RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394450.6

PRELID2-202, Transcript of PRELI domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRELID2, Length 1,102 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID2-202ENST00000394450 USHBP1Q8N6Y0 703 aa40.7■■■■■ 4.11
PRELID2-202ENST00000394450 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
PRELID2-202ENST00000394450 MEGF6O75095 1541 aa40.68■■■■■ 4.1
PRELID2-202ENST00000394450 TATP17735 454 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
PRELID2-202ENST00000394450 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
PRELID2-202ENST00000394450 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa40.68■■■■■ 4.1
PRELID2-202ENST00000394450 SLC15A2Q16348 729 aa40.66■■■■■ 4.1
PRELID2-202ENST00000394450 BTAF1O14981 1849 aa40.65■■■■■ 4.1
PRELID2-202ENST00000394450 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
PRELID2-202ENST00000394450 PANK3Q9H999 370 aa40.59■■■■■ 4.09
PRELID2-202ENST00000394450 SLC27A3Q5K4L6 730 aa40.56■■■■■ 4.08
PRELID2-202ENST00000394450 WASHC2AQ641Q2 1341 aa40.56■■■■■ 4.08
PRELID2-202ENST00000394450 ZBTB7AO95365 584 aa40.55■■■■■ 4.08
PRELID2-202ENST00000394450 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
PRELID2-202ENST00000394450 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa40.55■■■■■ 4.08
PRELID2-202ENST00000394450 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa40.55■■■■■ 4.08
PRELID2-202ENST00000394450 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
PRELID2-202ENST00000394450 CASZ1Q86V15 1759 aa40.53■■■■■ 4.08
PRELID2-202ENST00000394450 POLKQ9UBT6 870 aa40.52■■■■■ 4.08
PRELID2-202ENST00000394450 SHANK3Q9BYB0 1731 aa40.52■■■■■ 4.08
PRELID2-202ENST00000394450 DOT1LQ8TEK3 1739 aa40.51■■■■■ 4.08
PRELID2-202ENST00000394450 LRRC4BQ9NT99 713 aa40.5■■■■■ 4.07
PRELID2-202ENST00000394450 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
PRELID2-202ENST00000394450 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
PRELID2-202ENST00000394450 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa40.47■■■■■ 4.07
PRELID2-202ENST00000394450 NSD2O96028 1365 aa40.46■■■■■ 4.07
PRELID2-202ENST00000394450 MTFR1LQ9H019 292 aa40.45■■■■■ 4.07
PRELID2-202ENST00000394450 SPG7Q9UQ90 795 aa40.44■■■■■ 4.06
PRELID2-202ENST00000394450 PAPPAQ13219 1627 aa40.44■■■■■ 4.06
PRELID2-202ENST00000394450 EYA1Q99502 592 aa40.43■■■■■ 4.06
PRELID2-202ENST00000394450 DCAF8L1A6NGE4 600 aa40.42■■■■■ 4.06
PRELID2-202ENST00000394450 ZNF827Q17R98 1081 aa40.42■■■■■ 4.06
PRELID2-202ENST00000394450 KNSTRNQ9Y448 316 aa40.41■■■■■ 4.06
PRELID2-202ENST00000394450 MORC1Q86VD1 984 aa40.4■■■■■ 4.06
PRELID2-202ENST00000394450 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
PRELID2-202ENST00000394450 CYP27B1O15528 508 aa40.39■■■■■ 4.06
PRELID2-202ENST00000394450 NCAPD2Q15021 1401 aa40.39■■■■■ 4.06
PRELID2-202ENST00000394450 AKT1S1Q96B36 256 aa40.38■■■■■ 4.05
PRELID2-202ENST00000394450 PTGER2P43116 358 aa40.37■■■■■ 4.05
PRELID2-202ENST00000394450 KCNQ4P56696 695 aa40.37■■■■■ 4.05
PRELID2-202ENST00000394450 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
PRELID2-202ENST00000394450 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa40.36■■■■■ 4.05
PRELID2-202ENST00000394450 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa40.36■■■■■ 4.05
PRELID2-202ENST00000394450 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
PRELID2-202ENST00000394450 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP40.35■■■■■ 4.055e-8■□□□□ 9.6
PRELID2-202ENST00000394450 LY75O60449 1722 aa40.31■■■■■ 4.04
PRELID2-202ENST00000394450 PKD1L3Q7Z443 1732 aa40.31■■■■■ 4.04
PRELID2-202ENST00000394450 SLC16A10Q8TF71 515 aa40.3■■■■■ 4.04
PRELID2-202ENST00000394450 KIF7Q2M1P5 1343 aa40.3■■■■■ 4.04
PRELID2-202ENST00000394450 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
PRELID2-202ENST00000394450 IFNL2Q8IZJ0 200 aa40.27■■■■■ 4.04
PRELID2-202ENST00000394450 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
PRELID2-202ENST00000394450 PALLDQ8WX93 1383 aa40.25■■■■■ 4.03
PRELID2-202ENST00000394450 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa40.25■■■■■ 4.03
PRELID2-202ENST00000394450 ARXQ96QS3 562 aa40.24■■■■■ 4.03
PRELID2-202ENST00000394450 SGIP1Q9BQI5 828 aa40.24■■■■■ 4.03
PRELID2-202ENST00000394450 IGSF1Q8N6C5 1336 aa40.23■■■■■ 4.03
PRELID2-202ENST00000394450 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
PRELID2-202ENST00000394450 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa40.22■■■■■ 4.03
PRELID2-202ENST00000394450 PHKG2P15735 406 aa40.21■■■■■ 4.03
PRELID2-202ENST00000394450 QSER1Q2KHR3 1735 aa40.21■■■■■ 4.03
PRELID2-202ENST00000394450 POLD1P28340 1107 aa40.2■■■■■ 4.03
PRELID2-202ENST00000394450 PIGBQ92521 554 aa40.2■■■■■ 4.03
PRELID2-202ENST00000394450 TMOD3Q9NYL9 352 aa40.2■■■■■ 4.03
PRELID2-202ENST00000394450 MSH5O43196 834 aa40.19■■■■■ 4.02
PRELID2-202ENST00000394450 SYT17Q9BSW7 474 aa40.18■■■■■ 4.02
PRELID2-202ENST00000394450 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
PRELID2-202ENST00000394450 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa40.16■■■■■ 4.02
PRELID2-202ENST00000394450 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
PRELID2-202ENST00000394450 ITGB4P16144 1822 aa40.16■■■■■ 4.02
PRELID2-202ENST00000394450 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
PRELID2-202ENST00000394450 AMOTQ4VCS5 1084 aa40.12■■■■■ 4.01
PRELID2-202ENST00000394450 FLAD1Q8NFF5 587 aa40.1■■■■■ 4.01
PRELID2-202ENST00000394450 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP40.09■■■■■ 4.01
PRELID2-202ENST00000394450 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa40.09■■■■■ 4.01
PRELID2-202ENST00000394450 C5P01031 1676 aa40.08■■■■■ 4.01
PRELID2-202ENST00000394450 YY1P25490 414 aa40.08■■■■■ 4.01
PRELID2-202ENST00000394450 AK7Q96M32 723 aa40.08■■■■■ 4.01
PRELID2-202ENST00000394450 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
PRELID2-202ENST00000394450 KLHL34Q8N239 644 aa40.07■■■■■ 4.01
PRELID2-202ENST00000394450 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa40.06■■■■■ 4
PRELID2-202ENST00000394450 SIK1P57059 783 aa40.06■■■■■ 4
PRELID2-202ENST00000394450 SULT6B1Q6IMI4 303 aa40.06■■■■■ 4
PRELID2-202ENST00000394450 DCAF5Q96JK2 942 aa40.06■■■■■ 4
PRELID2-202ENST00000394450 MAP3K5Q99683 1374 aa40.05■■■■■ 4
PRELID2-202ENST00000394450 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
PRELID2-202ENST00000394450 IL13P35225 146 aa40.04■■■■■ 4
PRELID2-202ENST00000394450 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
PRELID2-202ENST00000394450 AEBP1Q8IUX7 1158 aa40.04■■■■■ 4
PRELID2-202ENST00000394450 ASAP1Q9ULH1 1129 aa40.04■■■■■ 4
PRELID2-202ENST00000394450 ERVV-2B6SEH9 535 aa40.03■■■■■ 4
PRELID2-202ENST00000394450 MTHFSP49914 203 aa40.03■■■■■ 4
PRELID2-202ENST00000394450 C1orf141Q5JVX7 400 aa40.03■■■■■ 4
PRELID2-202ENST00000394450 TAF1LQ8IZX4 1826 aa40■■■■□ 3.99
PRELID2-202ENST00000394450 ATG3Q9NT62 314 aa39.99■■■■□ 3.99
PRELID2-202ENST00000394450 ATP6V1AP38606 617 aa39.98■■■■□ 3.99
PRELID2-202ENST00000394450 C4BP0C0L5 1744 aa39.98■■■■□ 3.99
PRELID2-202ENST00000394450 CABP4P57796 275 aa39.97■■■■□ 3.99
PRELID2-202ENST00000394450 COL24A1Q17RW2 1714 aa39.96■■■■□ 3.99
PRELID2-202ENST00000394450 KDRP35968 1356 aa39.96■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms