1.22
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.7■■□□□ 1.22
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.7■■□□□ 1.22
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 GNPATO15228 680 aa22.69■■□□□ 1.22
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
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