RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
PKDCC-202ENST00000401498 ANP32CO43423 234 aa40.39■■■■■ 4.06
PKDCC-202ENST00000401498 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
PKDCC-202ENST00000401498 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
PKDCC-202ENST00000401498 HMOX1P09601 288 aa40.36■■■■■ 4.05
PKDCC-202ENST00000401498 NUDCQ9Y266 331 aa40.35■■■■■ 4.05
PKDCC-202ENST00000401498 PKD1L3Q7Z443 1732 aa40.35■■■■■ 4.05
PKDCC-202ENST00000401498 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
PKDCC-202ENST00000401498 FAM196AQ6ZSG2 479 aa40.3■■■■■ 4.04
PKDCC-202ENST00000401498 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP40.28■■■■■ 4.04
PKDCC-202ENST00000401498 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa40.28■■■■■ 4.04
PKDCC-202ENST00000401498 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
PKDCC-202ENST00000401498 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP40.27■■■■■ 4.04
PKDCC-202ENST00000401498 SPG7Q9UQ90 795 aa40.26■■■■■ 4.04
PKDCC-202ENST00000401498 SOCS7O14512 581 aa40.25■■■■■ 4.03
PKDCC-202ENST00000401498 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa40.24■■■■■ 4.03
PKDCC-202ENST00000401498 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa40.24■■■■■ 4.03
PKDCC-202ENST00000401498 CYP27B1O15528 508 aa40.23■■■■■ 4.03
PKDCC-202ENST00000401498 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP40.23■■■■■ 4.03
PKDCC-202ENST00000401498 BCL9O00512 1426 aa40.23■■■■■ 4.03
PKDCC-202ENST00000401498 SBF2Q86WG5 1849 aa40.23■■■■■ 4.03
PKDCC-202ENST00000401498 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
PKDCC-202ENST00000401498 RSPH6AQ9H0K4 717 aa40.21■■■■■ 4.03
PKDCC-202ENST00000401498 AMOTQ4VCS5 1084 aa40.19■■■■■ 4.02
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC184Q52MB2 194 aa40.19■■■■■ 4.02
PKDCC-202ENST00000401498 FCHSD2O94868 740 aa40.17■■■■■ 4.02
PKDCC-202ENST00000401498 PRKAR2BP31323 418 aa40.15■■■■■ 4.02
PKDCC-202ENST00000401498 TRIM37O94972 964 aa40.14■■■■■ 4.02
PKDCC-202ENST00000401498 PHKG2P15735 406 aa40.14■■■■■ 4.02
PKDCC-202ENST00000401498 IFNL2Q8IZJ0 200 aa40.14■■■■■ 4.02
PKDCC-202ENST00000401498 KAT6BQ8WYB5 2073 aa40.13■■■■■ 4.01
PKDCC-202ENST00000401498 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
PKDCC-202ENST00000401498 PHACTR3Q96KR7 559 aa40.11■■■■■ 4.01
PKDCC-202ENST00000401498 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
PKDCC-202ENST00000401498 ACSBG1Q96GR2 724 aa40.1■■■■■ 4.01
PKDCC-202ENST00000401498 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC125Q86Z20 511 aa40.1■■■■■ 4.01
PKDCC-202ENST00000401498 DOT1LQ8TEK3 1739 aa40.1■■■■■ 4.01
PKDCC-202ENST00000401498 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
PKDCC-202ENST00000401498 PTF1AQ7RTS3 328 aa40.09■■■■■ 4.01
PKDCC-202ENST00000401498 NHSQ6T4R5 1651 aa40.07■■■■■ 4.01
PKDCC-202ENST00000401498 KCNQ2O43526 872 aa40.07■■■■■ 4.01
PKDCC-202ENST00000401498 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP40.06■■■■■ 4
PKDCC-202ENST00000401498 PLEKHF1Q96S99 279 aa40.05■■■■■ 4
PKDCC-202ENST00000401498 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa40.05■■■■■ 4
PKDCC-202ENST00000401498 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
PKDCC-202ENST00000401498 MRS2Q9HD23 443 aa40.04■■■■■ 4
PKDCC-202ENST00000401498 C1orf141Q5JVX7 400 aa40.03■■■■■ 4
PKDCC-202ENST00000401498 ADAMTS8Q9UP79 889 aa40.03■■■■■ 4
PKDCC-202ENST00000401498 AKAP4Q5JQC9 854 aa40.01■■■■■ 4
PKDCC-202ENST00000401498 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP40.01■■■■□ 3.99
PKDCC-202ENST00000401498 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP40.01■■■■□ 3.99
PKDCC-202ENST00000401498 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
PKDCC-202ENST00000401498 GAS2L2Q8NHY3 880 aa39.99■■■■□ 3.99
PKDCC-202ENST00000401498 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
PKDCC-202ENST00000401498 ITGB4P16144 1822 aa39.98■■■■□ 3.99
PKDCC-202ENST00000401498 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
PKDCC-202ENST00000401498 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
PKDCC-202ENST00000401498 DCAF5Q96JK2 942 aa39.97■■■■□ 3.99
PKDCC-202ENST00000401498 APBA3O96018 575 aa39.96■■■■□ 3.99
PKDCC-202ENST00000401498 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa39.96■■■■□ 3.99
PKDCC-202ENST00000401498 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
PKDCC-202ENST00000401498 BTAF1O14981 1849 aa39.96■■■■□ 3.99
PKDCC-202ENST00000401498 DEFB132Q7Z7B7 95 aa39.94■■■■□ 3.98
PKDCC-202ENST00000401498 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
PKDCC-202ENST00000401498 SCN11AQ9UI33 1791 aa39.94■■■■□ 3.98
PKDCC-202ENST00000401498 NEFMP07197 916 aa39.93■■■■□ 3.98
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC146Q8IYE0 955 aa39.91■■■■□ 3.98
PKDCC-202ENST00000401498 MAP3K5Q99683 1374 aa39.9■■■■□ 3.98
PKDCC-202ENST00000401498 BAG6P46379 1132 aa39.9■■■■□ 3.98
PKDCC-202ENST00000401498 LGR6Q9HBX8 967 aa39.9■■■■□ 3.98
PKDCC-202ENST00000401498 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa39.9■■■■□ 3.98
PKDCC-202ENST00000401498 GNAT3A8MTJ3 354 aa39.89■■■■□ 3.98
PKDCC-202ENST00000401498 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa39.89■■■■□ 3.98
PKDCC-202ENST00000401498 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
PKDCC-202ENST00000401498 ERVV-2B6SEH9 535 aa39.88■■■■□ 3.97
PKDCC-202ENST00000401498 DLG5Q8TDM6 1919 aa39.88■■■■□ 3.97
PKDCC-202ENST00000401498 RNMTO43148 476 aaKnown RBP39.86■■■■□ 3.97
PKDCC-202ENST00000401498 RUNDC1Q96C34 613 aa39.86■■■■□ 3.97
PKDCC-202ENST00000401498 PIGBQ92521 554 aa39.85■■■■□ 3.97
PKDCC-202ENST00000401498 PLSCR1O15162 318 aa39.84■■■■□ 3.97
PKDCC-202ENST00000401498 NFE2L2Q16236 605 aa39.84■■■■□ 3.97
PKDCC-202ENST00000401498 MIER1Q8N108 512 aa39.84■■■■□ 3.97
PKDCC-202ENST00000401498 CAMKK2Q96RR4 588 aa39.84■■■■□ 3.97
PKDCC-202ENST00000401498 TMOD3Q9NYL9 352 aa39.84■■■■□ 3.97
PKDCC-202ENST00000401498 IL17REQ8NFR9 667 aa39.83■■■■□ 3.97
PKDCC-202ENST00000401498 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
PKDCC-202ENST00000401498 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa39.81■■■■□ 3.96
PKDCC-202ENST00000401498 CCER2I3L3R5 266 aa39.81■■■■□ 3.96
PKDCC-202ENST00000401498 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
PKDCC-202ENST00000401498 CABP4P57796 275 aa39.8■■■■□ 3.96
PKDCC-202ENST00000401498 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa39.79■■■■□ 3.96
PKDCC-202ENST00000401498 MRC1P22897 1456 aa39.77■■■■□ 3.96
PKDCC-202ENST00000401498 TMPOP42166 694 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
PKDCC-202ENST00000401498 SLC52A2Q9HAB3 445 aa39.77■■■■□ 3.96
PKDCC-202ENST00000401498 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa39.76■■■■□ 3.96
PKDCC-202ENST00000401498 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.95
PKDCC-202ENST00000401498 MCM10Q7L590 875 aa39.75■■■■□ 3.95
PKDCC-202ENST00000401498 PROM2Q8N271 834 aa39.75■■■■□ 3.95
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